[發(fā)明專利]結(jié)腸直腸癌的預后預測

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200680052902.3
• 申請日: 2006-12-22
• 公開（公告）號: CN101389957A
• 公開（公告）日: 2009-03-18
• 發(fā)明（設計）人: H·納卡爾達;J·弗里德里希斯;B·霍爾茨曼;R·羅森貝格;A·E·里夫;M·A·布拉克;J·L·麥考爾;Y－H·林;R·C·波洛克
• 申請（專利權(quán)）人: 環(huán)太平洋生物技術(shù)有限公司
• 主分類號: G01N33/50
• 分類號: G01N33/50;G01N33/53;G06F19/00;C12Q1/68;G01N33/68
• 代理公司: 永新專利商標代理有限公司
• 代理人: 康 健;林曉紅

1.預后信號在制備用于判斷CRC發(fā)展的診斷工具中的用途，所述預后 信號由FAS和ME2基因組成。

2.預后信號在制備用于判斷CRC發(fā)展的診斷工具中的用途，所述預后 信號由FAS和ME2基因和選自表1和2的一或多種基因組成。

3.如權(quán)利要求2所述的用途，其中所述預后信號選自表9中的任一信號。

4.一種判斷CRC預后的裝置，其包括：其上有一個或多個位點的基片， 每個位點上有預后信號的基因的寡核苷酸，所述預后信號由FAS和ME2基 因組成。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述裝置，其中所述預后信號還由選自表1和2的一 或多種基因組成。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述裝置，其中所述預后信號是選自表9中的任一預 后信號。

7.用于測定由FAS和ME2基因組成的預后信號的表達水平的試劑在制 備用于通過以下方法判斷患者CRC預后的試劑盒中的用途，所述方法包括 以下步驟：

（i）測定患者CRC腫瘤樣品中由FAS和ME2基因組成的預后信號 的表達水平；

（ii）應用預測模型，所述模型是通過將預測方法應用于復發(fā)和不復 發(fā)腫瘤樣品中預測信號的表達水平而建立的；

（iii）確定預后。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述用途，其中所述預后信號還由選自表1和2的一 或多種基因組成。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述用途，其中信號選自表9中的任一預后信號。

10.根據(jù)權(quán)利要求7所述用途，其中所述預測方法選自線性模型(linear? model)，支持矢量機(support?vector?machine)，神經(jīng)網(wǎng)絡(neural?networks)，分 類和回歸樹(classification?and?regression?trees)，集結(jié)學習方法(ensemble? learning?methods)，差異分析(discriminant?analysis)，最近鄰法(nearest?neighbor? method)，貝葉斯網(wǎng)絡(Bayesian?networks)，獨立成分分析(independent? components?analysis)組成的組。

11.根據(jù)權(quán)利要求7-10任一所述的用途，其中測定預后信號表達水平 的步驟是通過檢測每種基因的mRNA表達水平來進行的。

12.根據(jù)權(quán)利要求7-10任一所述的用途，其中測定預后信號表達水平 的步驟是通過檢測每種基因的cDNA表達水平來進行的。

13.根據(jù)權(quán)利要求12所述的用途，其中測定預后信號表達水平的步驟 是利用與所述cDNA的至少一部分互補的核苷酸來進行的。

14.根據(jù)權(quán)利要求11所述的用途，其中測定預后信號表達水平的步驟 是通過使用qPCR方法來進行的，其中所述qPCR方法利用正向引物和反向 引物。

15.根據(jù)權(quán)利要求11所述的用途，其中測定預后信號表達水平的步驟 使用權(quán)利要求4-6任一所述的裝置來進行的。

16.根據(jù)權(quán)利要求7-10任一所述用途，其中測定預后信號表達水平的 步驟是通過檢測每種基因的蛋白表達水平來進行的。

17.根據(jù)權(quán)利要求7-10任一所述用途，其中測定預后信號表達水平的 步驟是通過檢測每種基因的肽表達水平來進行的。

18.根據(jù)權(quán)利要求16所述用途，其中所述的檢測步驟利用針對每種基 因的蛋白的抗體來進行。

19.根據(jù)權(quán)利要求17所述用途，其中所述的檢測步驟利用針對每種基 因的肽的抗體來進行。

20.根據(jù)權(quán)利要求16所述用途，其中所述檢測步驟利用夾心免疫測定 法(sandwich-type?immunoassay?method)來進行。