[發明專利]基于回歸的多級PCR分析系統

無效

• 申請號: 200980140557.2
• 申請日: 2009-09-09
• 公開（公告）號: CN102187215A
• 公開（公告）日: 2011-09-14
• 發明（設計）人: J·雷納
• 申請（專利權）人: 生物輻射實驗室股份有限公司
• 主分類號: G01N33/48
• 分類號: G01N33/48
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 毛力

1.一種根據表示生物和/或化學反應的擴增過程的數據集來確定所述反應的一種或更多種性質的方法，所述方法包括：

接收表示一具有基線部分和生長部分的曲線的數據點集，每個數據點表示物質在擴增過程期間的物理量；

利用處理器計算逼近所述數據點集的第一函數；

從所述第一函數提取一個或更多個參數；

利用所述處理器使用所述一個或更多個參數來計算逼近所述數據點集的第二函數；以及

利用所述第二函數確定所述生物和/或化學反應的一種或更多種性質。

2.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述一種或更多種性質包括與所述擴增過程相關聯的量化值。

3.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述一個或更多個參數被用作為用于所述第二函數的初始值，且其中計算所述第二函數包括改變一個或更多個所述初始值以減小所述第二函數與所述數據點集之間的誤差。

4.如權利要求3所述的方法，其特征在于，所述第二函數是包含漂移項的經修改S形函數。

5.如權利要求4所述的方法，其特征在于，所述經修改S形函數被表示為：其中D＝1+h、h＝exp(E)、且其中a₀、a₁、a₂、a₃以及a₄是在所述經修改S形函數與所述數據點集的擬合過程期間確定的數字，且其中x是所述擴增過程的循環數。

6.如權利要求5所述的方法，其特征在于，所述一個或多個參數包括a₀、a₁、a₂以及a₃。

7.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述一個或多個參數包括所述擴增過程中的時間Ct，所述第一函數在所述時間Ct具有一指定值。

8.如權利要求7所述的方法，其特征在于，使用所述時間Ct來計算逼近所述數據點集的第二函數包括：

定義以Ct為中心的時間窗口；

使用所述時間窗口內的所述數據點來確定所述第二函數，以使所述第二函數逼近所述時間窗口內的數據點。

9.如權利要求8所述的方法，其特征在于，所述第二函數是6階或更高階的多項式。

10.如權利要求7所述的方法，其特征在于，確定第一時間和第二時間的加權平均值作為所述時間Ct，其中所述第一函數的二階導數在所述第一時間具有最大值，且所述第一函數的三階導數在所述第二時間具有最大值。

11.如權利要求1所述的方法，其特征在于，還包括：

選擇所述基線部分的結尾作為所述擴增過程的第一時間，其中所述第一函數的一階導數函數從所述第一時間到所述一階導數函數的峰值的積分面積在一指定值范圍內。

12.如權利要求1所述的方法，其特征在于，還包括：

分析所述第一函數以確定所述第一函數的斜率是否超過最大擴增斜率；以及

如果所述第一函數確定具有超過所述最大擴增斜率的位置，則將包含所述位置的分段視為所述擴增曲線的非擴增分段。

13.如權利要求12所述的方法，其特征在于，所述最大擴增斜率是ln(2.0)乘以正被計算斜率的位置處的數據點的值。

14.一種確定由生物和/或化學反應的擴增過程所產生的擴增曲線的基線區域的方法，所述方法包括：

接收表示一具有基線部分和生長部分的曲線的數據點集，每個數據點表示物質在擴增過程期間的物理量；

利用處理器確定逼近所述數據點集的函數；

計算所述函數的一階導數以獲得一階導數函數；

通過以下步驟確定基線區域的結尾：

對于多個點：

利用所述處理器從對應點到所述一階導數函數的一固定位置對所述一階導數函數積分，以獲得對應積分面積；以及

選擇積分面積在一指定范圍內的點作為所述基線區域的結尾；以及確定所述基線區域的起始。

15.如權利要求14所述的方法，其特征在于，所述一階導數函數包括所述函數的一階導數減去一初始數據點處的一階導數。