[發明專利]用于多聚核苷酸檢測和定量的設備

無效

• 申請號: 200810094712.9
• 申請日: 2003-06-19
• 公開（公告）號: CN101348763A
• 公開（公告）日: 2009-01-21
• 發明（設計）人: 弗拉基米爾·I·斯列普尼奧夫
• 申請（專利權）人: 普里梅拉生物系統有限公司
• 主分類號: C12M1/00
• 分類號: C12M1/00;C12M1/34;C12Q1/68
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司
• 代理人: 劉曉東;彭鯤鵬

本申請是申請號為03817245.3之中國專利申請的分案申請，原申請03817245.3 是根據專利合作條約的國際申請(PCT/US03/19518)進入中國國家階段的國家申請。

發明領域

本發明涉及用于檢測和定量多聚核苷酸的自動化設備。

發明背景

基因組的介入已經在加速藥物發現的步伐方面起作用。基因組技術已經在發現 新的藥物靶點方面證實了它們的價值。該領域的進一步改進將提供更有效的工具， 使更快、更節約成本地開發潛在的藥物。

藥物發現過程包括以下幾個步驟：鑒定與疾病相關的潛在生化靶點，篩選活性 化合物，并進一步化學設計，臨床前測試，最后進行臨床試驗。該過程的效率仍離 完美相去甚遠：花費在研究和開發過程基金中的金錢估計約75％都是走向失敗。另 外，產品開發中失敗發生地越晚，與該項目相關的損失也就越大。因此，有必要早 期消除將會發生的失敗，以大大節省整個藥物開發過程的成本。這樣，原始分子靶 點的質量就成為了節省成本的藥物開發的決定性因素。

能夠影響靶點鑒定和證實有效性的一個方法是繪制轉錄譜。該方法對特定條件 下的基因表達進行比較：例如疾病細胞和正常細胞之間、對照細胞和藥物處理細胞 之間或治療響應細胞和治療耐受細胞之間的基因表達。該方法產生的信息可以直接 鑒別治療所靶向的特定基因，重要的是顯示疾病和治療中涉及的生化途徑。簡要地 說，繪制轉錄圖譜不僅提供生化靶點，還同時提供評估這些靶點質量的方法。另外， 和基于細胞的篩選聯用，繪制轉錄圖譜將大大改變藥物發現領域。使用表型變化作 為功能細胞系統的標記物來篩選潛在藥物歷來都是成功的。例如，監測培養物中腫 瘤細胞的生長來鑒定抗癌藥物。同樣，細菌的生存能力被用于針對鑒定抗生素化合 物的分析中。通常在不知道靶向生化途徑的前提下進行這種篩選。事實上，鑒定到 的有效化合物揭示出這種途徑，并指出真正的分子靶點，使隨后的下一代藥物的合 理設計能夠進行。

可以使用繪制轉錄圖譜的現代化工具來設計新的篩選方法，這些篩選方法將利 用基因表達代替表型變化來評價藥物的有效性。例如，這些方法描述在美國專利 No.5,262,311；5,665,547；5,599,672；5,580,726；6,045,988和5,994,076；以及Luehrsen et?al.(1997)，Biotechniques，22：168-74；Liang?and?Pardee(1998，Mol?Biotechnol. 10：261-7)。對于諸如癡呆、輕度認知障礙、抑郁等中樞神經系統(CNS)疾病領域 中的藥物發現來說，這類方法的價值是不可估量的，這些領域中表型篩選是不適用 的，但易于建立期望的轉錄譜，并將之與特定的疾病相聯系。鑒定到的有效化合物 將揭示出潛在的分子過程。另外，該方法可有助于開發現有藥物的改進形式，這種 改進的藥物能同時作用于多個生化靶點，產生所需的藥理效果。在這種情況下，和 根據對多靶點結合的優化進行篩選相比，轉錄應答的變化對藥物作用是一種更好的 標記物。

在本發明之前，繪制轉錄譜最先進的方法是基于使用DNA微陣列的技術，舉 例來說，這些技術評論在Greenberg，2001?Neurology?57：755-61；Wu，2001，J?Pathol. 195：53-65；Dhiman?et?al.，2001，Vaccine?20：22-30；Bier?et?al.，2001?Fresenius?J?Anal Chem.371：151-6；Mills?et?al.，2001，Nat?Cell?Biol.3：E175-8中；并描述在美國專利 No.5,593,839；5,837,832；5,856,101；6,203,989；6,271,957和6,287,778中。DNA微 陣列是通過評價標記多聚核苷酸樣品與結合在受試陣列表面上的DNA分子的雜交， 同時比較給定樣品中幾千種基因表達的方法，其中所述標記的多聚核苷酸樣品通過 mRNA的逆轉錄獲得。雖然現有技術提供有關轉錄變化的有價值的信息，但離完美 相去甚遠，還存在有一些問題和缺陷。