[發明專利]通過ERCC2基因和PARP1基因的SNPs位點進行肺癌易感性檢測的試劑盒

無效

• 申請號: 200610030952.3
• 申請日: 2006-09-08
• 公開（公告）號: CN101140231A
• 公開（公告）日: 2008-03-12
• 發明（設計）人: 馮哲民;鄒祖燁
• 申請（專利權）人: 上海主健生物工程有限公司
• 主分類號: G01N21/64
• 分類號: G01N21/64;C12Q1/68
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明涉及一種疾病易感性檢測用的試劑盒，尤其是一種檢測肺癌易感性的試劑盒，通過同時檢測切除修復復合物2(Excision?Repair?Cross-complementing?Rodent?Repair?Deficiency，Complementation?Group?2，ERCC2)的單核苷酸多態性(SNP)位點與多聚ADP核糖轉移酶家族成員1(poly(ADP-ribose)polymerasefamily，member?1，PARP1，又簡寫為ADPRT)的單核苷酸多態性位點來預測個體對肺癌的易感性。

背景技術

原發性支氣管肺癌，簡稱肺癌，為當前世界各地最常見的惡性腫瘤之一，是一種嚴重威脅人類健康和生命的疾病。腫瘤細胞源于支氣管粘膜或腺體，常有區域性淋巴結和血行轉移，早期常有刺激性咳嗽、痰中帶血等呼吸道癥狀，病情進展速度與細胞的生物特性有關。

半個世紀以來，世界各國肺癌的發病率和病死率都有明顯增高趨勢。世界衛生組織(WHO)2000年報告：1997年全世界死于惡性腫瘤的共706.5萬人，占死亡人數的12.6％，其中肺癌占惡性腫瘤死亡的19％，居惡性腫瘤死因的第一位。我國1990～1992年的抽樣調查顯示，在城市人口的腫瘤死亡中，肺癌由原來的第4位上升為第1位，農村上升最快的也是肺癌。云南錫礦的肺癌發病率在1954～1959年間為28.02/10萬，1960～1969年間為197.87/10萬，1970～1979年間上升到219.10/10萬，這在全世界也是罕見的。英國著名腫瘤學家R.Peto預言：如果我國不及時控制吸煙和空氣污染，到2025年我國每年肺癌將超過100萬，成為世界第一肺癌大國。

病因和發病機制迄今尚未明確。一致認為肺癌的發病與下列因素有關：①吸煙(包括主動吸煙和被動吸煙)；②職業致癌因子，已被確認的致人類肺癌的職業因素包括石棉、無機砷化合物、二氯甲醚、鉻及其化合物、鎳、氡、芥子氣、氯乙烯、煤煙、焦油和石油中的多環芳烴、煙草的加熱產物等；③空氣污染(包括室內小環境和室外大環境污染)；④電離輻射；⑤飲食與營養，美國紐約和芝加哥開展的前瞻性人群觀察的結果說明，食物中天然維生素A類、β胡蘿卜素的攝入量與十幾年后癌癥的發生呈負相關，其中最突出的是肺癌；⑥其它，美國癌癥學會將結核列為肺癌的發病因素之一。結核病者患肺癌的危險性是正常人群的10倍。其主要組織學類型是腺癌。此外，病毒感染、真菌毒素(黃曲霉)、機體免疫功能低下、內分泌失調以及家族遺傳等因素，對肺癌的發生可能也起一定的綜合作用。

近年研究表明，肺癌的發生與某些癌基因的活化及抑癌基因的失活密切相關。已經證明的幾個癌基因家族包括引起突變的ras族、放大基因的myc族、C-erB2、機制不明的bcl-2、Kit及由野生型變異的抗癌基因p53、p16和RB等。大量研究表明C-myc、L-myc、N-myc和RAF在小細胞肺癌中均有過度表達。非小細胞肺癌中則常可見ras族基因的過度表達。這些深入的研究將為基因預防和治療肺癌提供理論基礎。

SNP(single?nucleotide?polymorphism)，即單核苷酸多態性標記，是一類基于單堿基變異引起的DNA多態性，被遺傳學界稱為第三代遺傳標記。主要是指由基因組核苷酸水平上的變異引起的DNA序列多態性，包括單堿基轉換、顛換，以及單堿基的插入/缺失等。它是基因組中最為廣泛存在的一類多態性標記，占大約90％。這些基因組序列變異可以導致個體間表型的差異以及不同個體對疾病，特別是復雜疾病的易感性和對環境因素、藥物反應的差異。

ERCC2，位于第19號染色體19q13.3位置，共有23個外顯子，基因全長19.0kb，mRNA全長2355bp，編碼含761個氨基酸的蛋白。由ERCC2編碼的蛋白參與轉錄偶聯的核苷酸切除修復，它可識別與修復結構無關的大范圍的損傷，如大的加合物和胸腺嘧啶二聚體，并且是基本轉錄因子復合物BTF2/TFIIH的一個組成成分。該蛋白具有ATP依賴性的DNA解旋活性，屬于RAD3/XPD解旋酶亞家族。ERCC2的功能缺失導致基本轉錄因子復合物不能正確識別DNA損傷位點，從而使堿基切除修復無法正確進行，導致DNA上的致癌損傷積累。ERCC2基因的突變或者失活可能導致的疾病包括：癌癥、著色性干皮病、毛發硫營養不良、柯凱因氏綜合癥。