[發明專利]一種基于信息勢的圖像配準方法有效
| 申請號: | 200710098693.2 | 申請日: | 2007-04-25 |
| 公開(公告)號: | CN101294954A | 公開(公告)日: | 2008-10-29 |
| 發明(設計)人: | 蔣田仔;史桂華;朱萬琳;劉冰;趙慧智 | 申請(專利權)人: | 中國科學院自動化研究所 |
| 主分類號: | G01N33/483 | 分類號: | G01N33/483;G01N27/447;G06T7/00 |
| 代理公司: | 中科專利商標代理有限責任公司 | 代理人: | 周國城 |
| 地址: | 100080北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 信息 圖像 方法 | ||
技術領域
本發明屬于生物圖像配準技術領域,涉及一種基于信息勢的圖像配 準方法,基于ICP框架,對生物圖像數據進行處理。
背景技術
雙向凝膠電泳在蛋白質學研究中是一種應用非常廣泛的蛋白質點分 離技術。基于蛋白質分子量及電荷大小,雙向凝膠電泳技術可以將不同 的蛋白質進行分離,生成一幅二維點圖,其中每個點表示一種蛋白質。 研究者經常需要進行不同凝膠之間的差別比較。這需要找到不同凝膠中 代表同一蛋白質的對應蛋白質點。由于凝膠電泳過程較為復雜,即使是 同一樣品,時間不同,得到的凝膠差異也會很大。如果數據很大,僅用 肉眼很難比較。因此,借助于計算機的配準算法很為必要。
前人提出的凝膠電泳圖像配準方法可以分為三種:基于特征點、基 于像素灰度、結合前面兩種。目前大多數的凝膠電泳圖像配準方法是基 于特征點的配準方法。一般說來,基于特征點的方法首先提取圖像中的 特征點,蛋白質點的質心,然后基于這些特征點計算變換。CAROL通過 三角化,對邊界進行匹配,來找蛋白質點的對應性。F.A.Potra等人(F.A. Potra.,X.Liu,F.Seillier-Moiseiwitsch,A.Roy,Y.Hang,et?al., Protein?image?alignment?via?piecewise?affine?transformations, Journal?of?Computational?Biology,13(2006)),與前人不同,不是在 兩幅圖像之間作匹配,而是構造可以代表一組圖像的模板,然后將這組 圖像中的每一幅圖像與模板作匹配。F.A.Potra等人的方法中,特征點 及其對應性是已知的。
基于像素灰度的配準方法直接利用圖像的灰度值估計所求的變換。 這種方法最大的優點就是不需要進行分割。Smilansky(Z.Smilansky, Automatic?registration?for?images?of?two-dimensional?protein?gels, Electrophoresis22(2001)1616-1626.)第一次提出將基于像素灰度 的配準方法應用在凝膠電泳圖像上。Smilansky的方法的基本思想是: 基于像素灰度、基于局部區域、基于互補偽色彩顯示。
Veeser(S.Veeser,M.J.Dunn,G.Z.Yang,Mul?tiresolution image?registration?for?two-dimensional?gel?electrophoresis, Proteomics?1(2001)856-870.)等人的配準方法是基于多分辨率及其 BFGS(Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno)優化算法的。
還有人將特征點與像素灰度信息相結合的配準方法應用于凝膠電泳 圖像配準上。Rohr(K.Rohr,P.Cathier,S.,Elastic registration?of?electrophoresis?images?using?intensity information?and?point?landmarks,Pattern?Recognition,37(2004) 1035-1048.)等人將PASTAGA(PASha?Treating?Additional?Geometric Attribute)方法應用于凝膠電泳圖像配準。在原來的PASTAGA方法中, 三維曲線被用來作為特征點。Rohr等人的工作中,蛋白質點的質心作為 特征點。Carlo等人的工作中,SSD(sum?of?square?differences)測度 作為度量,圖像的四個頂點作為特征點。其中特征點不僅對變形場進行 限制,而且還作為每一步優化的初始條件。Carlo等人重點對具有“smile effect”變形現象的圖像進行匹配。
發明內容
本發明的目的是要解決傳統技術迭代最近點算法對初始變換要求較 高的問題,為此,本發明提出一種基于信息勢的圖像配準方法,是一種 新的迭代最近點方法,將它應用到雙向凝膠電泳圖像上。通過信息勢將 蛋白質點的灰度信息和幾何信息有效地結合在一起,所以,本發明的方 法更魯棒。
為了實現本發明的目的,提出基于信息勢的圖像配準方法的技術方 案如下:
步驟S1:利用計算機設備,基于信息勢和歐氏距離的測度來度量最 近點的迭代最近點算法;
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