[發明專利]山羊皮膚表達基因探針序列及其構成的基因芯片

無效

• 申請號: 200710091230.3
• 申請日: 2007-03-23
• 公開（公告）號: CN101270387A
• 公開（公告）日: 2008-09-24
• 發明（設計）人: 張文廣;李金泉
• 申請（專利權）人: 張文廣
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 呼和浩特北方科力專利代理有限公司
• 代理人: 李樹基

技術領域

本發明涉及生物技術，特別是涉及動物皮膚表達基因探針和構成基因芯片。

背景技術

生物基因組中可轉錄表達的基因序列，就目前所掌握的情況看雖然僅占總序列的3～5％，但若對這部分序列的表達特征進行測定和比較，可以直接導致一些新特征的發現，并可從中獲取基因組中與產業化關系最為密切的信息。20世紀90年代人類基因組計劃和生物信息學興起后，使得利用比較基因組技術來獲取跨物種的保守基因序列成為可能。再以保守基因序列作為基礎利用，就能進一步地在保守基因序列的近3’端找到短的核苷酸探針序列，進而就可以以此序列為探針，比較出該基因在不同時空的表達模式即表達譜。簡而言之，該核苷酸探針系列(即OLIGO序列)來自表達基因的近3’端，特異性的代表了基因的部分轉錄片斷。

隨著生物技術的發展和生命科學發展的需要以及諸多物種基因組計劃的逐步展開，人們迫切需要高通量的了解多基因的表達譜，為此，基因芯片應運而生。所謂基因芯片的實質就是在面積不大的基片上有序地點陣排列了一系列固定于一定位置上可尋址的生物識別分子。運用基因芯片技術，將獲得的相關數據運用雜交技術和掃描技術進行芯片的有效數據分析處理，即可獲得相應的基因表達譜。目前的DNA芯片具有較強的可用性、靈活性、敏感性和相對簡單等特點而被應用在許多領域，如：DNA序列測定、基因多態性檢測、新基因的發現、疫苗和藥物研究、特征標記的篩選、生物抗逆性研究、有機體的發育、調節細胞功能的基因互作研究、檢測不同發育時期不同組織中基因的變化規律以及基因調控網絡的構建等。分析基因組規模化的基因表達數據，將最終導致對細胞分化的整體性觀察，涉及細胞增殖、細胞凋亡、能量代謝、細胞通訊、細胞遷移等不同系統生物學層次。

雖然上述研究已取得一定突破，但針對山羊來說，目前來看還是一項空白。

發明內容

基于上述因素，本發明選動物中的山羊做本體進行了研究，找到了山羊皮膚差異表達基因探針序列及其構成的基因芯片。其目的在于提供一種可作比較用的基因探針序列及其基因芯片，作為以后基因分析的借鑒模式。通過對表達基因探針及其構成的基因芯片進行表達譜分析，有助于發現基因互作模式、構建基因調控網絡、疾病檢測、藥物毒理學分析、分析基因在不同組織的表達特異性和對細胞和有機體的整體研究等

本發明篩選出的山羊皮膚表達基因探針，是一種運用同源性檢索技術篩選出的哺乳動物保守基因序列，本發明篩選了差異表達的基因探針序列225個，它們所對應的基因名稱和序列信息由附表給出，其具體編號是NMBI001～NMBI225。

所述的OLIGO序列具有給定列表中的一條或數條的組合，并包括其中每條序列的互補序列或同源序列，同時還包括表中每條序列中的8～65個連續核苷酸為探針的序列或其互補序列。

由上述OLIGO序列探針所構成的基因芯片，是在載體上結合有列表中所示的序列、同源序列或其互補序列的核酸分子，其載體為固相或液相載體。固相載體為玻片、硅片、尼龍膜、硝酸纖維膜、凝膠，核酸分子包括脫氧核糖核酸、核糖核酸和多聚寡核苷酸、多聚肽核苷酸。

OLIGO基因芯片是用于生物功能的研究和檢測的一個基本條件。這里，所述的生物包括家畜、植物以及它們的細胞、組織器官及其系統；所述的生物功能的研究包括家畜抗逆性、家畜育種和家畜新品種的產生、雜種優勢的早期預測、新型抗寄生蟲藥物的篩選、動植物生長和發育的機理和藥物的毒理學；所述的生物功能的檢測包括轉基因動植物的安全性檢測、食物成分的功能性評估、病原體的檢測和診斷、生物物種的鑒定，包括動植物和微生物。

本發明是采用同源性檢索技術篩選了哺乳動物保守基因序列并合成該序列的一段寡核苷酸探針，以所獲得的探針序列應用微陣列技術制成OLIGO基因芯片，將該獲得的基因芯片用于檢測和比較山羊不同部位不同時期皮膚的基因表達譜，獲得了差異表達的225個探針序列。包含此225個OLIGO探針序列的基因芯片能用于對家畜的重要經濟性狀的基因克隆、標記輔助選擇、雜種優勢的早期預測、抗寄生蟲藥物的篩選、新藥物的發現和毒理學研究、疾病診斷、動植物育種和家畜新品種的產生、家畜抗逆性的研究和動植物品種的鑒定等。