[發明專利]水產品養殖致病菌的基因芯片

無效

• 申請號: 200910099343.7
• 申請日: 2009-06-03
• 公開（公告）號: CN101691608A
• 公開（公告）日: 2010-04-07
• 發明（設計）人: 陳炯;李明云;史雨紅;李長紅;張亮
• 申請（專利權）人: 寧波大學;寧波博奧生物工程有限公司;博奧生物有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C40B40/06;C12R1/63;C12R1/46;C12R1/20;C12R1/37;C12R1/365;C12R1/01
• 代理公司: 寧波奧圣專利代理事務所（普通合伙） 33226
• 代理人: 程曉明

技術領域

本發明涉及基因芯片，具體涉及水產品養殖致病菌的基因芯片。?

背景技術

由于自然資源的逐漸稀缺和人們的需求增強，目前多數水產品進行了人工養殖，由于水產品在養殖過程中密度較大、水體富營養化和水體流動性較差，使得各種致病菌繁殖和傳染性增大，成為水產品養殖的重要難題，目前對水產品養殖中致病菌檢測手段較缺乏，養殖戶們只好采用茛據經驗和對各種致病菌都預防和殺滅的方式灑藥，不能對癥下藥，既造成了藥品浪費，又達不到殺滅致病菌的應有藥量。?

基因芯片包括以硅片、玻片、金屬片、陶瓷片、聚丙烯或尼龍膜等基片作為固相載體，經氨基、醛基或巰基的表面化學修飾，將寡聚核苷酸(DNA、cDNA、rDNA片段)、多肽和細胞等生物大分子的檢測探針及對照樣品以點陣(微陣列)的形式分布在固相載體上。目前已有家禽和家畜疫病珍斷的基因芯片，如公告號為CN1181210，授權公告日為2004年12月22日，名稱為家禽和/或家畜疫病診斷性基因芯片及其用途的中國發明專利，和公告號為CN1260371，授權公告日為2006年6月21日，名稱為豬繁殖障礙綜合癥的基因芯片及其用途的中國發明專利，就公開了檢測豬、雞的各種疾病的基因芯片。但目前沒有對水產品致病菌進行高通量、微型化和自動化檢測的基因芯片的報道。?

發明內容

本發明所要解決的技術問題是提供一種對水產品致病菌的檢測具有高通量、微型化和自動化的基因芯片；該基因芯片能快速檢測判讀多個屬和種的致病菌。?

本發明解決上述技術問題所采用的技術方案為：水產品養殖致病菌的基因芯片，包括經化學修飾的固相載體，在所述固相載體上點陣分布有檢測探針和質控探針，所述檢測探針包括待測弧菌屬、霍亂弧菌、哈維氏弧菌、溶藻弧菌、鰻弧菌、副溶血性弧菌、諾卡氏菌屬、鰤魚諾卡氏菌、氣單胞菌屬、嗜水性氣單胞菌、鏈球菌屬、海豚鏈球菌的特異性16S?rDNA序列和/或gyrB基因序列，所述質控探針為PCR質控陽性寡聚核苷酸序列SEQ?ID?NO：39、芯片固定陽性對照寡聚核苷酸序列SEQ?ID?NO：40、芯片雜交陰性對照寡聚核苷酸序列SEQ?ID?NO：41、芯片雜交陽性對照寡聚核苷酸序列SEQ?ID?NO：42和芯片雜交空白對照，待測弧菌屬的為SEQ?ID?NO：1序列和SEQ?ID?NO：2序列，待測霍亂弧菌的為SEQ?ID?NO：3序列和SEQ?ID?NO：4序列，待測哈維氏弧菌的為SEQ?ID?NO：5序列，待測溶藻弧菌的為SEQ?ID?NO：6序列和SEQ?ID?NO：7序列，待測鰻弧菌的為SEQ?ID?NO：8序列、SEQ?ID?NO：9序列、SEQ?ID?NO：10序列和SEQ?ID?NO：11序列，待測副溶血性弧菌的為SEQ?ID?NO：12序列，待測諾卡氏菌屬的為SEQ?ID?NO：13序列和SEQ?ID?NO：14序列，待測鰤魚諾卡氏菌屬的為SEQ?ID?NO：15序列和SEQID?NO：16序列，待測氣單胞菌屬的為SEQ?ID?NO：17序列和SEQ?ID?NO：18序列，待測嗜水性氣單胞菌屬的為SEQ?ID?NO：19序列，待測鏈球菌屬的為SEQ?ID?NO：20序列和SEQ?ID?NO：21序列，待測海豚鏈球菌的為SEQ?ID?NO：22序列和SEQ?ID?NO：23序列。?

所述檢測探針還包括待測河流弧菌、創傷弧菌、蘇伯利氣單胞菌、黃桿菌屬、嗜冷黃桿菌和變形桿菌屬的特異性16S?rDNA序列和/或gyrB基因序列，待測河流弧菌的為SEQ?ID?NO：24序列、SEQ?ID?NO：25序列和SEQ?ID?NO：26序列，待測創傷弧菌的為SEQ?ID?NO：27序列、SEQ?ID?NO：28序列和SEQ?ID?NO：29序列，待測蘇伯利氣單胞菌的為SEQ?ID?NO：30序列，待測黃桿菌屬的為SEQ?ID?NO：31序列和SEQ?ID?NO：32序列，待測嗜冷黃桿菌的為SEQ?ID?NO：33序列、SEQ?ID?NO：34序列、SEQ?ID?NO：35序列和SEQ?ID?NO：36序列，待測變形桿菌屬的為SEQ?ID?NO：37序列和SEQ?ID?NO：38序列；這樣使基因芯片所檢測的細菌又增加了2個屬和4個菌種，基本上覆蓋了水產品養殖中的常見和非常見的致病菌。?