[發明專利]鹽屋霉素的生物合成基因簇無效
| 申請號： | 200810202417.0 | 申請日： | 2008-11-07 |
| 公開（公告）號： | CN101423837A | 公開（公告）日： | 2009-05-06 |
| 發明（設計）人： | 劉文;段煉;虞沂;廖日晶;雷春;丁瑩 | 申請（專利權）人： | 中國科學院上海有機化學研究所 |
| 主分類號： | C12N15/54 | 分類號： | C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195 |
| 代理公司： | 上海新天專利代理有限公司 | 代理人： | 鄔震中 |
| 地址： | 200032*** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 霉素 生物 合成 基因 | ||
1.一種抗革蘭氏陽性菌活性的抗生素—鹽屋霉素的生物合成基因簇，其特征在于編碼鹽屋霉素生物合成所涉及的21個基因，具體為：
1)1個氨基轉移酶基因，即sioA：
sioA位于基因簇核苷酸序列第11552-10491個堿基處，長度為1062個堿基對，氨基轉移酶，353個氨基酸；
2)脂肪酶基因，即sioB：
sioB位于基因簇核苷酸序列第12421-11597個堿基處，長度為825個堿基對，編碼脂肪酶，274個氨基酸；
3)天門冬酰胺合成酶基因，即：sioC
sioC位于基因簇核苷酸序列第14359-12500個堿基處，長度為1860個堿基對，編碼天門冬酰胺合成酶，619個氨基酸；
4)酯環化酶基因，即基因sioD：
sioD位于基因簇核苷酸序列第個14789-14382堿基處，長度為408個堿基對，編碼酯環化酶，135個氨基酸；
5)?；?CoA脫氫酶基因，即sioE：
sioE位于基因簇核苷酸序列第16066-14834個堿基處，長度為1233個堿基對，編碼?；?CoA脫氫酶，410個氨基酸；
6)甲基轉移酶基因，即sioF：
sioF位于基因簇核苷酸序列第16974-16090個堿基處，長度為885個堿基對，編碼甲基基轉移酶，294個氨基酸；
7)具體功能未知的基因，即：sioG：
sioG位于基因簇核苷酸序列第17554-17000個堿基處，長度為555個堿基對，編碼一個未知功能蛋白，184個氨基酸；
8)前體肽基因，即sioH：
sioH位于基因簇核苷酸序列第17889-18074個堿基處，長度為186個堿基對，編碼Siomycin前體肽，61個氨基酸；
9)水解酶基因，即sioI：
sioI位于基因簇核苷酸序列第18770-19555個堿基處，長度為786個堿基對，編碼水解酶，261個氨基酸；
10)脫水酶基因，即sioJ：
sioJ位于基因簇核苷酸序列第19548-22196個堿基處，長度為2649個堿基對，編碼脫水酶，882個氨基酸；
11)脫水酶基因，即sioK：
sioK位于基因簇核苷酸序列第22193-23197個堿基處，長度為1005個堿基對，編碼脫水酶，334個氨基酸；
12)催化D-A反應酶基因，即sioL：
sioL位于基因簇核苷酸序列第23194-24306個堿基處，長度為1113個堿基對，編碼一個具體功能未知的蛋白，370個氨基酸；
13)NADH依賴的氧化酶基因，即sioM：
sioM位于基因簇核苷酸序列第24303-25967個堿基處，長度為1665個堿基對，編碼NADH依賴的氧化酶，554個氨基酸；
14)與Siomycin大環合成相關具體功能未知基因，即sioN：
sioN位于基因簇核苷酸序列第25964-27676個堿基處，長度為1713個堿基對，編碼一個具體功能未知的蛋白，570個氨基酸；
15)環化酶基因，即sioO：
sioO位于基因簇核苷酸序列第27673-29616個堿基處，長度為1944個堿基對，編碼一個具體功能未知的蛋白，647個氨基酸；
16)細胞色素P450氧化酶基因，即sioP：
sioN位于基因簇核苷酸序列第29594-30943個堿基處，長度為1350個堿基對，編碼細胞色素P450氧化酶，449個氨基酸；
17)?；?CoA合成酶，即sioQ：
sioQ位于基因簇核苷酸序列第30919-32220個堿基處，長度為1302個堿基對，編碼?；?CoA合成酶，433個氨基酸；
18)細胞色素P450氧化酶基因，即sioR：
sioR位于基因簇核苷酸序列第32192-33424個堿基處，長度為1233個堿基對，編碼細胞色素氧化酶，410個氨基酸；
19)脫水酶基因，即sioS：
sioS位于基因簇核苷酸序列第33412-36018個堿基處，長度為2607個堿基對，編碼脫水酶，868個氨基酸；
20)硫腺苷甲硫氨酸轉移酶基因，即sioT：
sioT位于基因簇核苷酸序列第36030-37805個堿基處，長度為1776個堿基對，編碼一個硫腺苷甲硫氨酸轉移酶，591個氨基酸；
21)短鏈脫氫酶基因，即sioU：
sioU位于基因簇核苷酸序列第37802-38569個堿基處，長度為768個堿基對，編碼一個脫氫酶，255個氨基酸。
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