[發(fā)明專利]一種篩選基因芯片差異表達基因的方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 200710173586.1 | 申請日： | 2007-12-28 |
| 公開（公告）號： | CN101215602A | 公開（公告）日： | 2008-07-09 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 劉極龍;曾華宗 | 申請（專利權(quán)）人： | 上海敏芯信息科技有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/68 | 分類號： | C12Q1/68;G06F19/00 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 200433上海市楊*** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 一種 篩選 基因芯片 差異 表達 基因 方法 | ||
【權(quán)利要求書】：
1.一種篩選基因芯片差異表達基因的方法，其特征在于該方法包括有如下步驟：
步驟1，對芯片數(shù)據(jù)進行歸一化處理；
步驟2，建立對數(shù)比值xij＝μ+μj+ε線性模型；
步驟3，計算出全局均值μ，列效應(yīng)μj和方差σ的值；
步驟4，利用μ、μj和σ，計算每個基因的2×ln(odd?ratio)；
步驟5，設(shè)定域值χ2cutoff，n，當(dāng)步驟4中的2×ln(odd?ratio)值大于χ2cutoff，n的基因定為差異表達基因。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種篩選基因芯片差異表達基因的方法，其特征在于：在步驟1中，進行基因芯片數(shù)據(jù)的歸一化處理時的樣本數(shù)，在1～5例之間。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種篩選基因芯片差異表達基因的方法，其特征在于：在步驟3或步驟4中，
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