[發(fā)明專利]針對表觀遺傳學(xué)上沉默的腫瘤抑制基因的基因組篩選

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 03809647.1
• 申請日: 2003-03-07
• 公開（公告）號: CN101080499A
• 公開（公告）日: 2007-11-28
• 發(fā)明（設(shè)計）人: D·西德蘭斯基;S·B·貝林;J·赫爾曼;H·鈴木
• 申請（專利權(quán)）人: 約翰霍普金斯大學(xué)
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C07H21/02;C07H21/04
• 代理公司: 北京紀凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司
• 代理人: 趙蓉民;路小龍

1.一種鑒定與癌癥相關(guān)的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因的方法，包括：

a)在適于核酸分子與陣列上互補的核苷酸序列發(fā)生選擇性雜交的條件下，將對應(yīng)于在癌細胞中表達的RNA的核酸分子與代表基因組的核苷酸序列陣列接觸，所述的癌細胞與能夠重新激活表觀遺傳學(xué)沉默基因的表達的至少一種試劑接觸過；和

b)檢測來自于與所述的至少一種試劑接觸過的癌細胞的核酸分子與所述陣列上一部分核苷酸序列雜交量的增加，

所述增加是相對于在所述條件下對應(yīng)于在所述癌細胞中表達的RNA的核酸分子與所述的那部分核苷酸序列中的至少一種核苷酸序列的雜交水平，

由此所述的增加的選擇性雜交便鑒定出表觀遺傳學(xué)沉默基因的被激活的表達，

這樣就鑒定出與所述癌癥相關(guān)的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因。

2.權(quán)利要求1的方法，其中所述的重新激活表觀遺傳學(xué)沉默基因的表達的試劑包括甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑，組蛋白脫乙酰酶抑制劑，或者它們的組合。

3.權(quán)利要求2的方法，其中所述的甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑是5-氮雜-2′-脫氧胞苷。

4.權(quán)利要求2的方法，其中所述的組蛋白脫乙酰酶抑制劑是曲古抑菌素A。

5.權(quán)利要求1的方法，其中所述的對應(yīng)于RNA的核酸分子包括cRNA。

6.權(quán)利要求1的方法，包括將所述陣列與對應(yīng)于在癌細胞中表達的RNA的核酸分子接觸，所述癌細胞與5-氮雜-2′-脫氧胞苷，曲古抑菌素A，或者它們的組合接觸過。

7.權(quán)利要求1的方法，其中所述的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因包括在表2中所列的核酸分子，或者是其組合。

8.權(quán)利要求1的方法，其中所述的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因包括含有載脂蛋白D，神經(jīng)介肽U，swiprosin-2，Hep27，KIF5C，角蛋白14，轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶2，MUC1，白介素-1R2，晶體蛋白α2，含LIM結(jié)構(gòu)域的半胱氨酸富含蛋白(CRIP-1)，Rad，HEM45，KLF6，類卵泡抑素蛋白FLRG，XAP-5，Tbc1d1，細胞周期蛋白G1相互作用蛋白或者是其組合的核酸分子。

9.權(quán)利要求1的方法，其中所述的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因包括載脂蛋白D，神經(jīng)介肽U，swiprosin-2，細胞因子樣因子-1(CLF-1)，CRIP-1，細胞視黃醇結(jié)合蛋白，金屬硫蛋白1G，角蛋白14，白介素-1受體2，晶體蛋白α2，或者是這些基因的組合。

10.權(quán)利要求1的方法，其中所述的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因包括甲基化沉默基因。

11.權(quán)利要求10的方法，其中所述的至少一種甲基化沉默基因包括載脂蛋白D，神經(jīng)介肽U，CLF-1，CRIP-1，claudin-3，非配對蛋白2，金屬硫蛋白1G，轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶2，載脂蛋白C1，或者是這些基因的組合。

12.權(quán)利要求1的方法，其中所述的至少一種表觀遺傳學(xué)沉默基因包括腫瘤抑制基因。

13.權(quán)利要求12的方法，其中所述的腫瘤抑制基因包括載脂蛋白D，神經(jīng)介肽U，或者是CRIP-1。

14.權(quán)利要求12的方法，其中所述的腫瘤抑制基因包括神經(jīng)介肽B，或者G蛋白信號通路受體2(RGS2)。

15.權(quán)利要求1的方法，其中所述癌癥是食道鱗片狀細胞癌。

16.權(quán)利要求1的方法，其中所述癌癥是頭頸部鱗片狀細胞癌。

17.一種鑒定表現(xiàn)出或者將要表現(xiàn)出失控生長的細胞的方法，包括檢測在受測細胞中包括列在表2，表5，表6或者其組合中的核酸分子的至少一種基因的表觀遺傳學(xué)沉默，由此確定受測細胞是表現(xiàn)出生長失控的細胞或者將要表現(xiàn)出生長失控的細胞。