[發(fā)明專利]一種生物樣本的數(shù)字化標(biāo)記檢測方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200910048184.8
• 申請日: 2009-03-25
• 公開（公告）號: CN101846670A
• 公開（公告）日: 2010-09-29
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 沈樹泉
• 申請（專利權(quán)）人: 沈樹泉
• 主分類號: G01N33/48
• 分類號: G01N33/48;G01N1/28;G01N21/64;G01N33/68;G01N27/62;C12Q1/68
• 代理公司: 上海科盛知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31225
• 代理人: 趙志遠(yuǎn)

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一種生物樣本的數(shù)字化標(biāo)記檢測方法，適用于生物學(xué)(包括動植物、微生物等)，藥學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。用于基因(包括DNA/RNA等)、蛋白質(zhì)及其它生物分子的精確檢測和鑒定，即定量和定性分析。

背景技術(shù)

基因和蛋白質(zhì)的精確定量和定性分析技術(shù)是推動生物學(xué)發(fā)展的關(guān)鍵技術(shù)。尤其在高通量的情況之下，對基因和蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的定量和定性分析更是制約生物學(xué)發(fā)展的瓶頸技術(shù)。研究和開發(fā)這樣的技術(shù)是當(dāng)前世界先進(jìn)國家優(yōu)先和重點支持的項目。(http://nihroadmap.nih.gov/roadmap?15update.asp)

對單一樣本的有限個數(shù)基因和蛋白質(zhì)的精確檢測，以現(xiàn)有的技術(shù)在現(xiàn)階段基本能夠做到。但是，現(xiàn)有技術(shù)的限制是成本高、檢測時間長；特別是當(dāng)樣本數(shù)量大、檢測的標(biāo)的多的情況下，現(xiàn)有技術(shù)的應(yīng)用將是耗時費力。為了能夠簡捷的、高質(zhì)量和高精確度的大批量檢測基因和蛋白質(zhì)，人們一直在探索更新的技術(shù)方法來實現(xiàn)這樣的目標(biāo)。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的就是為了克服上述現(xiàn)有技術(shù)存在的缺陷而提供一種簡捷、高質(zhì)量和高精度的進(jìn)行大批量檢測基因和蛋白質(zhì)的生物樣本的數(shù)字化標(biāo)記檢測方法。

本發(fā)明的目的可以通過以下技術(shù)方案來實現(xiàn)：生物樣本的數(shù)字化標(biāo)記檢測方法，其特征在于，該方法是以生物學(xué)方法將標(biāo)記物標(biāo)記在從生物樣本中提取的生物分子上或者通過活細(xì)胞和組織的整體生物分子標(biāo)記后再提取生物分子，然后將標(biāo)記后的各種生物樣本混合在一起，采用生物樣本檢測儀，以核算測序或熒光分析的方法鑒定標(biāo)記物的特征，并由計算機(jī)進(jìn)行分類，從而實現(xiàn)多個生物樣本的混合檢測。

所述的方法是以生物學(xué)方法將標(biāo)記物標(biāo)記在從生物樣本中提取的DNA、RNA或其它核酸序列之中包括末端或嵌插入其中。

所述的末端為DNA、RNA或其它核酸序列的3’端，5’端的任意一端或兩端。

所述的方法是以生物學(xué)方法將標(biāo)記物標(biāo)記在從生物樣本中提取的蛋白質(zhì)或多肽的末端或嵌插入其中。

所述的末端為蛋白質(zhì)或多肽的任意一端或兩端。

所述的生物學(xué)方法包括生物酶學(xué)方法和/或生物化學(xué)修飾方法。

所述的標(biāo)記物包括生物學(xué)數(shù)字標(biāo)記物，光學(xué)數(shù)字標(biāo)記物，或生物學(xué)數(shù)字標(biāo)記物和光學(xué)數(shù)字標(biāo)記物的組合。

所述的生物學(xué)數(shù)字標(biāo)記物為單核苷酸碼或多核苷酸碼，所述的光學(xué)數(shù)字標(biāo)記物為熒光物質(zhì)或熒光標(biāo)記的單核苷酸或多核苷酸碼。

所述的單核苷酸碼為所有的單核苷酸分子包括A、C、G、T，所述的多核苷酸碼為單核苷酸的任意組合，所述的熒光標(biāo)記物具有單一光譜或多光譜。

所述的生物樣本檢測儀包括核算測序儀，核酸或蛋白質(zhì)檢測儀，質(zhì)譜儀。

標(biāo)記后混合在一起的生物樣本為混合不同種屬樣本，如人、鼠、水稻樣本等。

標(biāo)記后混合在一起的生物樣本為混合同一種屬樣本，如不同病人樣本等。

標(biāo)記后混合在一起的生物樣本為混合同一個體的不同部位樣本，如心、肝和胃樣本等。

標(biāo)記后混合在一起的生物樣本為混合不同的生物分子，如DNA、RNA和其它生物分子。

與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明是以生物學(xué)方法將標(biāo)記物標(biāo)記在生物樣本上，提供了一種簡捷快速的生物樣本標(biāo)記的數(shù)字化技術(shù)。通過應(yīng)用該技術(shù)，大量的樣本能夠被捆綁在一起進(jìn)行檢測，樣本中被數(shù)字化了的基因、蛋白質(zhì)及其它生物分子能夠得到精確的定量和定性測定，測定后樣本讀取軟件將自動的將樣本和樣本中的基因和蛋白質(zhì)歸類并輸出精確的數(shù)據(jù)。

具體實施方式

下面結(jié)合具體實施例對本發(fā)明進(jìn)行詳細(xì)說明。

一種生物樣本的數(shù)字化標(biāo)記檢測方法，該方法是以生物學(xué)方法將標(biāo)記物標(biāo)記在生物樣本上。所述的標(biāo)記物包括生物學(xué)數(shù)字標(biāo)記物、光學(xué)數(shù)字標(biāo)記物或生物學(xué)數(shù)字標(biāo)記物和光學(xué)數(shù)字標(biāo)記物的組合。

1，制備生物學(xué)或光學(xué)數(shù)字化標(biāo)記物：1)生物學(xué)數(shù)字標(biāo)記物的制備-主要通過商業(yè)化的核酸合成的方法將不同的核苷酸組合成任意序列任意長度的單鏈或雙鏈核酸分子。每一類型的分子即為一種生物數(shù)碼，多個類型的分子組成數(shù)碼集。2)光學(xué)數(shù)碼標(biāo)記物的制備-利用一些分子具有熒光光譜的特性，將不同光譜的熒光分子記錄為特定熒光數(shù)碼。并用商業(yè)化的化學(xué)和生物化學(xué)方法合成各種熒光分子以作數(shù)碼之用。3)光學(xué)生物學(xué)結(jié)合型數(shù)碼的制備-將商業(yè)化的化學(xué)方法將熒光分子與生物數(shù)碼相結(jié)合，從而制備出具有光學(xué)與生物學(xué)雙特性的數(shù)碼。

2，分別提取生物樣本中的DNA/RNA和蛋白質(zhì)的生物分子：采用商業(yè)化的方法提取生物細(xì)胞或組織中的生物分子如DNA/RNA、蛋白質(zhì)和其它生物分子。必要時將生物分子預(yù)處理，如純化等。