[發明專利]豬肉質性狀相關基因TRIM54的分離核酸序列

無效

• 申請號: 200910045959.6
• 申請日: 2009-01-22
• 公開（公告）號: CN101481738A
• 公開（公告）日: 2009-07-15
• 發明（設計）人: 潘玉春;吳瀟;高運臻;譚桂芳;王起山
• 申請（專利權）人: 上海交通大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 上海交達專利事務所
• 代理人: 王錫麟;王桂忠

技術領域

本發明涉及的是一種基因工程技術領域的豬的核酸序列，特別是一種豬肉質性狀相關基因TRIM54的分離核酸序列。

背景技術

我國是世界第一豬肉生產國，但我國的豬肉生產仍未能完全自給自足，供需緊張導致我國的養豬業在過去很長的一段時間里只注重數量，而對質量要求較低。隨著生活水平和保健意識的提高，人們越來越注重膳食成分與其身體健康的關系，對食物有了更高的要求，尤其是對畜產品的要求不斷提高。豬肉作為人膳食中重要的組成部分，高蛋白、低脂肪、低膽固醇，既瘦又嫩，多汁味美的豬肉在市場上頗受消費者青睞。因此，豬肉品質成了當今世界養豬界專家共同關心研究的一項重大課題。豬肉品質在不同的國家、同一國家不同市場有不同的概念。廣泛接受的是Hofmann(1994)的定義，即豬肉品質是鮮肉物理特性和化學特性的綜合體現，主要是指感官品質、技術加工品質、營養價值和衛生質量(毒性或食品安全方面)等4個方面。具體用肌肉的pH值、顏色、系水力、嫩度、肌內脂肪含量、風味等指標來衡定。影響豬肉品質的因素很多，包括遺傳、營養、飼養營理、屠宰前處理及屠宰工藝等，其中遺傳是最重要的因素。因此，高品質豬肉種豬的育種是改善豬肉品質的重要途徑。常規育種所需要的時間比較長，而標記輔助選擇(Marker?assisted?selection，MAS)是將現代分子生物技術與常規育種方法相結合，借助分子標記選擇某一位點來改變該位點的基因頻率的過程，也稱分子輔助選擇。即通過對遺傳標記的選擇，間接實現對控制某性狀的數量性狀位點(QTL)或者基因的選擇，從而達到對該性狀進行選擇的目的。因此，標記輔助選擇相對于表型選擇的優越性在限性性狀和生長發育后期才表現的性狀上表現尤為突出。可以加快改良畜禽品種，提高動物生產效率和經濟效益。

近年來，分子水平的研究取得飛速發展，隨著動物的一些主效基因及QTL的發現和定位，已經形成了一個嶄新的分子育種領域。最具影響的是氟烷基因(Hal)也就是蘭尼定受體I(RYRI)基因。氟烷基因對于肉質的影響在于它可以引起豬的應激綜合癥(porcine?stress?syndrome，PSS)。應激綜合癥是導致PSE(Pale，soft，exudative)肉的原因。在RYRI基因的1843位的堿基由C到T的突變，引起豬應激時骨骼肌鈣離子的非正常釋放，造成肌肉呈灰色、質地柔軟、具滲出性和水性。肌內脂肪(IMF)含量與豬肉的感官特性相關，與肉的嫩度及風味等食用品質密切相關，并且在各個豬的品種間肌內脂肪的含量有很大的差別，心臟脂肪酸結合蛋白基因(Heart?Fatty?AcidBinding?Protein?H-FABP)是影響肌內脂肪沉積的重要因素。Gerben?et?al(1997)報道了在豬的H-FABP基因上有多態性位點(HaeIII，MspI，HinfI)，不同基因型對應的IMF和背膘的厚度不同。此外，與豬肉質性狀相關的還有酸肉基因、黑素皮質激素受體-4基因、瘦素受體基因、過氧化物酶增殖激活因子、鈣蛋白酶抑制蛋白基因、脂肪細胞決定和分化因子1基因等等。

TRIM基因家族是近年來越來越受到重視的一個蛋白家族，該家族在結構上保守，顯著特點是具有3個結構域(tripartite?motif)，這3個結構域從N端到C端依次是鋅指結構域(RING?finger)、1或2個B-box、1個卷曲螺旋(coiled-coil)結構域，其中，B-box是TRIM家族的特征結構域，TRIM的名稱也由此而來。目前在人類已經發現了60多個TRIM家族的蛋白成員。TRIM54是該家族一個亞家族的成員，又稱為肌肉特異表達因子。已有研究發現TRIM54基因在肌肉內肌原纖維節裝配的過程中與該亞家族另外兩個成員(TRIM55或TRIM63)以二聚體的形式發揮作用。人類TRIM54基因的基因組全長24708bp，包含10個外顯子和9個內含子部分。TRIM54基因有兩個剪切體，剪切體1的mRNA長分別為1770bp，CDS長為1203bp；剪切體2的mRNA長分別為1644bp，CDS長為1077bp。人類TRIM54基因位于2號染色體的p23.3區。TRIM54基因在豬中的研究尚未有報道，其與豬肉質性狀間的關系尚不明確，而研究豬TRIM54基因突變位點在群體中的多態性，并進行性狀關聯分析是研究該基因功能的一個非常有力的手段，因此對這個基因進行了多態研究和關聯分析，以期能夠得到與豬肉質性狀相關的分子標記用于豬肉質性狀改良。

發明內容