[發明專利]OBR基因及其作為鵝脂肪性狀遺傳標記的用途無效
| 申請號: | 201010155783.2 | 申請日: | 2010-04-27 |
| 公開(公告)號: | CN101921771A | 公開(公告)日: | 2010-12-22 |
| 發明(設計)人: | 曲湘勇;何俊;蔣雋 | 申請(專利權)人: | 曲湘勇;湖南農業大學 |
| 主分類號: | C12N15/12 | 分類號: | C12N15/12;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 長沙正奇專利事務所有限責任公司 43113 | 代理人: | 何為 |
| 地址: | 410128 湖南省長*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | obr 基因 及其 作為 脂肪 性狀 遺傳 標記 用途 | ||
技術領域:
本發明涉及鵝的分子生物學技術及育種領域,具體是涉及測定與腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度等相關特征的遺傳標記的存在,更具體地說,是涉及測定顯示該些特征的OBR基因的差異,再進一步具體地說,是測定OBR基因中的多態性,即與腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度相關的鵝OB(obese)基因的單核苷酸多態性(Single?nucleotide?polymorphism,縮寫為SNP)的存在。
背景技術:
現代家禽遺傳育種理論和應用的發展,使肉用家禽特別是肉雞、肉鴨的生長速度和飼料效率大幅度提高,生產效率與工廠化生產逐相適應。但同時也容易帶來胴體腹部脂肪和皮下脂肪的大量沉積,導致飼料能量的浪費和胴體品質不佳。
OB(obese)基因編碼一種瘦蛋白質(Leptin)的肽類激素,可抑制脂肪蓄積和維持脂肪細胞大小正常。目前有許多關于人、鼠OB基因以及少量關于豬0B基因的研究報道,但家禽OB基因的研究報道還鮮見。OBR(obese?receptor)基因在Lepein的信號轉導起極重要作用,它與機體脂肪沉積有關,故OBR基因可作為脂肪沉積候選基因。雞OB基因的cDNA于1998年Taouis等克隆和測序,編碼長度492bp,編碼163個氨基酸,含18個氨基酸信號肽,成雞Leptin由146氨基酸組成。Ashwell等用Northern檢測發現,雞的Leptin在脂肪組織和肝臟中都有表達。雞OBR的cDNA于2000年Guy?Horev等和Takeshi等被克隆,與其他哺乳動物OBR核苷酸序列的同源性平均為60%,Dunn等將雞的OBR基因定位于8號染色體上。顧志良等報道了對雞的OBR基因的外顯子9的部分序列進行克隆和測序,發現一個堿基有突變,產生了多態性,但氨基酸序列沒有改變(沉默突變)。顧志良等進一步用PCR-SSCP方法研究不同品種雞的OBR基因表明:北京油雞AA基因型頻率與其它雞種存在差異,高脂系A基因頻率比低脂系高,并推測基因A可能與沉積較多腹脂有關。李志輝等研究結果表明,雞OBR基因外顯子9的SNPs基因型對肉雞腹脂重和腹脂率有顯著影響,可以用于雞脂肪性狀的標記輔助選擇。
目前,有關鵝的DNA遺傳標記、遺傳多樣性和相關功能基因的研究相對雞來說還很少,且沒有關于鵝OBR基因的研究報道。
發明內容:
本發明所要解決的技術問題是:針對上述現有技術的不足,提供一種OBR基因及其作為鵝脂肪性狀遺傳標記的用途;同時篩選與鵝脂肪沉積相關的SNP,以期應用于標記輔助選擇或標記輔助滲入,并提供上述遺傳標記在鵝標記輔助選擇中的應用。
為了解決上述技術問題,本發明所采用的技術方案是:一種OBR基因,是與表示鵝脂肪性狀的腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度相關的基因,其DNA序列如SEQ?ID?NO.1所示。上述OBR基因序列的第55bp處有一個A→G的突變,導致多態性的存在。
克隆OBR基因和檢測55A-55G堿基處突變所用引物的序列如下:
正向引物:5’-GTGCTGTACTTCCCTACTAAG-3’,
反向引物:5’-TGGCATTCCCTATTTTGA-3’。
上述OBR基因在鵝遺傳標記輔助選擇中的應用。
一種鑒定鵝脂肪性狀的遺傳標記的方法,該鵝具有與表示鵝脂肪性狀的腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度相關的基因,該方法包括測定從鵝獲得的核酸樣品中OBR基因中多態性的存在,該多態性是與表示鵝脂肪性狀指標的腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度相關的多態性,該多態性在OBR基因序列的55bp處有一個A→G的突變。
上述方法包含克隆得到一個如權利要求1所述OBR基因的DNA序列,該基因的該基因外顯子9編碼序列,擴增目的片斷長度217bp,第55堿基處有一個堿基突變A55-G55。
克隆OBR基因和檢測55A-55G堿基處突變所用引物的序列為:
正向引物:5’-GTGCTGTACTTCCCTACTAAG-3’,
反向引物:5’-TGGCATTCCCTATTTTGA-3’。
上述方法在鵝育種中的應用。
現代家禽遺傳育種理論和應用的發展,使肉用家禽特別是肉雞、肉鴨的生長速度和飼料效率大幅度提高,生產效率與工廠化生產逐相適應。但同時也容易帶來胴體腹部脂肪和皮下脂肪的大量沉積,導致飼料能量的浪費和胴體品質的不佳。針對這個問題,本發明人選擇鵝作為研究對象,采用分子生物學的方法篩選鵝脂肪性狀相關基因,其步驟如下:
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