[發(fā)明專利]谷氨酰胺合成酶活性的調(diào)節(jié)

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200680054601.4
• 申請日: 2006-03-15
• 公開（公告）號: CN101443353A
• 公開（公告）日: 2009-05-27
• 發(fā)明（設計）人: 科林·彼得·凱尼恩;林登·凱里·奧德菲爾德
• 申請（專利權(quán)）人: CSIR公司
• 主分類號: C07K14/195
• 分類號: C07K14/195;G01N33/68;C12N9/00
• 代理公司: 北京信慧永光知識產(chǎn)權(quán)代理有限責任公司
• 代理人: 梁興龍;王維玉

1.一種產(chǎn)生谷氨酰胺合成酶多肽的谷氨酰胺形成活性位點活性的試 驗抑制劑的計算機輔助方法，所述方法使用包括處理器和輸入設備的程 序式計算機，所述方法包括：

(a)向所述輸入設備輸入包括谷氨酰胺形成活性位點結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)；

(b)使用所述處理器將試驗抑制劑分子對接到所述谷氨酰胺形成活 性位點內(nèi)；以及

(c)基于所述對接，確定所述試驗抑制劑分子是否抑制所述谷氨酰 胺形成活性位點的活性。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，進一步包括將γ-谷氨酰磷酸部分對 接到所述活性位點內(nèi)。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，進一步包括生成由步驟(c)確定 的試驗抑制劑以抑制所述谷氨酰胺形成活性位點的活性并體外評價所述 試驗抑制劑對谷氨酰胺合成酶多肽的抑制活性。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其中所述體外評價包括使用能測量 ATP水解、ADP形成、AMP形成、谷氨酸利用或谷氨酰胺形成的分析法。

5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，進一步包括體外評價相對于去腺苷 酰化的谷氨酰胺合成酶多肽，所述試驗抑制劑對腺苷酰化的谷氨酰胺合 成酶多肽有差別的抑制活性。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，進一步包括生成所述試驗抑制劑并 評價所述試驗抑制劑對含有GSI-α或GSI-β谷氨酰胺合成酶基因的細菌 生長的抑制活性。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，其中所述GSI-β細菌選自GSI-β細 菌可選自白喉棒狀桿菌、淋球菌、大腸桿菌、鼠傷寒沙門氏桿菌、傷寒 沙門氏桿菌、肺炎克雷伯菌、粘質(zhì)沙雷氏菌、普通變形桿菌、痢疾志賀 菌、霍亂弧菌、銅綠假單孢菌、糞產(chǎn)堿桿菌、幽門螺桿菌、流感嗜血桿 菌、百日咳桿菌、支氣管炎博德特菌、腦膜炎奈瑟菌、羊布魯氏菌、結(jié) 核分枝桿菌、麻風分枝桿菌、梅毒密螺旋體、問號鉤端螺旋體、衣氏放 線菌、星形諾卡菌、氧化亞鐵硫桿菌、巴西固氮螺菌、魚腥藻、Fremyella diplosiphon和天藍色鏈霉菌，以及其中所述GSI-α細菌可選自蠟狀芽孢 桿菌、枯草芽孢桿菌、炭疽芽孢桿菌、肺炎鏈球菌、化膿鏈球菌、金黃 色葡萄球菌、肉毒梭菌、破傷風梭菌和產(chǎn)氣莢膜梭菌。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其中所述GSI-β細菌是結(jié)核分枝桿 菌。

9.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，進一步包括評價所述試驗抑制劑對 真核細胞生長的抑制活性。

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法，其中所述真核細胞是哺乳動物細 胞。

11.一種產(chǎn)生抑制谷氨酰胺合成酶多肽的谷氨酰胺形成活性位點活 性的化合物的方法，所述方法包括：

(a)提供谷氨酰胺合成酶多肽的谷氨酰胺形成活性位點的三維結(jié) 構(gòu)；以及

(b)基于所述三維結(jié)構(gòu)，設計能抑制所述谷氨酰胺形成活性位點和 γ-谷氨酰磷酸中間體之間相互作用的試驗化合物。

12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法，其中所述試驗化合物能抑制所述 谷氨酰胺形成活性位點的腺苷酰化催化三聯(lián)體位點和γ-谷氨酰磷酸中間 體之間的相互作用，或者能抑制所述谷氨酰胺形成活性位點的去腺苷酰 化催化三聯(lián)體位點和γ-谷氨酰磷酸中間體之間的相互作用。

13.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法，其中所述試驗化合物能抑制在所 述谷氨酰胺形成活性位點的腺苷酰化催化三聯(lián)體位點中酰基-酶中間體 的形成，或者能抑制在所述谷氨酰胺形成活性位點的去腺苷酰化催化三 聯(lián)體位點中酰基-酶中間體的形成。

14.根據(jù)權(quán)利要求12或13所述的方法，進一步包括生成步驟(b) 的所述試驗化合物并體外評價所述試驗化合物對谷氨酰胺合成酶多肽的 抑制活性。

15.根據(jù)權(quán)利要求12或13所述的方法，進一步包括生成步驟(b) 的所述試驗化合物并評價所述試驗化合物對含有GSI-α或GSI-β谷氨酰 胺合成酶基因的細菌生長的抑制活性。