[發(fā)明專利]檢測(cè)胃組織細(xì)胞中人VLDLR基因的失活的方法無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 200710097943.0 | 申請(qǐng)日: | 2007-04-23 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN101092650A | 公開(kāi)(公告)日: | 2007-12-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 高田久;井本逸勢(shì);稻澤讓治 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 富士膠片株式會(huì)社;國(guó)立大學(xué)法人東京醫(yī)科齒科大學(xué) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京天昊聯(lián)合知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人: | 丁業(yè)平;張?zhí)焓?/td> |
| 地址: | 日本*** | 國(guó)省代碼: | 日本;JP |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 檢測(cè) 組織細(xì)胞 中人 vldlr 基因 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及檢測(cè)胃組織細(xì)胞中人極低密度脂蛋白受體(Very?LowDensity?Lipoprotein?Receptor)(人VLDLR))基因的失活的方法。
背景技術(shù)
在日本,每年有100,000人以上會(huì)患上胃癌(Gastric?Cancer,GC),其中男性較多,男女比例為約2∶1,是男性中最多發(fā)的癌癥。在日本每年的胃癌死亡人數(shù)約為50,000人,占全部因癌死亡人數(shù)的16%。根據(jù)迄今為止的研究,認(rèn)為是胃組織細(xì)胞在細(xì)胞分化和增殖的過(guò)程中一連串地發(fā)生了基因的變化,其結(jié)果是最終導(dǎo)致了癌化??墒?,還不明確到底是怎樣的基因變化誘導(dǎo)了胃組織細(xì)胞的癌化。因此,現(xiàn)有狀況是還不存在胃癌的檢測(cè)方法和胃癌惡性程度的檢測(cè)方法。
在胃癌的診斷中,使用的是例如胃X射線檢查、胃內(nèi)窺鏡、血中胃蛋白酶原值、腫瘤標(biāo)記,其中胃內(nèi)窺鏡(能夠得到確診的唯一檢測(cè)方法)被廣泛使用??墒?,這些大多屬于影像診斷、早期診斷的工具,并不是癌的確診、分型、進(jìn)度判定、有否轉(zhuǎn)移的判定方法。
著眼于基因的胃癌的檢測(cè)方法已知有例如專利文獻(xiàn)1記載的方法??墒?,該方法是著眼于基因表達(dá)譜(expression?profile)變化的一種方法?;虮磉_(dá)譜的測(cè)定是多個(gè)mRNA量的測(cè)定,由于mRNA非常不穩(wěn)定,容易分解,而且表達(dá)的動(dòng)態(tài)范圍(dynamic?range)也比較大,所以通過(guò)微陣列(microarray)等測(cè)定的再現(xiàn)性就比較差。因此,需要一種更加穩(wěn)定、再現(xiàn)性高的方法。
比較基因組雜交(Comparative?Genomic?Hybridization(CGH))是一種檢測(cè)基因組中基因擴(kuò)增的靈敏度高、效率優(yōu)異的方法,本發(fā)明人采用該CGH陣列法鑒定了在胃癌細(xì)胞中擴(kuò)增的基因群,即在染色體2p24.1擴(kuò)增的SDC1基因、在染色體2p23.3擴(kuò)增的DNMT3A基因、在染色體3p22.3擴(kuò)增的MLH1基因、在染色體3p22.1擴(kuò)增的CTNNB1基因等(非專利文獻(xiàn)1)。
一般來(lái)說(shuō),基因水平上的癌化結(jié)構(gòu)已經(jīng)報(bào)道了如上所述的多個(gè)基因的擴(kuò)增和癌抑制基因的缺失。在采用定位克隆等通常的方法的情況下,特定基因缺失的鑒定是非常費(fèi)時(shí)費(fèi)力的,很難發(fā)現(xiàn)目的基因。而且,即便是CGH法,采用通常的中期染色體的方法檢測(cè)小于5-10Mb大小的基因組DNA的缺失也是非常困難的(非專利文獻(xiàn)2和3)。通過(guò)染色體作圖法(chromosome?mapping)逐步縮小同源接合體缺失區(qū)域,最終鑒定出了目的癌抑制基因例如DPC4/SMAD4、RB1、PTEN、p16-INK4A、RASSF1等。
非專利文獻(xiàn)1:Takada?H,Imoto?I,Tsuda?H,Sonoda?I,Ichikura?T,Mochizuki?H,Okanoue?T,Inazawa?J.:Screening?of?DNA?copy-numberaberration?in?gastric?cancer?cell?lines?by?array-based?comparativegenomic?hybridization.Cancer?Sci.2005?Feb;96(2):100-10
非專利文獻(xiàn)2:Bentz,M.,Plesch,A.,Stilgenbauer,S.,Dohner,H.&Lichter,P.:Minimal?sizes?of?deletions?detected?by?comparativegenomichybridization,Genes?chromosomes?Cancer,172-175,1998.
非專利文獻(xiàn)3:Kirchhoff,M.,Gerdes,T.,Maahr,J.,Rose,H.,Bentz,M.,Dohner,H.&Lundsteen,C.:Deletions?below?10?megabasepairs?are?detected?in?comparative?genomic?hybridization?by?standardreference?intervas,Genes?chromosomes?Cancer,410-413,1999.
專利文獻(xiàn)1:特表2005-514051號(hào)公報(bào)。
發(fā)明內(nèi)容
發(fā)明所要解決的問(wèn)題
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