[發(fā)明專利]一種三疣梭子蟹多元高通量遺傳標(biāo)記系統(tǒng)及遺傳分析方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 200910015428.2 | 申請日: | 2009-05-15 |
| 公開(公告)號: | CN101565744A | 公開(公告)日: | 2009-10-28 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 崔朝霞;王鴻霞;譚烽;劉媛;吳丹華 | 申請(專利權(quán))人: | 中國科學(xué)院海洋研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 沈陽科苑專利商標(biāo)代理有限公司 | 代理人: | 許宗富;周秀梅 |
| 地址: | 26607*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 梭子蟹 多元 通量 遺傳 標(biāo)記 系統(tǒng) 分析 方法 | ||
1.一種三疣梭子蟹多元高通量遺傳標(biāo)記系統(tǒng),其特征在于:所述多元高通量遺傳標(biāo)記系統(tǒng)為線粒體序列信息系統(tǒng)和微衛(wèi)星分子標(biāo)記系統(tǒng),其中微衛(wèi)星分子標(biāo)記系統(tǒng)為由7個SSR標(biāo)記的系統(tǒng)1和6個SSR標(biāo)記的系統(tǒng)2組成;
系統(tǒng)1由7個SSR標(biāo)記組成,擴增7個SSR標(biāo)記的7對引物分別是
E13F:AAGGAGGAGGCTTTGATATG;R:GTCTTCCACTCCCTTACTGT;
P04F:GCCACTATCTTGCTGAGGTTGA;R:GCCATAGCACGAACACTTTTGA;
E20F:CCTCAGGGCAGCTCTGGAT;R:CCCGGACTAGGTGACAGGTT;
E24F:AACTATGGGTCCTGAGTATTA;R:CTCGGTTTCTGTCCACTT;
C13F:CTGTCTGATGAGTGAGGCTAC;R:TGACCACGAGGAAAGGAG;
C31F:TATAAGGGCTTAAGTGTACG;R:GATCTAAACTCAAGGCAAAA;
H4F:AATCACTTCACTACACCTTTT;R:CTTG?ATGGGTGGCAGTCT??;
系統(tǒng)2由6個SSR標(biāo)記組成,擴增6個SSR標(biāo)記的6對引物分別是
E9F:TACTGAGACGCCGCTGGTTA;R:ACAAGATCCTTCGTGGTGGG;
E18F:CCACAACTGCAAACACCT;R:TTGGCATTTTCATCACTTAC;
E28F:CGTTACTGAAAGAGTGGTGAA;R:GCAGAGGTTGTACCACCG;
C14F:AGTGAGATTAACGCAACT;R:CATCTTTCATTACAGGGA;
H13F:ATGGGCAAGCCTCTTAATGT;R:GGATCTTCGGGTAGGACTGA;
E17F:ATAAATATCTTGGAAGCCCTCA;R:ACGCCACATAGAACACTCACTC,
所述線粒體序列信息系統(tǒng),擴增COI,16S和CR序列的三對引物分別是LCO1490:GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG和HCO2198:TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA;16Sar-L:CGCCTGTTTATCAAAAACAT和16Sbr-H:CCGGTCTGAACTCAGATCACGT;12ST:AGGAATTAAGAAACAATCAAACTTT和CRT:GCCGTTGAGTGAAGAGTGTTCAGATAG;
其遺傳分析方法具體為:
首先,運用線粒體的三對引物擴增COI,16S和CR的序列的信息作為分子標(biāo)記,將混養(yǎng)家系中同一母本和不同母本所產(chǎn)的后代根據(jù)遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性分開,然后再運用微衛(wèi)星分子標(biāo)記,將已區(qū)分母本的后代根據(jù)遺傳距離和遺傳多樣性進行父本的區(qū)分,從而完成三疣梭子蟹遺傳育種過程中的系譜認(rèn)證并確認(rèn)近交系數(shù)。
2.一種按權(quán)利要求1所述的三疣梭子蟹多元高通量遺傳標(biāo)記系統(tǒng)的遺傳分析方法,其特征在于:首先,運用線粒體的三對引物擴增COI,16S和CR的序列的信息作為分子標(biāo)記,將混養(yǎng)家系中同一母本和不同母本所產(chǎn)的后代根據(jù)遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性分開,然后再運用微衛(wèi)星分子標(biāo)記,將已區(qū)分母本的后代根據(jù)遺傳距離和遺傳多樣性進行父本的區(qū)分,從而完成三?疣梭子蟹遺傳育種過程中的系譜認(rèn)證并確認(rèn)近交系數(shù)。
3.按權(quán)利要求2所述的三疣梭子蟹多元高通量遺傳標(biāo)記系統(tǒng)的遺傳分析方法,其特征在于:所有引物方向為5′-3′方向。?
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