[發明專利]填補昆蟲基因組物理圖譜中裂縫的方法無效
| 申請號： | 200810023524.7 | 申請日： | 2008-04-02 |
| 公開（公告）號： | CN101255414A | 公開（公告）日： | 2008-09-03 |
| 發明（設計）人： | 陸小平;周君;徐劍;樓程富;劉嘉琦;袁紅艷;儲榮華 | 申請（專利權）人： | 蘇州大學 |
| 主分類號： | C12N15/10 | 分類號： | C12N15/10 |
| 代理公司： | 蘇州創元專利商標事務所有限公司 | 代理人： | 陶海鋒 |
| 地址： | 215123江蘇省*** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 填補 昆蟲 基因組 物理 圖譜 裂縫 方法 | ||
【權利要求書】：
1、一種填補昆蟲基因組物理圖譜中裂縫的方法，其特征是：
(1)將昆蟲基因組中未知序列的上游或下游200～500bp的堿基序列作為信息探針，到NCBI網站的昆蟲EST數據庫中進行相似性檢索；
(2)檢索得到的相似性高于95％的EST序列，回到該昆蟲EST數據庫中進行再檢索，將檢索得到的片段用DNASTAR軟件進行拼接，形成的片段回到EST數據庫中繼續檢索；
(3)重復步驟(2)，直至檢出所有的重疊EST或重疊群不能繼續延續為止；
(4)用DNASTAR軟件將檢索得到的所有EST序列拼接成一條完整的重疊群片段；
(5)將上述拼接得到的完整的重疊群片段與裂縫中未知序列進行相似性比對，檢驗所獲序列片段的填補效果；
(6)根據所獲重疊群片段的序列，設計特異引物；
(7)提取該昆蟲的基因組DNA，以此為模板進行PCR擴增，通過PCR產物的測序分析，進一步驗證裂縫中堿基序列的準確性，完成裂縫未知序列的填補。
2、根據權利要求1所述的一種填補昆蟲基因組物理圖譜中裂縫的方法，其特征在于：所述的昆蟲為蜜蜂或家蠶。
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