[發明專利]一種檢測人6種免疫相關基因的標簽單核苷酸多態性位點方法

有效

• 申請號: 201010100751.2
• 申請日: 2010-01-26
• 公開（公告）號: CN101851673A
• 公開（公告）日: 2010-10-06
• 發明（設計）人: 田亞平;胡金川
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍總醫院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京君智知識產權代理事務所 11305
• 代理人: 鄭明

1.一種檢測人6種免疫相關基因的標簽單核苷酸多態性位點方法，這些基因及標簽單核苷酸多態性位點為：補體受體1型基因：rs3818361、rs9429945、rs4844600、rs17048010、rs11118167；達菲抗原/趨化因子受體基因：rs863002；白細胞分化抗原59基因：rs1546727、rs831629、rs10768024、rs2231454、rs11585、rs1738548、rs12576440；白細胞分化抗原4基因：rs11064410、rs2255301、rs1075835、rs1075838、rs11064404、rs3213427、rs1055141、rs3213426；白細胞分化抗原8A基因：rs3020729；白細胞分化抗原8B基因：rs4832054、rs12477946、rs13024609、rs6722860、rs13400210，其特征在于檢測方法包括如下步驟：

(1)挑選各基因的標簽單核苷酸多態性位點，確定延伸試劑類型，并對初選單核苷酸多態性位點進行評價、調整；

(2)設計單核苷酸多態性位點擴增引物及延伸引物，委托公司合成；

(3)制備人全血基因組DNA樣本；

(4)單重PCR驗證單核苷酸多態性位點擴增引物質量；

(5)通過多重PCR-熒光標記單堿基延伸-標簽微陣列雜交反應制備供基因分型系統檢測單核苷酸多態性位點用的樣本；

(6)采用基因分型系統檢測樣本單核苷酸多態性位點；

(7)采用基因分型系統軟件分析單核苷酸多態性位點分型效果，去除分型成功率＜90％的單核苷酸多態性位點，并利用分型成功率＞90％的單核苷酸多態性位點確定個體基因型；

(8)對多個DNA樣本單核苷酸多態性位點重復檢測，計算分型符合率，以評價方法的穩定性。

2.根據權利要求1所述的一種檢測人6種免疫相關基因的標簽單核苷酸多態性位點方法，其特征在于設計的27個標簽單核苷酸多態性位點擴增引物及延伸引物序列如序列1～81所述引物序列。