[發明專利]人丙肝病毒的人工假病毒及其制備和應用有效
| 申請號: | 200810041872.7 | 申請日: | 2008-08-19 |
| 公開(公告)號: | CN101372683A | 公開(公告)日: | 2009-02-25 |
| 發明(設計)人: | 張鋆;邵俊斌 | 申請(專利權)人: | 上海之江生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N7/01 | 分類號: | C12N7/01;C12N15/867;C12N5/10;C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海光華專利事務所 | 代理人: | 許亦琳;余明偉 |
| 地址: | 201203上海市浦東新區*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 丙肝 病毒 人工 及其 制備 應用 | ||
技術領域
本發明涉及人丙肝病毒的人工假病毒。
背景技術
HCV檢測時,有以下三個主要步驟需要陽性參照:
1.從標本中提取HCV?RNA,包括:病毒外膜、核衣殼打開/破碎,核酸釋放。
2.HCV?RNA被逆轉錄(也稱反轉錄)為cDNA。
3.cDNA與PCR反應液和DNA多聚酶混合,在PCR儀中擴增并得到信號。
現有的陽性參照,主要有下述幾種來源:病人血清(/血制品);體內或體外轉錄RNA; 質粒或化學合成。
所有陽性參照中,最準確貼切的陽性參照應該是含該HCV病毒的天然樣本(如病人血 液、肝組織),同質性可充分保證其作為前述三個步驟的陽性參照,但其缺陷在于天然樣本 來源少,且由于含有天然病毒,因此具有傳染性和危害性。
要克服天然病毒來源少且具有傳染性的缺點,本質上可通過離體培養來解決,即把 HCV(尤其是基因組經過無害化改造的HCV)導入合適的人工培養宿主細胞系,重組HCV顆粒 即可從細胞中產生并分泌至培養基上清。然而,該技術的關鍵步驟為保密狀態,目前只為 少數實驗室所擁有;另一方面,這種HCV生產方法可能尚存在若干缺陷,如成本高、病毒 數量仍然較低、結構不天然、重復性差等。
體外轉錄的HCV?RNA,因為它與標本中待測指標一樣,都是RNA,因此可以作為逆轉錄 的陽性參照;但是,由于其不具備病毒外殼,因此不適合作為從標本中提取病毒RNA操作 的陽性參照。
用質粒作為陽性參照,其優點是制備純化容易,但由于質粒是閉合環狀超螺旋雙鏈形 式,非單線性,不是RNA,因此它只能作為PCR參照,而無法作為RNA提取和逆轉錄的參照。
至于化學合成法制備RNA陽性參照,目前技術尚不成熟,且成本高,還會因為沒有核 衣殼、膜的保護而容易降解,因此到目前為止還無實際應用的報道。
發明內容
本發明的目的是提供一種易于獲得,安全,廉價的人丙肝病毒的人工假病毒,其制備 及應用。
假病毒即指反轉錄病毒載體,為經過基因改造的反轉錄病毒,具有原始病毒的基本結 構和部分生活史,而不具有多數調節基因及主要致病成份。所謂基本結構,乃假病毒的外 膜蛋白及脂類、衣殼蛋白、復制酶(起切割、逆轉錄、整合作用的蛋白)、RNA基因組,分別 由來源于天然病毒的env、gag、pol、目的基因(序列)所編碼/代表。所謂部分生活史,乃 假病毒僅可在宿主細胞中產生組件、組裝,且只能一次性的感染靶細胞,不產生新病毒。
本發明利用反轉錄病毒系統(Clontech公司的RetroX(R)system),將經篩選獲得的目 的DNA片段重組(分子生物學常規技術)入pLXSN(plasmid-LTR-X-SV40promoter-Neomycin) 質粒載體,然后導入(方法:脂質體轉染)病毒生產細胞(Clontech公司的PT67),攜帶目的 序列(以RNA形式)的假病毒便可以從生產細胞中產生,分泌到液態的培養基中。收集此培 養基,2000RPM離心10分鐘去除大部分細胞碎片和雜質,就得到假病毒粗制品。
RetroX(R)system反轉錄病毒系統包括PT67生產細胞、2種克隆載體pLXSN和pLNCX2 供選擇、載體附帶正反向測序引物、正對照克隆(AP基因)質粒pLAPSN,即X=AP,Alkaline phosphatase(堿性磷酸酯酶報告基因)。PT67細胞來源于常見的小鼠胚胎成纖維細胞系NIH 3T3,已經穩定轉染了莫洛尼逆轉錄病毒(Mo-MLV,Moloney?murine?leukemia?virus,莫洛尼 株型鼠科白血病病毒)的gag-pol基因,10A1逆轉錄病毒(10A1-MLV,10A1株型鼠科白血病病 毒)的env基因(也稱10A1),形成穩定轉染(整合入細胞染色體)的輔助篩選基因分別是TK gene(thymidine?kinase,胸腺激酶)和DHFR?gene(dihydrofolate?reductase,二氫葉酸還 原酶)。采用RetroX(R)system反轉錄病毒系統制作反轉錄病毒的步驟為:把目的序列重組 進某一載體,擴增重組質粒,轉染PT67細胞,收獲上清。
本發明第一方面公開了一種人丙肝病毒的人工假病毒,為反轉錄病毒,由pLXSN質粒 載體所轉化的PT67細胞產生,其中,pLXSN質粒載體含有SEQID?NO:1的多核苷酸序列。
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