[發明專利]O157:H7大腸菌的環介導等溫擴增快速檢測試劑盒及方法無效
| 申請號: | 200910096030.6 | 申請日: | 2009-01-23 |
| 公開(公告)號: | CN101487057A | 公開(公告)日: | 2009-07-22 |
| 發明(設計)人: | 朱水榮 | 申請(專利權)人: | 浙江省疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/19 |
| 代理公司: | 杭州天正專利事務所有限公司 | 代理人: | 黃美娟;冷紅梅 |
| 地址: | 310051浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | o157 h7 大腸菌 環介導 等溫 擴增 快速 檢測 試劑盒 方法 | ||
(一)技術領域
本發明涉及O157:H7大腸菌的環介導等溫擴增快速檢測試劑盒及檢測方法。?
(二)背景技術
新發現和重新抬頭的病原微生物是當前世界醫學面臨的新課題,腸出血性大腸菌O157:H7就是其中的一種。O157:H7是腸出血性大腸艾希菌(Enterohemorrhagic?Escherichia?coli,EHEC)最主要的血清型,于1982年首次在美國發現,為新發病原菌。其致病性強,感染劑量極低,食入不足10個細菌即可引起疾病。該菌主要引起出血性腸炎(HC)、溶血性尿毒綜合癥(HCS)和血栓性血小板減少性紫癜(TTP),病死率高達30%以上,是全球關注的世界性公共衛生問題。我國自1988年在江蘇徐州檢出首株EHEC?O157:H7后,各地加強了對腸道門診、畜禽及肉制品等的食品檢測,相繼從腹瀉病人、家畜、家禽及食品中多次檢出O157:H7大腸菌。通過對近幾年我省O157分離株毒力基因檢測(PCR法)發現我省主要以Stx2為主,同時攜帶Stx2和Stx1基因的菌株則比較少,這與國內其他省市分離出的大多數菌株相似,但與Fagan等報道則不同,故本研究主要選取stx2基因為靶基因進行檢測。rfbE與fliC基因分別編碼O157:H7菌體抗原O抗原及鞭毛抗原H抗原,針對這兩種基因的檢測將有助于O157:H7血清型診斷的進一步驗證。?
目前,大多數基層實驗室鑒定O157:H7大腸菌仍主要依賴于傳統培養方法、生化和血清學鑒定方法,檢驗方法繁瑣,費時費力,報告檢驗結?果時間長,難以適應快速檢測的要求。近年來,PCR法檢測O157:H7大腸菌得到了迅速發展,主要有常規PCR、多重PCR、Real-time?PCR等,但這些方法均需特殊的儀器,不適合在基層或小型實驗室推廣使用。Notomi等是2000年開發出的一種新的DNA環介導恒溫擴增法(loop-mediated?isothermal?amplification,LAMP),因其具有操作簡便易行、結果判讀簡單等特點,可以在基層實驗室推廣使用,該方法已在一些國家地區被廣泛應用,而國內對此技術研究則剛剛起步,應用LAMP技術檢測O157:H7大腸菌目前未見文獻報道。?
環介導等溫擴增技術原理:環介導等溫擴增(loop-mediated?isothermalamplification,LAMP)技術是Notomi等2000年開發出的一種新的DNA環介導的恒溫擴增法,即利用Bst大片段DNA聚合酶和根據不同靶序列設計的4-6條引物,特異地識別靶序列上的6個特定區域,在60~65℃等溫條件下高效特異地擴增目的靶基因,終產物是具有與目的靶基因反相重復序列的莖環DNA。如果再設計1-2條環引物,則可大大提高擴增反應速度。該方法的一大特點是,可以通過反應副產物-白色焦磷酸鎂沉淀的產生與否判斷靶基因的存在,抑或在體系中加入熒光染色試劑,在紫外燈下觀察,對反應產物實時監測。?
(三)發明內容
本發明就是根據上述原理,針對O157:H7的O抗原編碼rfbE、志賀樣毒素stx2、H鞭毛抗原編碼flic基因分別設計LAMP引物,提供一種特異性強、靈敏度高的O157:H7大腸菌的環介導等溫擴增快速檢測試劑盒及檢測方法。?
本發明采用的技術方案是:?
O157:H7大腸菌的環介導等溫擴增快速檢測試劑盒,主要包括特異?性擴增引物、Bst?DNA聚合酶、脫氧核糖核苷酸混合物、PCR緩沖液,所述特異性擴增引物序列如下:?
rfbE?FIP(O抗原編碼rfbE特異性擴增內引物FIP):?
CTCTCTTTCCTCTGCGGTCCGATGTTTTTCACACTTATTGGAT;?
rfbE?BIP(O抗原編碼rfbE特異性擴增內引物BIP):?
TAAGGAATCACCTTGCAGATAAACTAGTACATTGGCATCGTGT;?
rfbE?F3(O抗原編碼rfbE特異性擴增外引物F3):?
AACAGTCTTGTACAAGTCCA;?
rfbE?B3(O抗原編碼rfbE特異性擴增外引物B3):?
GGTGCTTTTGATATTTTTCCG;?
rfbE?LB(O抗原編碼rfbE特異性擴增環引物LB):?
CGAAACAAGGCCAGTTTTTTACC;?
stx2FIP(志賀樣毒素stx2特異性擴增內引物FIP):?
GGTTAATAACAGACACCGATGTGG-ACAGAGATATCGACCCCT;?
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