[發(fā)明專利]流感病毒聚合酶亞基PA的表達(dá)純化及PA氨基端及PA羧基端與PB1氨基端多肽復(fù)合體的晶體結(jié)構(gòu)

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200810083994.2
• 申請日: 2008-05-02
• 公開（公告）號: CN101514335A
• 公開（公告）日: 2009-08-26
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 劉迎芳;賀曉靜;曾宗浩;周杰
• 申請（專利權(quán)）人: 中國科學(xué)院生物物理研究所
• 主分類號: C12N9/00
• 分類號: C12N9/00;C12N15/44;C12N15/62;C12N15/63;C07K1/14;G01N33/68;A61K38/00;A61P31/16
• 代理公司: 北京康信知識產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司
• 代理人: 李丙林;張 英

1.一種流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C與PB1的氨基端 PB1_N的復(fù)合體的晶體，所述流感病毒為A型流感病毒，其中 所述流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C為所述流感病毒聚 合酶亞基PA的從257位氨基酸至716位氨基酸，所述PB1 的氨基端PB1_N為所述流感病毒聚合酶亞基PB1的氨基末端 PB1_N的25個氨基酸的短肽，其中所述晶體中的原子具有表1 中所列的原子坐標(biāo)，所述復(fù)合體的晶體具有P4(1)2(1)2的空間 群，晶胞參數(shù)為約：α＝b＝122埃，c＝133埃，α＝β＝γ＝90°。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C與PB1的氨基端PB1_N的復(fù)合體的晶體，其中所述A型流感 病毒的聚合酶亞基PA的羧基端PA_C由以下結(jié)構(gòu)構(gòu)成第一部 分：由406-414位的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋4，由440-450 位的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋5，由583-603位的氨基酸區(qū) 段組成的α螺旋8，由608-613的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋 9，由633-649位的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋10，由653-673 位的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋11，由683-691位的氨基酸區(qū) 段組成的α螺旋12，由698-714位的氨基酸區(qū)段組成的α螺 旋13，以及由619-623位氨基酸區(qū)段組成的β片8和由628 -631氨基酸區(qū)段組成得β片9；其中所述A型流感病毒的聚 合酶亞基PA的羧基端PA_C的第二部分的折疊片層主要包括以 下β折疊片：由290-292位的氨基酸區(qū)段組成的β片1，由 317-324位的氨基酸區(qū)段組成的β片2，由480-491位的氨 基酸區(qū)段組成的β片3，由496-506位的氨基酸區(qū)段組成的β 片4，由517-526位的氨基酸區(qū)段組成的β片5，由541-550 位的氨基酸區(qū)段組成的β片6，由557-571位的氨基酸區(qū)段 組成的β片7；在所述A型流感病毒的聚合酶亞基PA的羧基 端PA_C中，由303-311位的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋1，由 331-349位的氨基酸區(qū)段組成的α螺旋2，由364-369位的 氨基酸區(qū)段組成的α螺旋3，由454-475位的氨基酸區(qū)段組 成的α螺旋6，以及由572-578位的氨基酸區(qū)段組成的α螺 旋7，圍繞在所述PA的羧基端PA_C第二部分的β折疊片周圍。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C與PB1的氨基端PB1_N的復(fù)合體的晶體，其中所述A型流感 病毒的聚合酶亞基PA的羧基端PA_C主要通過α螺旋4、α螺 旋8、α螺旋10、α螺旋11和α螺旋13參與與PB1的氨基端 PB1_N相互作用。

4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C與PB1的氨基端PB1_N的復(fù)合體的晶體，其中至少一個選自由 流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C的α螺旋4的Phe411、 α螺旋11的Leu666、α螺旋13的Phe710、α螺旋10的Val636、 Leu640、α螺旋13的Trp706、α螺旋11的Gln670構(gòu)成的組 中的氨基酸參與與所述流感病毒聚合酶亞基PB1_N的相互作 用。

5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的流感病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C與PB1的氨基端PB1_N的復(fù)合體的晶體，其中所述A型流感 病毒聚合酶亞基PA的羧基端PA_C中的介于α螺旋9及α螺旋 10之間的環(huán)形肽段中至少一個選自由Ile621、Gly622、Glu623、 Thr618和Pro620構(gòu)成的組中的氨基酸參與與所述流感病毒聚 合酶亞基PB1的相互作用。