[發(fā)明專利]用于檢測大腸癌的新的基因組合及其基因芯片

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200710195794.1
• 申請日: 2007-12-17
• 公開（公告）號: CN101624616A
• 公開（公告）日: 2010-01-13
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 車團(tuán)結(jié);徐進(jìn)章;李琳;陳小蘭
• 申請（專利權(quán)）人: 蘭州百源基因技術(shù)有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 北京中恒高博知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司
• 代理人: 夏晏平

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物基因領(lǐng)域，尤其是用于大腸癌檢測的基因及其基因芯片。?

背景技術(shù)

大腸癌是常見惡性腫瘤之一，在我國惡性腫瘤發(fā)病率中居第5位，且呈現(xiàn)出“發(fā)病率上升，發(fā)病年齡提前，誤診率高”三個新特點。近年來大腸癌的發(fā)病率逐年升高，已從20世紀(jì)70年代的第六位上升到90年代的第三位，而且發(fā)病年齡有年輕化的趨勢。目前用于診斷大腸癌的方法有多種：CEA(癌胚抗原)作為大腸腫瘤復(fù)發(fā)的臨床監(jiān)測價值遠(yuǎn)大于早期診斷的價值，因其在其他腫瘤中也有較高的表達(dá)，缺乏特異性；大便潛血試驗(RPHA-FOBT)仍為檢測早期大腸癌的重要手段，但由于早期大腸癌無出血者占有較大的比例，仍有漏診率；國外推出的大腸癌檢測試劑盒，主要采用免疫組化技術(shù)，針對手術(shù)后病理標(biāo)本進(jìn)行檢測，其靈敏度都在30％左右。到目前為止，尚沒有一種有關(guān)大腸腫瘤的特異性免疫標(biāo)志物可供臨床上用于大腸腫瘤的早期篩檢，誤診率高達(dá)70％以上。?

基因芯片(Gene?Chip)是將大量的寡核苷酸分子固定于固相載體上形成DNA微點陣，借助核苷酸分子雜交配對的特性對DNA樣品的序列信息進(jìn)行高效解讀和分析。?

基因芯片起源于20世紀(jì)80年代，近年來得到了迅猛的發(fā)展，但主要是應(yīng)用于醫(yī)藥和研究領(lǐng)域，應(yīng)用于大腸癌的早期檢測在我國尚屬首次，這將會極大促進(jìn)大腸癌早期診斷的發(fā)展。?

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的為提供一種特異性好、靈敏度高、準(zhǔn)確率高的用于檢測大腸癌的基因組合。?

本發(fā)明的目的之二為提供應(yīng)用該基因組合的用于檢測大腸癌的基因芯片。?

實現(xiàn)上述目的的技術(shù)方案為：?

用于檢測大腸癌疾病的基因組合，該基因組合包括30個基因片段(如表1所示)，其中第30種基因片段為質(zhì)控基因。這30個基因片斷是針對大腸癌的30個指標(biāo)而設(shè)計的，利用30個基因片段共同來檢測大腸癌基因表達(dá)譜的改變，進(jìn)而對大腸癌進(jìn)行偵檢和預(yù)后監(jiān)控。這30種基因片段如下表所示：?

表1??30種基因片段?

??編號 ??名稱 ??引物(5’-3’) ??基因片段長??度(bp) ??1 ??VIP ??CTCCTTGTGCTCCTGAC ??200 ??CTGCTCCTCTTTCCATTC ?????2 ??C₂??TGCTCCTGGACTGTTCG ??395 ??GCTTCACTCCTGTGGGT ?????3 ??Survivin ??AGGTGCCTGTTGAATCTG ??318 ??GACGCTTCCTATCACTCTATT ?????4 ??IL-2 ??AAGACCCAGGGACTT ??280 ??GGTTGCTGTCTCATCA ?????5 ??Granulysin ??CTGCGTGATGAGGAGAAA ??400 ??GGGTCGCAGCATT ?????6 ??FAK ??TCCACCAAAGAAACCG ??500 ??TCTGTGCCATCTCAATCT ?????7 ??IL-1 ??CGCCTGACAGAAACCA ??300 ??GCGAATGACAGAGGGT ?????8 ??IL-8 ??CAGCCTTCCTGATTTC ??300 ??AACCCTCTGCACCCA ?????9 ??Cox-1 ??ATCCAGAAACAGTGGCTCG ??248 ??CAACCAATGGCGTG ?????10 ??C-myc ??ACGCCGCTCGGAAGGAAT ??300 ??TCCACCGTGACCACATCG ?????11 ??VEGF ??CCCACCCACATACATACA ??230 ??CCTCCCAACTCAAGTCC ?????12 ??Stufen ??GCTGCGAAACACGATGCT ??300 ??CTGGGCCAGTCGGCTAAT ?????13 ??C10orf46 ??TTTGGCTCCGCTTTCTCG ??550 ??CTCCCAGTTGTTGTGGTTCT ?????14 ??Ki-67 ??TTGCCTCCTAATACGC ??280 ??CTTCCGAAGCACCACT ?????15 ??Granulysin ??CTGCGTGATGAGGAGAAA ??320 ??GGGTCGCAGCATT ?????16 ??TOP2B ??GACAATGCCCTCACC ??500 ??CCAGGCTCCTTCTTC ?????17 ??MTHFR ??ACCGCCGTGAACTACTGT ??350 ??GCCTCCCTCCTCCTCTT ?????18 ??PCNA ??CAAGGACCTCATCAACG ??400 ??ACTTTCTCCTGGTTTGG ?????19 ??P15 ??TGGACCTGGTGGCTACGAAT ??200