[發明專利]一種新穎堿基和核苷及其衍生物的NMR氫譜化學位移預測方法無效
| 申請號: | 200810070172.0 | 申請日: | 2008-08-25 |
| 公開(公告)號: | CN101344900A | 公開(公告)日: | 2009-01-14 |
| 發明(設計)人: | 梁桂兆;牛維環;李志良 | 申請(專利權)人: | 重慶大學 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
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| 地址: | 400044重*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 新穎 堿基 核苷 及其 衍生物 nmr 化學 位移 預測 方法 | ||
1.一種新穎堿基和核苷及其衍生物的NMR氫譜化學位移預測方法,其特征在于包括如下步驟:
a)從分子二維拓撲結構出發,根據原子之間相互作用方式和自身所處狀態得到用于描述原子所處分子微觀化學環境和雜化狀態的原子電性作用矢量和原子雜化狀態指數;
b)應用原子電性作用矢量和原子雜化狀態指數對堿基、核苷及其衍生物的結構進行表征;
c)用多元線性回歸技術建立NMR氫譜化學位移預測模型,并采用留一法和留分子法交互校驗評價模型的穩定性和預測能力。
2.根據權利要求1的一種新穎堿基和核苷及其衍生物的NMR氫譜化學位移預測方法,其特征在于步驟a)具體包括如下步驟:
a1)將分子中的原子按元素周期表主族分類,得到按主族分類的5類不同原子電性對目標原子按距離6次方遞減的作用項;
a2)定義原子的相對電負性和相對鍵長,進而計算原子電性作用矢量;
a3)對原子固有狀態進行修正,得到原子雜化狀態指數,用于表征原子自身的雜化類型。
3.根據權利要求2的一種新穎堿基和核苷及其衍生物的NMR氫譜化學位移預測方法,其特征在于步驟b)具體包括:應用原子電性作用矢量和原子雜化狀態指數對堿基、核苷及其衍生物的結構進行表征。
4.根據權利要求1至3中任一項的一種新穎堿基和核苷及其衍生物的NMR氫譜化學位移預測方法,其特征在于步驟c)利用多元線性回歸技術建立NMR氫譜化學位移預測模型,并采用留一法和留分子法交互校驗評價模型的穩定性和預測能力。
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G06F19-16 ..用于分子結構的,例如:結構排序,結構或功能關系,蛋白質折疊,結構域拓撲,用結構數據的藥靶,涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的,例如:基因型–表型關聯,不均衡連接,種群遺傳學,結合位置鑒定,變異發生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用





