[發(fā)明專利]南非Ⅱ型口蹄疫抗原表位多肽及其篩選方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010111010.4 | 申請日: | 2010-02-10 |
| 公開(公告)號: | CN101812120A | 公開(公告)日: | 2010-08-25 |
| 發(fā)明(設計)人: | 林祥梅;吳紹強;王彩霞;李雅靜 | 申請(專利權(quán))人: | 中國檢驗檢疫科學研究院 |
| 主分類號: | C07K7/08 | 分類號: | C07K7/08;G01N33/53;G01N33/569 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飛 |
| 地址: | 100123 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 南非 口蹄疫 抗原 多肽 及其 篩選 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于基因工程技術(shù)領(lǐng)域,具體地說,涉及南非II型口蹄疫病毒主要抗原表位上的六條多肽及篩選方法。
背景技術(shù)
口蹄疫是由口蹄疫病毒(Foot-and-mouth?disease?virus,F(xiàn)MDV)引起的偶蹄動物的一種急性、高度接觸性傳染病,一度被世界動物衛(wèi)生組織(OIE)列為A類疫病之首。口蹄疫屬于世界流行性傳染病,它的暴發(fā)給全球人類健康以及畜牧業(yè)生產(chǎn)造成了極大的危害。
口蹄疫病毒屬于小RNA病毒科,口蹄疫病毒(aphthovirus)屬。FMDV是由單股正鏈RNA組成的140S顆粒,它由VP1(1D)、VP2(1B)、VP3(1C)和VP4(1A)四種結(jié)構(gòu)蛋白各60拷貝組成。FMDV基因組全長約8500bp,依次由5′UTR、ORF和3′UTR及Poly(A)尾組成。5′UTR長約1300bp,它包括在病毒翻譯和RNA復制中起作用的5個功能區(qū):S片段、Poly(C)、cre區(qū)、IRES(內(nèi)部核糖體進入位點)等。3′UTR可以結(jié)合參與RNA復制某些小RNA病毒蛋白,因此它對于病毒基因組復制具有重要作用。Poly(A)尾可能也在FMDV翻譯和小RNA病毒的RNA復制中起作用。FMDV的ORF長約6500bp,由L基因、P1結(jié)構(gòu)蛋白基因、P2和P3非結(jié)構(gòu)蛋白基因以及起始密碼子和終止密碼子組成,編碼一個大的聚蛋白。L區(qū)包括Lab、Lb兩種蛋白。結(jié)構(gòu)蛋白P1區(qū)包含了FMDV的主要抗原位點。P1基因編碼4種病毒的結(jié)構(gòu)蛋白,即VP1、VP2、VP3和VP4。VP1~VP3組成衣殼蛋白亞單位,VP4位于病毒顆粒內(nèi)部。P2基因編碼3種病毒的非結(jié)構(gòu)蛋白,2A、2B、2C。P3基因編碼非結(jié)構(gòu)蛋白3A、Vpg、3Cpro和3Dpol。
目前,關(guān)于FMDV結(jié)構(gòu)蛋白的研究主要集中在VP1上,對VP1結(jié)構(gòu)和功能的研究表明,F(xiàn)MDV的O、A、C型和Asia?I型,其主要抗原位點都在VP1上。VP1暴露于病毒顆粒的表面,承受的選擇壓力最大,關(guān)鍵氨基酸的改變可導致抗原位點和單克隆抗體反應性的改變,使得VP1最容易發(fā)生變異,其變異常可導致毒株抗原性的變化,在口蹄疫免疫預防、遺傳演化中一直是研究的主要對象。但目前已有研究表明,在病毒的抗原結(jié)構(gòu)中VP1~VP3都顯示了重要作用。Archarya對FMDV顆粒空間構(gòu)型的研究表明,VP1~VP3都有氨基酸位于病毒粒子表面,都能參與抗原位點的形成。
口蹄疫病毒的抗原結(jié)構(gòu)十分復雜,不同的血清型有著不同的抗原位點。在口蹄疫病毒的七個血清型中,以O、A、C和Asia?I型的抗原位點研究最多,而對南非型的研究較少。在FMDV的四種結(jié)構(gòu)蛋白VP1、VP2、VP3、VP4中,VP1是誘導產(chǎn)生中和抗體的主要成分,VP1上的G-H環(huán)和保守的RGD(Arg-Gly-Asp)基序參與構(gòu)成了重要的抗原位點。此外,對FMDV空間構(gòu)型的研究發(fā)現(xiàn)VP2、VP3都能參與抗原位點的形成。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供南非II型口蹄疫病毒主要抗原表位的六條多肽。
本發(fā)明的另一目的是提供南非II型口蹄疫病毒主要抗原表位六條多肽的篩選方法。
為了實現(xiàn)本發(fā)明目的,本發(fā)明提供南非II型口蹄疫病毒主要抗原表位的六條多肽,分別位于抗原VP1的132~146和199~211位點;VP2的60~73和163~176位點;VP3的58~71和127~140位點,其氨基酸序列分別為:GECKYTQTSTAIRGD、HQSRDRFDAPIGV;RFFKEKLFDWTSDK、LGVNRHDQGKRHQA;DGKPYVVTKNNGDK、PGVNTDELPKTPEA,或這六條氨基酸序列經(jīng)替換、缺失或添加一個或幾個氨基酸形成的具有同等功能的氨基酸序列。
前述的南非II型口蹄疫病毒主要抗原表位六條多肽的篩選方法,包括如下步驟:1)采用軟件分析南非II型口蹄疫病毒的三種結(jié)構(gòu)蛋白VP1、VP2和VP3的氨基酸特性,根據(jù)這些氨基酸特性設計并合成多肽片段;2)對合成的多肽進行抗原性分析,篩選出6條多肽,其氨基酸序列分別為:GECKYTQTSTAIRGD、HQSRDRFDAPIGV、RFFKEKLFDWTSDK、LGVNRHDQGKRHQA、DGKPYVVTKNNGDK和PGVNTDELPKTPEA。
前述的方法,其中合成多肽的抗原性分析包括反應原性檢測及免疫原性檢測。
前述的方法,其中反應原性檢測采用間接ELISA法。
南非II型口蹄疫主要抗原表位的六條多肽在檢測南非II型口蹄疫病毒中的應用。
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