[發(fā)明專利]利用甲基化進(jìn)行DNA計(jì)算的系統(tǒng)和方法

無效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 200780006346.0
• 申請(qǐng)日: 2007-02-06
• 公開（公告）號(hào): CN101390113A
• 公開（公告）日: 2009-03-18
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: N·迪米特羅娃;S·蓋爾
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 皇家飛利浦電子股份有限公司
• 主分類號(hào): G06N3/12
• 分類號(hào): G06N3/12;C12Q1/68
• 代理公司: 永新專利商標(biāo)代理有限公司
• 代理人: 林曉紅

1、一種使用甲基化邏輯的方法，其包括：

產(chǎn)生具有多個(gè)賦值變量的邏輯語句，其中所述多個(gè)變量包括甲基化變 量和對(duì)應(yīng)于未甲基化變量的所述甲基化變量的否定，

使混合物或樣品甲基化，

逆轉(zhuǎn)樣品的甲基化狀態(tài)；

通過一種或多種分離技術(shù)使所述混合物或樣品分離以分離至少一種分 離的混合物；

解碼所述至少一種分離的混合物；以及

讀取所述至少一種分離的混合物以使所述邏輯語句與所述解碼關(guān)聯(lián)。

2、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述方法對(duì)于驗(yàn)證生物學(xué)標(biāo)記和/ 或產(chǎn)生或鑒定新的生物學(xué)標(biāo)記是有效的。

3、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述一種或多種分離技術(shù)包括一 系列測(cè)定法。

4、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述讀取對(duì)于驗(yàn)證已有的生物學(xué) 標(biāo)記或者產(chǎn)生和/或鑒定新的生物學(xué)標(biāo)記是有效的。

5、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量為特定基因。

6、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量為一組基因。

7、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量為基因上的一組位 點(diǎn)。

8、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量具有至少一個(gè)用于 C-執(zhí)行甲基化編碼的胞嘧啶。

9、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量具有至少一個(gè)用于 A-執(zhí)行甲基化編碼的腺嘌呤。

10、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量是由單鏈DNA編 碼的。

11、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量是由雙鏈DNA編 碼的。

12、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述多個(gè)變量是由甲基結(jié)合蛋 白編碼的。

13、根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其進(jìn)一步包括產(chǎn)生邏輯電路。

14、用于解決一組遺傳子句的系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括：

賦值變量，其中各變量對(duì)應(yīng)于甲基化變量和所述變量的否定，所述否 定對(duì)應(yīng)于未甲基化變量；

使用所述甲基化和未甲基化變量在給定的邏輯子句內(nèi)解決AND、OR 和NOT布爾邏輯項(xiàng)，通過以下方式進(jìn)行：

甲基化所述變量的給定混合物，

逆轉(zhuǎn)樣品的甲基化狀態(tài)；

分離所述混合物以產(chǎn)生滿足所述給定邏輯子句的需要的混合物。

15、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量為特定基因。

16、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量為一組基因。

17、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量為基因上的一組位點(diǎn)。

18、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量中的至少一個(gè)具有至 少一個(gè)用于C-執(zhí)行甲基化編碼的胞嘧啶。

19、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量中的至少一個(gè)具有至 少一個(gè)用于A-執(zhí)行甲基化編碼的腺嘌呤。

20、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量是由單鏈DNA編碼 的。

21、根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法，其中所述變量是由雙鏈DNA編碼 的。