[發明專利]鮭魚腎桿菌實時熒光RT-PCR檢測方法和試劑盒無效
| 申請號: | 201010042634.5 | 申請日: | 2010-01-04 |
| 公開(公告)號: | CN102115786A | 公開(公告)日: | 2011-07-06 |
| 發明(設計)人: | 何俊強;劉宗曉;史秀杰;劉葒;蘭文升;高隆英 | 申請(專利權)人: | 深圳出入境檢驗檢疫局動植物檢驗檢疫技術中心 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/06;G01N21/64 |
| 代理公司: | 深圳鼎合誠知識產權代理有限公司 44281 | 代理人: | 羅瑤 |
| 地址: | 518001 廣東省深*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鮭魚 桿菌 實時 熒光 rt pcr 檢測 方法 試劑盒 | ||
1.鮭魚腎桿菌(Renibacterium?salmoninarum)的實時熒光RT-PCR檢測方法,所述方法包括利用特異性探針和引物對,以細菌DNA為模板進行實時熒光RT-PCR反應,其特征在于:所述引物對分別含有Seq?ID?No.1和Seq?ID?No.2所示的序列;
Seq?ID?No.1:5’-CCG?AAG?AGC?CCA?CCA?ATG?AC-3’
Seq?ID?No.2:5’-GAC?TTA?GAC?GAC?GCC?GTA?GC-3’
所述探針為能與鮭魚腎桿菌的基因組DNA位于所述引物對之間的序列相同或互補、且長度為15~30bp的寡核苷酸序列,并且所述探針的5’端和3’端分別標記有熒光報告基團和熒光淬滅基團。
2.根據權利要求1所述的檢測方法,其特征在于:所述探針含有SeqID?No.3所示的序列,
Seq?ID?No.3:5’-CGG?ATT?GCC?GTC?GCC?GCA?GC-3’。
3.根據權利要求1或2所述的檢測方法,其特征在于:所述探針5’端標記的熒光報告基團為FAM,3’端標記的熒光淬滅基團為TAMRA。
4.根據權利要求1~3任意一項所述的檢測方法,其特征在于:所述RT-PCR反應的引物終濃度為0.9~1.1μmol/L,探針終濃度為0.09~0.11μmol/L。
5.根據權利要求1~4任意一項所述的檢測方法,其特征在于:所述RT-PCR的反應的退火溫度為53℃~57℃。
6.根據權利要求5所述的檢測方法,其特征在于:所述RT-PCR的反應條件包括:50℃,2min;94℃,10min;40循環:94℃20s,55℃40s。
7.鮭魚腎桿菌(Renibacterium?salmoninarum)的檢測試劑盒,其特征在于:所述試劑盒含有能擴增出鮭魚腎桿菌的基因片段的引物對,所述引物對分別含有Seq?ID?No.1和Seq?ID?No.2所示的序列,
Seq?ID?No.1:5’-CCG?AAG?AGC?CCA?CCA?ATG?AC-3’
Seq?ID?No.2:5’-GAC?TTA?GAC?GAC?GCC?GTA?GC-3’。
8.根據權利要求7所述的檢測試劑盒,其特征在于:所述檢測試劑盒用于實時熒光RT-PCR檢測,并且所述試劑盒還含有能與鮭魚腎桿菌的基因組DNA位于所述引物對之間的序列相同或互補、且長度為15~30bp的寡核苷酸探針,并且所述探針的5’端和3’端分別標記有熒光報告基團和熒光淬滅基團。
9.根據權利要求8所述的檢測試劑盒,其特征在于:所述探針含有Seq?ID?No.3所示的序列,
Seq?ID?No.3:5’-CGG?ATT?GCC?GTC?GCC?GCA?GC-3’。
10.根據權利要求9所述的檢測試劑盒,其特征在于:所述探針5’端標記的熒光報告基團為FAM,3’端標記的熒光淬滅基團為TAMRA。
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