[發明專利]動物關節軟骨組織總RNA提取方法無效
| 申請號: | 200710093163.9 | 申請日: | 2007-12-18 |
| 公開(公告)號: | CN101182343A | 公開(公告)日: | 2008-05-21 |
| 發明(設計)人: | 初同偉;劉玉剛;周躍;歐娟娟 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍第三軍醫大學第二附屬醫院 |
| 主分類號: | C07H21/02 | 分類號: | C07H21/02;C07H1/06 |
| 代理公司: | 重慶志合專利事務所 | 代理人: | 胡榮琿 |
| 地址: | 40003*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 動物 關節 軟骨 組織 rna 提取 方法 | ||
技術領域
本發明涉及一種富含蛋白多糖的RNA提取方法,特別涉及一種動物關節軟骨組織總RNA提取方法。
背景技術
各種關節疾病和脊柱關節的疾病的治療一直是醫學界面臨的難題,國內外正在開始嘗試的基因治療有望獲得該領域治療的突破。從基因水平對軟骨組織進行研究意義重大,而從軟骨組織中提取高質量的RNA是各種基因表達研究的基礎。
關節軟骨基質多,細胞少,細胞成分只占20%,軟骨基質的主要成分是II型膠原,由于II型膠原中富含羥賴氨酸,并且羥賴氨酸的羥基幾乎全部和糖結合,因而糖化率高,含糖量約為10%,因此軟骨基質主要成分是蛋白多糖。關節軟骨屬于細胞含量少的組織,組織RNA含量低,并且多糖的理化性質與核糖核酸RNA非常相似,在沉淀RNA時,蛋白多糖和RNA一塊無區分的沉淀下來,產生富含多糖的凝膠狀沉淀,這種含有多糖的RNA沉淀難溶于水,或溶解后產生粘稠狀的溶液,這樣的RNA由于蛋白多糖的干擾無法進行后續的各種分子生物學試驗。在去除多糖的同時RNA也被帶走,造成RNA的大量丟失,因此從軟骨中提取高質、足量的RNA非常困難。
由于軟骨組織的特殊結構,目前尚無有效的方法來解決這一難題,基于酸酚/胍鹽原理的總RNA抽提方法是動物組織、細胞核酸分離的主要方法,如一步法、trizol法等,但基于酸酚/胍鹽原理的方法不適于富含多糖的動物組織,因為該種方法不能區分理化性質相似的多聚核糖和蛋白多糖,在進行RNA沉淀的時候,蛋白多糖和RNA一起沉淀下來,而去除蛋白多糖的步驟也是RNA損失的步驟。plant?RNAout法是基于CTAB裂解法的總RNA提取方法,其優點是操作簡便、易行,含CTAB的裂解液是用于富含多糖和多酚的植物總RNA抽提的首選細胞裂解方法,可以有效的分離植物組織中的多糖和RNA,但通過多次實驗證明,該方法用于抽提新西蘭白兔關節軟骨組織的總RNA時引入DAN污染。因此,我們試驗證明用一步法、trizol法、anima?RNAout法、植物RNA提取法等成熟的RNA提取方法都不能獲得高質量總RNA,采用經典的去除多糖的方法如高鹽、低醇沉淀法都不能去除大量的多糖。
發明內容
本發明的目的是提供一種動物關節軟骨組織總RNA提取方法,它適用于含蛋白多糖的RNA難提組織的小量總RNA提取,采用本發明方法提取的動物關節軟骨組織總RNA的收率高,并且質量好、純度高、完整性好,可以滿足分子生物學研究應用。
本發明方法有以下步驟:
(1)取動物關節軟骨組織,立即投入液氮中研磨至粉末狀,每50重量份的關節軟骨組織加入1體積變性液,0.007體積的β-巰基乙醇,勻漿至無明顯組織塊;
(2)將勻漿液置于冰水浴上,加酸性水飽和酚,搖勻,加醋酸鈉,氯仿、異戊醇混合液,置于冰水浴上15min;
(3)4℃下,離心,取上清液,加入氯仿、異戊醇混合液,離心取上清加入異丙醇,-20℃下沉淀30min,離心30分鐘,得到凝膠狀RNA和蛋白多糖混合沉淀,加入無RNA酶水,溶解沉淀得到膠狀溶液;
(4)取膠狀溶液用plant?RNAout試劑盒的RNA提取步驟得到總RNA沉淀,取沉淀,乙醇洗滌二次后用無RNA酶水溶解沉淀即得關節軟骨組織總RNA溶液。
本發明所述的重量與體積的計量單位,采用克與毫升或千克與升或微克與微升等。
通常細胞中約75%的RNA酶存在于胞液中,當細胞裂解后,RNA酶會釋放出來,在沒有有效的抑制措施下,RNA酶會迅速降解RNA。一步法所用的裂解液主要成分為異硫氰酸胍,它是一種強烈的蛋白質變性劑,能有效的抑制RNase活性,使RNase變性,裂解液中加入的β-巰基乙醇也是RNase的強烈抑制劑,聯合應用可有效防止RNA降解。
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