[發明專利]PRE-rRNA比率測量分析

有效

• 申請號: 200980155682.0
• 申請日: 2009-12-10
• 公開（公告）號: CN102301004A
• 公開（公告）日: 2011-12-28
• 發明（設計）人: 杰拉德·A·坎杰洛西;約翰·斯科特·密施克;克里斯·唯杰爾
• 申請（專利權）人: 華盛頓大學;西雅圖生物醫學研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12Q1/02
• 代理公司: 中原信達知識產權代理有限責任公司 11219
• 代理人: 張穎;樊衛民

1.一種檢測樣品中的活微生物的方法，所述方法包含：

收集樣品；

對樣品的第一份等份試樣進行營養刺激；

將樣品的第二份等份試樣維持在未營養刺激的對照條件下；

對第一份等份試樣和第二份等份試樣進行溫育；

將來自第一份等份試樣的至少一種靶微生物的至少一種靶pre-rRNA的水平與來自第二份等份試樣中至少一種靶微生物的所述至少一種靶pre-rRNA的水平進行比較；

其中第一份等份試樣中的所述至少一種靶pre-rRNA的水平與第二份等份試樣中的所述至少一種靶pre-rRNA的水平的比，指示樣品中的活微生物。

2.權利要求1的方法，其還包含從第一份等份試樣提取RNA和從第二份等份試樣提取RNA；以及

對第一份等份試樣中的所述至少一種靶pre-rRNA水平進行定量，并且對第二份等份試樣中的所述至少一種靶pre-rRNA水平進行定量。

3.權利要求1的方法，其中所述至少一種靶微生物在樣品中活的百分率是約0.01％、0.02％、0.03％、0.04％、0.05％、0.1％、0.5％、1.0％、2.0％、3.0％、4.0％、5.0％、10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％和95％中的至少一個。

4.權利要求2的方法，其中從第一份等份試樣和第二份等份試樣提取RNA以及對來自第一份等份試樣和第二份等份試樣的所述至少一種pre-rRNA進行定量包括使用微流體裝置。

5.權利要求1的方法，其還包含免疫分離方法，其中對樣品篩查樣品中所述至少一種靶微生物的特定分離物的存在。

6.權利要求5的方法，其中免疫分離方法包含篩查樣品中大腸埃希氏桿菌(E.coli)0157的存在。

7.權利要求1的方法，其中所述至少一種靶微生物是選自下列的微生物屬的成員：不動桿菌屬(Acinetobacter)、放線桿菌屬(Actinobacillus)、氣單胞菌屬(Aeromonas)、弓形桿菌屬(Arcobacter)、擬桿菌屬(Bacteroides)、包特氏菌屬(Bordetella)、疏螺旋體屬(Borrelia)、布魯氏桿菌屬(Brucella)、伯克霍爾德氏菌屬(Burkholderia)、彎曲桿菌屬(Campylobacter)、檸檬酸桿菌屬(Citrobacter)、阪崎腸桿菌屬(Cronobacter)、愛德華氏菌屬(Edwardsiella)、腸桿菌屬(Enterobacter)、埃希氏桿菌屬(Escherichia)、真桿菌屬(Eubacterium)、弗朗西絲氏菌屬(Francisella)、梭形桿菌屬(Fusobacterium)、嗜血桿菌屬(Haemophilus)、螺桿菌屬(Helicobacter)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、軍團菌屬(Legionella)、鉤端螺旋體屬(Leptospira)、摩拉克氏菌屬(Moraxella)、摩根氏菌屬(Morganella)、奈瑟球菌屬(Neisseria)、巴斯德菌屬(Pasteurella)、鄰單胞菌屬(Plesiomonas)、卟啉單胞菌屬(Porphyromonas)、普氏菌屬(Prevotella)、變形桿菌屬(Proteus)、普羅威登斯菌屬(Providencia)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、沙門氏菌屬(Salmonella)、沙雷氏菌屬(Serratia)、志賀氏菌屬(Shigella)、寡養單胞菌屬(Stenotrophomonas)、密螺旋體屬(Treponema)、韋榮球菌屬(Veillonella)、弧菌屬(Vibrio)、耶爾森氏菌屬(Yersinia)、放線菌屬(Actinomyces)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)、梭狀芽胞桿菌屬(Clostridium)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)、腸球菌屬(Enterococcus)、乳酸桿菌屬(Lactobacillus)、李斯特菌屬(Listeria)、微球菌屬(Micrococcus)、動彎桿菌屬(Mobiluncus)、分枝桿菌屬(Mycobacterium)、諾卡氏菌屬(Nocardia)、消化鏈球菌屬(Peptostreptococcus)、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)、紅球菌屬(Rhodococcus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、鏈球菌屬(Streptococcus)和鏈霉菌屬(Streptomyces)。