[發明專利]調節端粒酶活性的化合物的鑒定方法

無效

• 申請號: 200880112672.4
• 申請日: 2008-10-21
• 公開（公告）號: CN101835899A
• 公開（公告）日: 2010-09-15
• 發明（設計）人: 埃曼努埃爾·斯科達拉克斯
• 申請（專利權）人: 威斯特研究所
• 主分類號: C12Q1/48
• 分類號: C12Q1/48
• 代理公司: 中原信達知識產權代理有限責任公司 11219
• 代理人: 張穎;樊衛民

1.用于鑒定調節端粒酶活性的化合物的方法，包括

(a)設計或篩選與端粒酶TRBD結構域的至少一個氨基酸殘基結合的化合物；以及

(b)測試在(a)中設計或篩選的化合物調節端粒酶活性的能力，由此鑒定調節端粒酶活性的化合物。

2.權利要求1的方法，其中TRBD結構域包含嗜熱四膜蟲(T.thermophila)端粒酶的254-519位氨基酸殘基，或它們在來自其他物種的端粒酶中的等價氨基酸殘基。

3.權利要求1或2的方法，其中化合物與TRBD結構域的CP-基序、T-基序和/或QFP-基序的至少一個氨基酸殘基結合。

4.權利要求1、2或3的方法，其中化合物與表1中顯示的至少一個氨基酸殘基結合。

5.用于鑒定調節端粒酶活性的化合物的方法，包括

(a)設計或篩選與核苷酸結合口袋的至少一個氨基酸殘基結合的化合物；以及

(b)測試在(a)中設計或篩選的化合物調節端粒酶活性的能力，由此鑒定調節端粒酶活性的化合物。

6.權利要求5的方法，其中化合物與表1中顯示的手指亞結構域和/或手掌亞結構域的至少一個氨基酸殘基結合。

7.權利要求5或6的方法，其中化合物與選自下列的至少一個氨基酸殘基結合：赤擬谷盜(T.castaneum)端粒酶的K189、R194、Y256、Q308、V342和K372，或它們在來自其他物種的端粒酶中的等價氨基酸殘基。

8.用于鑒定調節端粒酶活性的化合物的方法，包括

(a)設計或篩選與直接接觸DNA的至少一個氨基酸殘基結合的化合物；以及

(b)測試在(a)中設計或篩選的化合物調節端粒酶活性的能力，由此鑒定調節端粒酶活性的化合物。

9.權利要求8的方法，其中化合物與表2中顯示的拇指亞結構域和/或手掌亞結構域的至少一個氨基酸殘基結合。

10.權利要求8或9的方法，其中化合物與選自下列的至少一個氨基酸殘基結合：赤擬谷盜(T.castaneum)端粒酶的K210、K406、K416、K418和N423，或它們在來自其他物種的端粒酶中的等價氨基酸殘基。

11.前述權利要求任一項的方法，其中化合物與至少2、3、4、5、6個或以上氨基酸殘基結合。

12.前述權利要求任一項的方法，其中端粒酶是嗜熱四膜蟲(Tetrahymena?thermophila)，擬南芥(Arabidopsis?thaliana)，智人(Homosapiens)，粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces?pombe)，小鼠(Musmusculus)，釀酒酵母(Saccharomyces?cerevisiae)，Oxytricha?trifallax，小腔游仆蟲(Euplotes?aediculatus)或赤擬谷盜(Tribolium?castaneum)的端粒酶。

13.前述權利要求任一項的方法，其中步驟(a)在計算機上進行。

14.前述權利要求任一項的方法，其中步驟(a)在體外進行。

15.權利要求1-14任一項的方法，其中化合物抑制端粒酶活性。

16.權利要求1-14任一項的方法，其中化合物刺激端粒酶活性。

17.前述權利要求任一項的方法，其中化合物與沒有被通過突變鑒定為影響核苷酸結合、RNA結合、DNA結合或端粒酶活性的氨基酸殘基結合。

18.前述權利要求任一項的方法，其中化合物將端粒酶的活性與沒有接觸化合物的端粒酶相比調節至少30％。

19.通過前述任一項權利要求的方法鑒定的化合物。