[發明專利]甘藍型油菜BnGLABRA2啟動子及制備方法和應用有效
| 申請號: | 200910273323.7 | 申請日: | 2009-12-18 |
| 公開(公告)號: | CN102102099A | 公開(公告)日: | 2011-06-22 |
| 發明(設計)人: | 白澤濤;董彩華;劉勝毅;柴國華;黃軍艷;劉越英 | 申請(專利權)人: | 中國農業科學院油料作物研究所 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12N15/10;C12N15/82;A01H5/00 |
| 代理公司: | 武漢宇晨專利事務所 42001 | 代理人: | 王敏鋒 |
| 地址: | 430062 湖*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 甘藍 油菜 bnglabra2 啟動子 制備 方法 應用 | ||
1.一種分離的啟動子,其序列為SEQ?ID?NO:1所示的基因啟動子。
2.權利要求1所述的一種甘藍型油菜GL2啟動子GP2的制備方法,其步驟是:
A、基因組步移克隆啟動子序列:
利用SDS裂解法提取基因組DNA,按照基因組步移試劑盒操作程序,進行基因組步移,每次步移擴增兩輪PCR克隆油菜,具體步驟為:提取基因組DNA?25μL,分別用核酸內切酶Dra?I、EcoR?I、Pvu?II和Stu?I酶切,純化后加入接頭形成四個不同的基因組DNA庫,用作首次基因組步移第一輪PCR模板,根據目的基因保守序列設計特異性引物GSP1與試劑盒內上游接頭引物AP1進行擴增,第二輪PCR以第一輪PCR產物的50倍稀釋液為模板,設計引物GSP2和接頭引物AP2進行擴增,進行第二輪基因組步移,所有PCR反應均為50μL擴增體系:模板1μL,dNTPs?0.2mM,引物0.5mM,LA?Taq酶1.25U,10×LA-PCR?buffer5μL,補水至50μL,反應條件均為:94℃預變性1min;98℃10s,72℃6min?7個循環;98℃10s,67℃6min33個循環;72延伸10min,PCR產物經1.0%質量體積比瓊脂糖凝膠電泳檢測,GelExtraction?Kit純化回收后,連接到pMD18-T載體,轉化gold感受態細胞,挑取陽性克隆,酶切驗證后測序,得到目的基因上游的側翼序列;
B、啟動子序列生物信息學分析:
將所克隆序列用BLASTN進行同源比對,啟動子核心元件和上游順式作用元件用啟動子預測軟件進行預測,得到核心啟動子序列和上游啟動子元件;
C、全長啟動子、缺失啟動子的擴增以及pMD18-T-GP載體的構建:
以基因組DNA為模板,根據得到的啟動子序列,設計擴增各缺失片段的引物進行PCR擴增,所有引物的5′端含有Hind?III酶切位點,3′端含有Xba?I酶切位點,反應體系為25μL內含:1×PCR?buffer.,MgCI?1.5mmol/L,dNTP?0.2mmol/L、引物濃度為0.5mol/L,Pfu酶1.5單位,模板約100ng,設置循環參數,PCR產物1.0%質量體積比瓊脂糖凝膠檢測,回收試劑盒回收各目的缺失片段,按各回收的缺失片段∶載體=3∶1的比例混合樣品,加入T4DNA連接酶5單位,1×反應緩沖液,無菌水補充體積至25ml,16℃過夜連接反應,凍融法轉化大腸桿菌gold菌感受態細胞中,涂布于含有Amp的LB固體平板上,37℃培養過夜,各挑選白斑三個,做菌落PCR檢測,將陽性重組子接種于含Amp?50μg/mL的液體LB培養基,37℃?200r/min振蕩培養過夜,小量堿法提取質粒,Hind?III/Xba?I酶切質粒1μg,0.8%質量體積比瓊脂糖凝膠檢測,檢測正確的陽性重組克隆,為pMD18-X,以M13F/M13R為引物M13?R5’-AGCGGATAACAATTTCACACAGGA-3’;M13R5’-GTAAAACGACGGCCAGT-3’,將pMD18-X進行序列測定,得到了一種甘藍型油菜BnGL2基因全長啟動子。
3.權利要求書1中所述一種甘藍型油菜BnGL2基因部分缺失啟動子SEQ?ID?NO:1在根部中的應用。
4.權利要求書1中所述一種甘藍型油菜BnGL2基因部分缺失啟動子SEQ?ID?NO:1在整個葉脈中的應用。
5.權利要求書1中所述甘藍型油菜BnGL2基因缺失啟動子SEQ?ID?NO:1在葉片表皮毛中的應用。
6.權利要求書1中所述甘藍型油菜BnGL2基因缺失啟動子SEQ?ID?NO:1在中柱葉脈中的應用。
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