[發明專利]志賀氏菌檢測用引物、檢測方法、檢測試劑盒無效
| 申請號: | 200710030435.0 | 申請日: | 2007-09-21 |
| 公開(公告)號: | CN101153326A | 公開(公告)日: | 2008-04-02 |
| 發明(設計)人: | 魏泉德;張彩虹;譚愛軍;張麗榮 | 申請(專利權)人: | 珠海市疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州新諾專利商標事務所有限公司 | 代理人: | 楊煥軍 |
| 地址: | 519000廣東省珠*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 志賀氏菌 檢測 引物 方法 試劑盒 | ||
1.一種志賀氏菌檢測用引物,其特征在于,能擴增靶基因的特異堿基序列,所述靶基因為志賀氏菌的ipaH---GenBank登陸號:M32063,所述引物與所述靶基因的1095---1299bp位的核酸序列的一部分或其互補鏈互補。
2.一種志賀氏菌檢測用引物組,其特征在于,所述引物組由下列引物組成:
正向外引物F3-ipa????ATACCGTCTCTGCACGCA
反向外引物B3-ipa????TCGAAAAGGCCTTCTGATGC
正向內引物FIP-ipa?GCGAAAGACTGCTGTCGAAGCTTTCCGTGAACAGGTCGCT
反向內引物BIP-ipa?TGCCACTGAGAGCTGTGAGGACTGATGGACCAGGAGGGTT
可以擴增志賀氏菌的ipaH基因序列的1095---1299bp位的核酸序列的一部分或其互補鏈。
3.根據權利要求2所述的志賀氏菌檢測用引物組,其特征在于,所述引物組還包括:
正向環引物LF-ipa?GGCACTGAGTTTTTCCAGCCAT
反向環引物LB-ipa?CGCTCACATGGAACAATCTCCGG。
4.根據權利要求3所述的志賀氏菌檢測用引物組,其特征在于,所述引物組可以擴增志賀氏菌的如下片斷或互補鏈:
所述正向外引物F3:擴增始于1095-1112bp;
所述正向內引物FIP:擴增始于1173-1194bp的互補序列和1124-1141bp;
所述反向外引物B3:擴增始于1280-1299bp的互補序列;
所述反向內引物BIP:擴增始于1207-1227bp,和1261-1279bp的互補序列;
所述正向環引物LF-ipa:擴增始于1144-1165bp的互補序列;
所述反向環引物LB-ipa:擴增始于1236-1258bp序列。
5.一種志賀氏菌的檢測方法,該方法用于檢測標本中是否存在志賀氏菌,其特征在于,以志賀氏菌的ipaH基因序列的1095---1299bp位的核酸序列的一部分或其互補鏈為靶,通過LAMP法用上述引物或引物組選擇性擴增上述靶區域,確認是否存在有擴增產物。
6.根據權利要求5所述的志賀氏菌檢測方法,其特征在于,具體檢測方法為:
1)樣品處理和模板提取,樣品范圍適用于食品樣品、糞便、嘔吐物等標本;細菌待檢標本用相應腸道增菌液增菌培養8-12小時后,取1.0ml增菌液10000rpm離心2分鐘,棄其上清液后,用DNA提取試劑盒提取模板DNA或加20~30ul三蒸水煮沸5分鐘,再取2ul上清液做待檢模板DNA;
2)志賀氏菌的環介導等溫擴增
取擴增反應液,先加待檢模板,再加酶,最后加雙蒸水,形成如下總體積為20ul~100ul的反應體系,混勻點離后在約65℃條件下恒溫保溫約40--90分鐘,然后置于80℃的環境下2分鐘滅活酶。
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