[發明專利]石斑魚亞科魚類線粒體基因組全序列擴增引物及其設計方法

無效

• 申請號: 200910112686.2
• 申請日: 2009-10-22
• 公開（公告）號: CN101698842A
• 公開（公告）日: 2010-04-28
• 發明（設計）人: 丁少雄;曾華嵩;莊軒
• 申請（專利權）人: 廈門大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 廈門南強之路專利事務所 35200
• 代理人: 馬應森

1.石斑魚亞科魚類線粒體基因組全序列擴增引物，其特征在于由16對單鏈寡聚核苷酸組成，其中每一對都由一條輕鏈引物和一條重鏈引物構成，16對引物的名稱、序列以及PCR擴增產物所涵蓋的區域如下：

輕鏈引物1：L489-12S，其序列為：AAACTGGGATTAGATACCCCACTAT，

重鏈引物1：H1489-16S，其序列為：GCAACCAGCTATTACTAAGTTCGGTAGG，

PCR產物涵蓋的區域：12S?rRNA，Val，16S?rRNA；

輕鏈引物2：L1230-16S，其序列為：AGTACCGCAAGGGAAYGCTGAAAA，

重鏈引物2：H2642-16S，其序列為：CCGGTCTGAACTCAGATCACGT，

PCR產物涵蓋的區域：16S?rRNA；

輕鏈引物3：L2541-16S，其序列為：TTACGACCTCGATGTTGGATCAG，

重鏈引物3：H3977-Gln，其序列為：GGAAGCACTGAGAGTTTTGATC，

PCR產物涵蓋的區域：16S?rRNA，Leu，ND1，Ile，Gln；

輕鏈引物4：L3872-Ile，其序列為：AAGGGCCACTTTGATAGAGTG，

重鏈引物4：H4781-ND2，其序列為：GTRAGTRYGGGGGYTTTTGCYCA，

PCR產物涵蓋的區域：Ile，Gln，Met，ND2；

輕鏈引物5：L4595-ND2，其序列為：TAGCATACTCCTCYACAGCCCAC，

重鏈引物5：H5802-COI，其序列為：CTYATRTTRTTYATTCGAGGGAA，

PCR產物涵蓋的區域：ND2，Trp，Ala，Asn，Cys，Tyr，COI；

輕鏈引物6：L5551-COI，其序列為：CCTYTATCTTGTATTYGGTGC，

重鏈引物6：H7103-Ser，其序列為：ATGTGGYTGGCTTGAAA，

PCR產物涵蓋的區域：COI，Ser；

輕鏈引物7：L6719-COI，其序列為：AGCACYTGAACAAAAATCCACTT，

重鏈引物7：H8151-ATP6，其序列為：TCAAAAAARCTTACACTCAGGGTCA，

PCR產物涵蓋的區域：COI，Ser，Asp，COII，Lys，Atp8，Atp6；

輕鏈引物8：L7922-Lys，其序列為：AGCRTYAGCCTTTTAAGC，

重鏈引物8：H8861-COIII，其序列為：CANGGGCTGGGGTCRACTAT，

PCR產物涵蓋的區域：Lys，Atp8，Atp6，COIII；

輕鏈引物9：L8534-ATP6，其序列為：CCCAAYCTCCTAATCCCTATACTTAT，

重鏈引物9：H9829-ND3，其序列為：GGAGAAMGGAAGTCGGGCTGT，

PCR產物涵蓋的區域：Atp6，COIII，Gly，ND3；

輕鏈引物10：L9627-Gly，其序列為：TGACTTCCAATCACCCGGTCTTGGTT，

重鏈引物10：H10768-ND4，其序列為：GGTTGGGATRAGAGTTGCTTCAAATAT，

PCR產物涵蓋的區域：Gly，ND3，Arg，ND4L，ND4；

輕鏈引物11：L10607-ND4，其序列為：ATAATYYTAGCAAGCCAAAACCACACAGC，

重鏈引物11：H11946-Leu，其序列為：CCTAAGACCRAYGGATGRACTATTATCCTT，

PCR產物涵蓋的區域：ND4，His，Ser，Leu；

輕鏈引物12：L11809-His，其序列為：GTTRAAAYCCCCTTATCCACCGAG，

重鏈引物12：H13079-ND5，其序列為：CCTATTTTKCGRATGTCTTGTTCGTC，

PCR產物涵蓋的區域：His，Ser，Leu，ND5；

輕鏈引物13：L12880-ND5，其序列為：ACCCAAAACGACATYAAAAAAATTGTTGC，

重鏈引物13：H14294-ND6，其序列為：GGRRYGATTGCGGTTGCTTC，

PCR產物涵蓋的區域：ND5，ND6；

輕鏈引物14：L13573-ND5，其序列為：AAYATRCTYGGCTTYTTCCCMATAAT，

重鏈引物14：H15090-Cyt?b，其序列為：TAWGAAAAGTAKGGGTGGAAGGA，

PCR產物涵蓋的區域：ND5，ND6，Glu，Cytb；

輕鏈引物15：L14954-Cyt?b，其序列為：TTCCAYTTYTTRYTYCCYTTCRTWATTGCAG，

重鏈引物15：H?16060-Dloop，其序列為：TGAAYGCTCGGCWTGYTGGGTAACG，

PCR產物涵蓋的區域：Cytb，Thr，Pro，D-loop?region；

輕鏈引物16：L15947-Dloop，其序列為：TTCCTGGCATTTGGTTCCTAYTTCAGGG，

重鏈引物16：H765-12S，其序列為：GCTACACCTCGACCTGACGTTTTGGG，

PCR產物涵蓋的區域：D-loop?region，12S?rRNA；

序列中R為簡并堿基，代表A和G的混合堿基位點；序列中Y為簡并堿基，代表C和T的混合堿基位點；序列中M為簡并堿基，代表A和C的混合堿基位點；序列中W為簡并堿基，代表A和T的混合堿基位點；序列中K為簡并堿基，代表G和T的混合堿基位點；序列中N為簡并堿基，代表A、C、G和T的混合堿基位點。

2.如權利要求1所述石斑魚亞科魚類線粒體基因組全序列擴增引物用于種類鑒定、地理種群鑒別和種質資源評估。