[發明專利]一種非對稱環發夾型DNA探針的構建方法及其應用

無效

• 申請號: 200710098255.6
• 申請日: 2007-04-25
• 公開（公告）號: CN101050475A
• 公開（公告）日: 2007-10-10
• 發明（設計）人: 陳慶海;府偉靈;匡紅
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍第三軍醫大學第一附屬醫院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京瑞盟知識產權代理有限公司
• 代理人: 孫民興;顧小曼

1.一種非對稱環發夾型DNA探針的構建方法，其特征是，包括以下步驟：

(1)根據要檢測的目標序列，構建非對稱發夾型DNA探針的A段堿基序列，其中A段序列是與靶序列匹配堿基序列，A段堿基序列作為環序列的一部分；

(2)構建非對稱發夾型DNA探針的B段堿基序列，其中B段堿基序列是與固定在芯片表面的Oligo?DNA探針匹配的堿基序列，B段堿基序列一部分與A段堿基序列共同構成非對稱發夾型DNA探針的整個環序列，B段堿基序列的另一部分作為莖臂與淬滅分子或者熒光分子相連；

(3)構建非對稱發夾型DNA探針的C段堿基序列，其中C段堿基序列與B段堿基序列的莖臂部分的堿基序列互補，C段堿基序列一端與A段堿基序列相連，另一端與B段堿基序列相對應地與熒光分子或者淬滅分子相連；

(4)將上述A、B、C段堿基序列組合，再經軟件驗證不會形成除發夾結構外的其他二級結構，并經genbank比對后即完成非對稱環發夾型DNA探針設計。

2.根據權利要求1所述的一種非對稱環發夾型DNA探針的構建方法，其特征是，在對多樣本靶序列檢測時，所述步驟(2)所述B段堿基序列可根據需要設計不同序列和不同長度。

3.根據權利要求1所述的一種非對稱環發夾型DNA探針的構建方法，其特征是，在步驟(3)組合后的發夾型DNA探針中，其中A段堿基序列的長度大于整個環序列長度的2/3并且小于整個環序列長度。

4.權利要求1所述的非對稱環發夾型DNA探針的構建方法在基因檢測方面的應用，其特征是，根據待檢目標，運用所述方法構建對應的非對稱環發夾型DNA探針，然后按常規的芯片實驗方法對待檢目標進行檢測。