[發明專利]水稻抗條紋葉枯病主效基因位點qSTV11的分子標記方法

有效

• 申請號: 200910024610.4
• 申請日: 2009-02-25
• 公開（公告）號: CN101487050A
• 公開（公告）日: 2009-07-22
• 發明（設計）人: 萬建民;江玲;張迎信;劉世家;王寶祥;王琦;陳亮明;劉喜
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 南京經緯專利商標代理有限公司
• 代理人: 張素卿

一、技術領域

本發明提供了抗水稻條紋葉枯病主效基因位點qSTV11的分子標記方法，屬于分子遺傳學領域，專用于水稻條紋葉枯病抗性品種的選育與種質資源的篩選利用。

二、背景技術

水稻條紋葉枯病是由水稻條紋病毒引起的病毒病，其傳毒介體主要是灰飛虱。近年隨著免耕、稻套麥、麥套稻等輕型栽培技術以及感病高產品種的推廣應用，加速了水稻條紋葉枯病的媒介灰飛虱帶毒群體的擴大和危害。灰飛虱的刺吸時間短、持久傳毒等特性，使治蟲防病十分困難，使我國水稻條紋葉枯病的發生逐年加重。特別在江蘇省已成為有史以來罕見的重大爆發性病害，全省病害的重發區包括蘇北和蘇中的淮安、連云港、宿遷、鹽城、泰州、揚州、建湖等地區以及南通的局部地區，而鎮江、徐州、南京等地區也呈加重趨勢。重病區發病面積占水稻種植面積的90％以上，重災區的漏防田塊病穴率高達90％、病株率達70％以上，有的田塊基本失收，造成了巨大的經濟損失。目前生產上主要結合耕作制度調整、栽培技術改進，適期治蟲防病，但效果不佳，并且污染環境。最經濟有效的方法仍是選用優良抗病品種，利用品種自身的抗性達到主動防治的目的。因此，挖掘新抗源，培育高抗條紋葉枯病水稻新品種具有重要的理論及現實意義。由于條紋葉枯病表型鑒定十分困難，培育抗條紋葉枯病水稻品種的進程異常緩慢，利用分子標記輔助選擇方法可以有效解決這一難題。

三、發明內容

技術問題

本發明的目的是：提供水稻抗條紋葉枯病主效基因位點qSTV11的分子標記方法，通過檢測與該位點緊密連鎖的分子標記，可以預測水稻植株對條紋葉枯病的抗性，加快抗條紋葉枯病水稻品種的選育進度。

技術方案

水稻抗條紋葉枯病主效基因位點的分子標記方法，其特征在于：

利用分子標記引物R21：

左端序列：5′CAACGTGGTTGATTGTTC?3′

右端序列：5′TTGCCAGGTTAGTTGTAC?3′

或者用分子標記引物R22：

左端序列：5′GAGGCAAGCCAATGTCGT?3′

右端序列：5′CACAAATCAGCGAAGAAA??3′

或者用分子標記引物R13：

左端序列：5′AACATCGGCTACCACCAAAA??3′

右端序列：5′GAATGCTTCGTCGTTCTCAA?3′

或者用分子標記引物R48：

左端序列：5′GCCTTCATCCGTAAATCCATAAGC?3′

右端序列：5′GAGTACCACATGGCATTATGAGAGC?3′

擴增水稻品種、品系或育種材料的DNA，如果用分子標記引物R21能夠擴增出150bp，或者用分子標記引物R22能夠擴增出170bp，或者用分子標記引物R13能夠擴增出242bp，或者用分子標記引物R48和能夠擴增出183bp的擴增片段，均標志著水稻條紋葉枯病抗性位點qSTV11的存在，該主效基因位點位于水稻第11染色體，利用SAS軟件測得與條紋葉枯病抗性不相關的概率P值為0.001，對條紋葉枯病抗性的貢獻率為35.79％。

有益效果

本發明利用Nipponbare/Kasalath//Nipponbare回交重組自交系群體，采用集團接種、田間鑒定和強迫飼毒的鑒定方法，在第11染色體標記區間S2260-G257均能檢測到1個主效QTL，表明該QTL在不同的環境條件下都能穩定表達。然而，由于與該QTL緊密連鎖的S2260和G257均為RFLP標記，難以用于輔助選擇育種，因此篩選與該位點緊密連鎖的SSR標記，無疑可以加速標記輔助選擇技術在條紋葉枯病抗性品種選育過程中的利用。

本發明所提供水稻條紋葉枯病抗性主效基因位點qSTV11的可育種利用分子標記方法，具有以下優點：

通過本發明分子標記在國際上首次獲得定位了水稻品種Kasalath抗條紋葉枯病的主效基因位點，可解釋35.79％的條紋葉枯病抗性。水稻條紋葉枯病抗性的研究十分困難，對水稻條紋葉枯病抗性位點的精確定位工作居于同領域前列；

通過本發明分子標記定位的主效基因位點位置明確，鑒定方便。通過檢測與該位點緊密連鎖的分子標記，即可以預測水稻植株的條紋葉枯病抗性，用于水稻品種或品系的基因型檢測，以判斷該品種或品系是否具有抗條紋葉枯病，進而快速篩選抗病品種或品系用于水稻育種。主效基因位點的檢測方便快速，不受環境影響；