[發(fā)明專利]人p38α與TAB1新功能表位以及用途

無(wú)效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201010123504.4
• 申請(qǐng)日: 2010-03-15
• 公開（公告）號(hào): CN102120990A
• 公開（公告）日: 2011-07-13
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王慶陽(yáng);張紀(jì)巖;黎燕;沈倍奮;馮健男
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所
• 主分類號(hào): C12N9/12
• 分類號(hào): C12N9/12;C07K14/47
• 代理公司: 暫無(wú)信息
• 代理人: 暫無(wú)信息

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及蛋白質(zhì)的功能表位及所述功能表位的用途。具體而言，本發(fā)明基于蛋白-蛋白相互作用的空間結(jié)構(gòu)信息，利用計(jì)算機(jī)圖形學(xué)技術(shù)，通過(guò)分子間相互作用、分子間氫鍵形成模式，確定蛋白質(zhì)間相互識(shí)別的功能靶位。具體而言，即利用分子模擬技術(shù)構(gòu)建p38α、TAB1空間構(gòu)象，在分析其理化性質(zhì)、表面特征的基礎(chǔ)上，通過(guò)分子對(duì)接、常溫動(dòng)力學(xué)模擬技術(shù)構(gòu)建p38α-TAB1相互作用的復(fù)合物空間構(gòu)象。進(jìn)一步利用計(jì)算機(jī)圖形學(xué)技術(shù)、距離幾何學(xué)等計(jì)算生物學(xué)手段從理論上確定p38α與TAB1相互識(shí)別的表位結(jié)構(gòu)，通過(guò)生物學(xué)定點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)對(duì)確定的表位結(jié)構(gòu)進(jìn)行驗(yàn)證和評(píng)價(jià)。

背景技術(shù)

p38是絲裂原激活蛋白激酶(MAPK)家族的成員之一，有α，β，γ，δ四種同分異構(gòu)體，廣泛分布于體內(nèi)各類型細(xì)胞中。其中p38α被研究的最多，并且被認(rèn)為在四種同分異構(gòu)體中起主要作用。p38在許多胞外信號(hào)刺激下被活化，進(jìn)而在細(xì)胞增殖、凋亡和分化的過(guò)程中發(fā)揮重要作用，特別是在應(yīng)激和感染過(guò)程中p38分子也能夠被激活[Han?J，Lee?JD，Bibbs?L，et?al.A?MAP?kinasetargeted?by?endotoxin?and?hyperosmolarity?in?mammalian?cells.Science，1994，265(5173)：808-811.Raingeaud?J，Gupta?S，Rogers?JS，et?al.Pro-inflammatory?cytokines?and?environmental?stress?cause?p38mitogen-activated?protein?kinase?activation?by?dual?phosphorylation?ontyrosine?and?threonine.J?Biol?Chem，1995，31，270(13)：7420-7426.]。p38在炎癥發(fā)生發(fā)展中處于至關(guān)重要的位置，活化的p38可以直接激活核轉(zhuǎn)錄因子，也可以通過(guò)激活下游的蛋白激酶來(lái)調(diào)節(jié)mRNA的穩(wěn)定性和有效翻譯，進(jìn)而促進(jìn)許多炎性細(xì)胞因子的表達(dá)[Kyriakis?JM.Making?the?connection：coupling?ofstress-activated?ERK/MAPK(extracellular-signal-regulated?kinase/mitogen?-activated?protein?kinase)core?signalling?modules?to?extracellular?stimuli?andbiological?responses.Biochem?Soc?Symp，1999，64：29-48.Ono?K，Han?J.The?p38signal?transduction?pathway：activation?and?function.Cell?Signal，2000，Jan，12(1)：1-13.]。正常水平的炎癥因子活化在機(jī)體抗感染，組織修復(fù)和器官存活中有重要作用，但其大量產(chǎn)生和異?；罨瘎t會(huì)破壞機(jī)體的免疫平衡，產(chǎn)生多種病理?yè)p傷，如敗血癥休克導(dǎo)致的多器官功能衰竭、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、多發(fā)性硬化癥等。各大制藥公司已開發(fā)出眾多p38抑制因子及相關(guān)的拮抗劑，并在動(dòng)物模型中顯示出了很好的抗炎效果?，F(xiàn)有的p38抑制因子及相關(guān)的拮抗劑盡管與p38結(jié)合方式不同，化學(xué)結(jié)構(gòu)迥異，但發(fā)揮抑制作用的機(jī)制均為與ATP競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合p38的ATP結(jié)合口袋，都屬于ATP競(jìng)爭(zhēng)因子。由于在整個(gè)激酶組中，ATP結(jié)合口袋有很高的結(jié)構(gòu)相似性，因此現(xiàn)有的p38抑制因子特異性不能保證，并因安全問(wèn)題在臨床試驗(yàn)中反復(fù)失敗[Lee?MR，Dominguez?C.MAPkinase?p38inhibitors：clinical?results?and?an?intimate?look?at?their?interactionswith?p38alpha?protein[J].Curr?Med?Chem，2005，12(25)：2979-2994.BadgerAM，Bradbeer?JN，Votta?B，et?al.Pharmacological?profile?of?SB?203580，aselective?inhibitor?of?cytokine?suppressive?binding?protein/p38kinase，inanimal?models?of?arthritis，bone?resorption，endotoxin?shock?and?immunefunction[J].J?Pharmacol?Exp?Ther，1996，279(3)：1453-1461.]。