[發(fā)明專利]檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010180609.3 | 申請日: | 2010-05-21 |
| 公開(公告)號: | CN101838699A | 公開(公告)日: | 2010-09-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 郭玉芬;王艷莉 | 申請(專利權(quán))人: | 蘭州大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 蘭州中科華西專利代理有限公司 62002 | 代理人: | 李艷華 |
| 地址: | 730000 *** | 國省代碼: | 甘肅;62 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 檢測 slc26a4 基因 2006 突變 試劑盒 | ||
1.一種檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒,包括
——針對SLC26A4基因或SLC26A4基因編碼區(qū)第2006位堿基附近設(shè)計的PCR引物;
——PCR反應(yīng)試劑;
——檢測PCR擴增產(chǎn)物的試劑。
2.如權(quán)利要求1所述的檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒,其特征在于:所述PCR引物為15~30個堿基,GC含量為45~50%。
3.如權(quán)利要求2所述的檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒,其特征在于:所述PCR引物中
上游引物為SLC26A4-17F:5’-TCTTCGTTTAGAATGGCATCA-3’
下游引物為SLC26A4-17R:5’-ATTGCCAAAGCTCCAAATGT-3’。
4.如權(quán)利要求1所述的檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒,其特征在于:所述PCR反應(yīng)試劑為2.5μl、含15ml?MgCl2的10×PCR緩沖液,2.0μl、2.5mM的dNTP,0.3μl、5U/μl的耐熱聚合酶,0.25μl熒光染料。
5.如權(quán)利要求1所述的檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒,其特征在于:所述檢測PCR擴增產(chǎn)物的試劑為測序檢測試劑、限制性內(nèi)切酶酶切檢測試劑、限制性長度多態(tài)性檢測試劑、序列特異性引物檢測試劑或雜交探針檢測試劑中的任意一種。
6.如權(quán)利要求1所述的檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒在檢測前庭導(dǎo)水管擴大相關(guān)的位于SLC26A4基因的2006位突變中的應(yīng)用,包括以下步驟:
(1)采集待測個體的血液、體液或組織樣本,提取基因組DNA;
(2)以所述DNA為模板,采用所述PCR引物進行PCR反應(yīng),得到PCR擴增產(chǎn)物:
SLC26A4-17F:5’-TCTTCGTTTAGAATGGCATCA-3’
SLC26A4-17R:5’-ATTGCCAAAGCTCCAAATGT-3’;
(3)將所述PCR擴增產(chǎn)物純化后進行直接測序,并將測序結(jié)果與SLC26A4基因標(biāo)準(zhǔn)序列進行比較,確定是否存在SLC26A4基因的c.2006A>T突變位點;
(4)判斷待測個體是否為SLC26A4基因突變c.2006A>T導(dǎo)致的前庭導(dǎo)水管擴大。
7.如權(quán)利要求6所述的檢測SLC26A4基因c.2006A>T突變的試劑盒在檢測前庭導(dǎo)水管擴大相關(guān)的位于SLC26A4基因的2006位突變中的應(yīng)用,其特征在于:該應(yīng)用還包括按照正常閱讀框架進行翻譯以確定c.2006A>T突變,使得位于Pendrin羧基端的第669位氨基酸由天冬氨酸變?yōu)槔i氨酸。
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