[發(fā)明專利]一種計算寡核苷酸基因芯片的UniGene表達量的算法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 200710173615.4 | 申請日: | 2007-12-28 |
| 公開(公告)號: | CN101261689A | 公開(公告)日: | 2008-09-10 |
| 發(fā)明(設計)人: | 曾華宗;劉極龍 | 申請(專利權)人: | 上海敏芯信息科技有限公司 |
| 主分類號: | G06N3/12 | 分類號: | G06N3/12 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 200433上海市楊*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 計算 寡核苷酸 基因芯片 unigene 表達 算法 | ||
1.一種計算寡核苷酸基因芯片的UniGene表達量的算法,其特征在于該方法包括有如下步驟:
步驟1,獲得探針水平的表達值數據;
步驟2,將探針集歸入不同的UniGene;
步驟3,以UniGene為單位,合并同一個UniGene下的探針集;
步驟4,分別對每個UniGene下的所有探針進行層次聚類分析;
步驟5,尋找層次聚類結果中的最大探針子集,作為該UniGene的代表探針集;
步驟6,將代表探針集轉化為一個表達值,即為UniGene水平的最終表達值。
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