[發(fā)明專利]一種用于胃組織的高表達(dá)piRNA探針及其檢測方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200810062072.3
• 申請日: 2008-05-22
• 公開（公告）號: CN101289693A
• 公開（公告）日: 2008-10-22
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 郭俊明;肖丙秀;蔣振
• 申請（專利權(quán)）人: 寧波大學(xué)
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 寧波海曙奧圣專利代理事務(wù)所
• 代理人: 程曉明

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及piRNA，具體涉及一種用于檢測胃組織的高表達(dá)piRNA探針及其檢測方法。

背景技術(shù)

真核基因組中除了有編碼蛋白質(zhì)的基因外，還有一大部分DNA被轉(zhuǎn)錄成非編碼RNA(noncoding?RNAs，ncRNAs)。近年來的研究發(fā)現(xiàn)，許多ncRNA可在多個層次上調(diào)節(jié)著基因的表達(dá)，特別是小RNA在基因表達(dá)調(diào)控中的作用及其與疾病發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系越來越引起了人們的重視。前期研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了2類對基因表達(dá)有重要調(diào)控作用的小RNA——短干擾RNA(short?interfering?RNA，siRNA)和微小RNA(microRNA，miRNA)。

2006年俄羅斯、日本和美國的四家實驗室?guī)缀跬瑫r報道，在生物體內(nèi)存在除siRNA和miRNA以外的另一類小RNA。這些小RNA與前2類小RNA的主要區(qū)別在于其長度更長(約為30個核苷酸)和采用不同的機制實現(xiàn)對基因表達(dá)的調(diào)控。因此，這類RNA被稱為第三類小RNA。目前已從多種生物中發(fā)現(xiàn)了第三類小RNA。研究發(fā)現(xiàn)，它們可與小鼠和大鼠的阿格蛋白亞家族Piwi相互作用，因此根據(jù)其功能將其命名為Piwi相互作用RNA(Piwi-interacting?RNA，piRNA)。

阿格蛋白(argonaute?protein)的主要功能與小分子RNA相關(guān)的基因沉默作用有密切關(guān)系。RNA沉默作用通過降解mRNA、抑制翻譯和重建染色體等方式調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。RNA沉默主要通過RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RNA-induced?silencing?complex，RISC)和轉(zhuǎn)錄的基因沉默RNA誘導(dǎo)起始復(fù)合物(RNA-induced?initiation?of?transcriptional?genesilencing，RITS)來發(fā)揮作用。這些復(fù)合物的主要成分包括小分子RNA和阿格蛋白。阿格蛋白家族是在所有RISC和RITS復(fù)合物中均存在的唯一共同成分。這說明阿格蛋白在小分子RNA相關(guān)的RNA沉默機制中具有獨特的功能。也說明piRNA在基因表達(dá)調(diào)控中起著重要作用。

我國是胃癌高發(fā)區(qū)，現(xiàn)有的技術(shù)中均沒有涉及到胃組織的癌變與哪些高表達(dá)的piRNA有關(guān)。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種用于檢測胃癌組織的piRNA異常表達(dá)的探針，還提供了利用該探針檢測胃癌組織的piRNA高表達(dá)的方法。

本發(fā)明解決上述技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案為：一種用于胃組織的高表達(dá)piRNA探針，探針的序列由化學(xué)修飾過的寡聚核苷酸編碼片段和延伸臂片段組成，所述的寡聚核苷酸編碼片段為至少一種下述piRNA序列：hsa_piR_009466，hsa_piR_005270，hsa_piR_000663，hsa_piR_012518，hsa_piR_001302，hsa_piR_000562，hsa_piR_001048，hsa_piR_002062和hsa_piR_011186。

所述的寡聚核苷酸編碼片段為hsa_piR_009466序列。

所述的寡聚核苷酸編碼片段為hsa_piR_009466序列和hsa_piR_005270序列組成。

所述的寡聚核苷酸編碼片段為hsa_piR_009466序列、hsa_piR_005270序列和hsa_piR_000663序列組成。

所述的寡聚核苷酸編碼片段還包括下述piRNA序列：hsa_piR_001809，hsa_piR_000139，hsa_piR_001184，hsa_piR_001205，hsa_piR_001318，hsa_piR_011187，hsa_piR_000775和hsa_piR_000651。

所述的寡聚核苷酸編碼片段為hsa_piR_009466序列和hsa_piR_001809序列組成。

所述的寡聚核苷酸編碼片段還包括下述piRNA序列：hsa_piR_001040，hsa_piR_001159，hsa_piR_000823，hsa_piR_000121、hsa_piR_001934，hsa_piR_000794，hsa_piR_000441和hsa_piR_000560。

所述的寡聚核苷酸編碼片段為hsa_piR_009466序列和hsa_piR_001040序列組成。

所述的寡聚核苷酸編碼片段為hsa_piR_009466序列、hsa_piR_001809序列和hsa_piR_001040序列組成。