[發(fā)明專利]一種HPA等位基因分型檢測試劑盒無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010170627.3 | 申請日: | 2010-05-11 |
| 公開(公告)號: | CN101845520A | 公開(公告)日: | 2010-09-29 |
| 發(fā)明(設計)人: | 馮明亮;沈彤;劉達莊;趙玉林;劉熔增 | 申請(專利權)人: | 上海市血液中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 上海光華專利事務所 31219 | 代理人: | 許亦琳;余明偉 |
| 地址: | 200051 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 hpa 等位基因 檢測 試劑盒 | ||
技術領域
本發(fā)明屬于生物技術領域,具體涉及一種HPA等位基因分型檢測試劑盒。
背景技術
血小板是無核的血細胞,血小板的功能主要是促進止血和加速凝血,同時血小板還有維護毛細血管壁完整性的功能。血小板在止血和凝血過程中,具有形成血栓,阻塞創(chuàng)口,釋放和凝血有關的各種因子等功能。在血液快速流動的動脈和小動脈系統(tǒng)形成血栓的過程中,血小板起著核心作用。
血小板膜含有多種蛋白質,這些蛋白質連接有大量的碳水化合物支鏈而成為糖蛋白。血小板糖蛋白不僅對維持血小板形態(tài)和完整性非常重要,同時構成了血小板的各種受體,使血小板發(fā)揮止血及有關的功能。血小板糖蛋白基因發(fā)生變異時,可改變血小板糖蛋白結構和表達水平,進而影響血小板的黏附、聚集和血栓形成。
隨著分子生物學和單克隆抗體技術的發(fā)展,許多血小板糖蛋白的基因序列已得到證實,并使得對血小板糖蛋白多態(tài)性的深入研究成為可能。此后,在關于血小板糖蛋白的生物化學本質、功能及其分子生物學研究方面取得了巨大進步。血小板糖蛋白基因上存在人類血小板同種異型抗原系統(tǒng)(human?platelet?alloantigen,HPA),每個抗原系統(tǒng)是由共顯性雙等位基因控制。對血小板糖蛋白IIIa和糖蛋白Ib的基因序列研究發(fā)現(xiàn),在血小板糖蛋白IIIa基因的第2號外顯子上存在HPA-11a/1b等位基因,血小板糖蛋白I?b基因的受體結合區(qū)存在HPA-22a/2b等位基因。
血小板輸注在臨床上有著重要的作用。然而,由于血小板上存在特異性血小板抗原,臨床使用時往往因抗原不合而發(fā)生血小板輸注無效、輸血后紫癜等。更為嚴重的是,許多患者由于血小板減少,且輸注無效,影響了臨床治療的開展和進行,甚至發(fā)生出血、死亡。因此,在輸注血小板以前檢測受體和供體的特異性血小板抗原,有助于避免因抗原不合而造成的不良后果。另外,近年來不斷有文獻報道血小板抗原與一些疾病的關聯(lián)。如HPA-1、HPA-2、HPA-15等位基因多態(tài)性與心肌梗塞和缺血性腦血管病顯著相關。因此,快速而準確地檢測HPA抗原系統(tǒng)對臨床個性化治療、醫(yī)學研究和新型抗血栓藥物-血小板糖蛋白抑制劑的開發(fā)和評價具有重要意義。
現(xiàn)有技術中已知共有6對HPA抗原系統(tǒng):HPA-1、HPA-2、HPA-3、HPA-4、HPA-5和HPA-15,每個系統(tǒng)包括a/b一對等位基因。在中國人群中,HPA-1~5和HPA-15具有較高的多態(tài)性,HPA不配合輸注極易引發(fā)同種抗體的產生。因此,開發(fā)一種快速、精準的HPA-1~5、15基因分型試劑盒可有效推進血小板同型輸注,為血小板同種免疫反應(疾病)的治療提供幫助。
目前在普通實驗室進行HPA分型的方法主要有:序列特異引物聚合酶鏈式反應(PCR-SSP)、序列特異性寡核苷酸聚合酶鏈式反應(PCR-SSO)、直接測序分型聚合酶鏈式反應(PCR-SBT)、限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈式反應(PCR-RFLP)等,這些方法都有其各自的局限性,上述各方法的原理及其缺陷如下所示:
1)PCR-SSP
主要原理:設計出一套特異性針對各等位基因的引物,直接擴增有序列差異的各等位基因特異性片斷,通過瓊脂糖電泳來判斷有無擴增產物來確定基因的多態(tài)性;
主要實驗流程:設計序列特異性引物→擴增→瓊脂糖凝膠電泳→觀察;
實驗缺陷:無法自動獲取結果;一對等位基因需要雙管操作;特異性引物的先天不足導致非特異性的產生,準確度有待提高。
2)PCR-SSO
主要原理:利用標記的等位基因特異性的指示物一寡核苷酸探針與所含目的SNP片段進行雜交,然后使用發(fā)光或產色底物來進行檢測;
主要試驗流程:擴增→產物連接尼龍膜支持物→標記特異性探針雜交;
實驗缺陷:雜交溫度須嚴格控制;洗滌條件嚴格;易產生假陽性及假陰性。
3)PCR-SBT
主要原理:根據(jù)核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,并且在每個堿基后面進行熒光標記,產生以A、T、C、G結束的四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進行檢測,從而獲得可見的DNA堿基序列;
主要試驗流程:目的片段擴增→產物純化→測序;
實驗缺陷:實驗成本高。
4)PCR-RFLP
主要原理:基于SNP所致的目標基因上限制性酶切位點的丟失或獲得,相關基因片斷通過SNP的5′端和3′端的引物進行擴增,產物用限制性酶進行降解,然后進行聚丙烯酰胺或瓊脂糖凝膠電泳并分析;
主要試驗流程:目的片段擴增→產物酶解→電泳觀察;
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