[發明專利]確定基因毒性的方法

無效

• 申請號: 200580040359.0
• 申請日: 2005-11-15
• 公開（公告）號: CN101065501A
• 公開（公告）日: 2007-10-31
• 發明（設計）人: J·D·阿拉德;D·M·艾于德;G·廖;G·A·佩爾茨
• 申請（專利權）人: 弗·哈夫曼－拉羅切有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/63
• 代理公司: 北京市中咨律師事務所
• 代理人: 黃革生;隗永良

1.確定測試化合物基因毒性的方法，所述方法包括：

(a)用所述測試化合物接觸活的測試細胞；

(b)確定選自如下的指示基因的表達水平的變化：Prelp(富含脯氨酸精氨酸末端富含亮氨酸重復)、Sesn2(Sestrin?2)、4833427G06?Rik(RIKEN?cDNA)、Dda3(差異顯示并為p53激活)、Usp30(泛素特異性蛋白酶30)、0610013D04?Rik(RIKEN?cDNA)、Slc19a2(可溶載體家族19(硫胺素轉運蛋白)，成員2)、Trp53inp1(轉化相關蛋白質53，誘導型核蛋白1)、D4Ertd421e(DNA區段，染色體4，ERATO?Doi?421，表達的)、Shcbp1(Shc?SH2結構域結合蛋白1)、Mki67(由MAb?Ki67鑒定的抗原)、Phex(磷酸調控神經內肽酶(X染色體))、Tk1(胸苷激酶1)、Mmhead(小家鼠15日胚胎頭部cDNA克隆)、Osbpl6(氧固醇結合蛋白樣6)、Mphosph1(M期磷蛋白)、Ephx1(環氧化物水解酶1(微粒體異生素水解酶))、Top2a(拓撲異構酶(DNA)IIα)、Ccng1(細胞周期素G1)、Plf(增殖蛋白)、Np95(核蛋白95)、Rad51ap1(RAD51相關蛋白1)、Nos3(一氧化氮合成酶3，內皮細胞)、2610005B21?Rik(RIKEN?cDNA)、Brca1(乳腺癌1)、Stk18(絲氨酸/蘇氨酸激酶18)、Calmbp1(鈣調蛋白結合蛋白1)、Lek1(亮氨酸、谷氨酸、賴氨酸家族1蛋白)、Smc2l1(SMC2染色體結構維持蛋白2樣1)、E2f7(E2F轉錄因子7)、Hmmr(透明質酸介導的移動受體(RHAMM))、Nusap1(核仁及紡錘體相關蛋白1)、Fbxo5(f-box唯一蛋白31)、Slc19a2(可溶載體家族19(硫胺素轉運蛋白)，成員2)、9030617O03?Rik(RIKENcDNA)、Ly6e(淋巴細胞抗原6復合物，基因座E)、6530401L14?Rik(RIKEN?cDNA)、Mad3(Max二聚體蛋白3)、Hmgb2(高遷移率族蛋白2)、Kif11(驅動蛋白11)、Mad2l1(MAD2(有絲分裂阻滯缺陷同源物)樣1(酵母))、Asf1b(ASF1抗靜默功能1同源物B(酵母菌屬))、Mcm3(微型染色體維持缺陷3(酵母菌屬))、MGC：32192(小家鼠cDNA克隆MGC：32192?IMAGE：5006129)、Foxm1(叉頭框蛋白M1)、Anxa8(膜聯蛋白A8)、Slc35a5(可溶載體家族35，成員A5)、E030024M05?Rik(RIKENcDNA)、Cks2(CDC28蛋白激酶調控亞基2)、Cilp(軟骨中間層蛋白)、Tacc3(包含卷曲螺旋的酸性轉化蛋白3)、Prc1(胞質分裂蛋白調控因子1)、2610509G12?Rik(RIKEN?cDNA)、2810417H13?Rik(RIKEN?cDNA)、Pbk(PDZ結合激酶)、Capn6(鈣蛋白酶6)、Gmnn(Geminin)、Mcmd4(微型染色體維持缺陷4同源物)、Ccna2(細胞周期素A2)、Pola1(DNA聚合酶α1，180kDa)、Hmgb3(高遷移率族蛋白3)、Tagln(Transgelin(平滑肌22蛋白))、1600013K19?Rik(RIKEN?cDNA)、Serpine1(絲氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制劑E進化枝成員1)，Wig1(野生型p53誘導的基因1)、Hgf(肝細胞生長因子(分散因子))、Gepi(葡糖胺-6-磷酸脫氨酶，Birc5(含桿狀病毒IAP重復5)、Prim1(DNA引發酶p49亞基)、Rb??(成視網膜細胞瘤樣1(p107))、Pcna(增殖細胞核抗原)、E130315?K1?Rik(RIKEN?cDNA)、2610019I03?RIK(RIKEN?cDNA)；

其中，至少1.5倍的表達增強表明所述化合物具有基因毒性。

2.權利要求1的方法，其中所述指示基因選自4833427G06Rik和Dda3。

3.權利要求1或2的方法，其中所述測試細胞包括成肌細胞。

4.權利要求1或2的方法，其中測試細胞選自小鼠、大鼠、斑馬魚、人、黑猩猩及雞的胚細胞。

5.權利要求1到4中任意一項的方法，其中確定表達水平的變化包括用RT-PCR測量產生的mRNA量。