[發明專利]治療乙肝病毒感染的靶向核糖核酸酶的制備工藝無效
| 申請號: | 02114435.4 | 申請日: | 2002-02-05 |
| 公開(公告)號: | CN1364898A | 公開(公告)日: | 2002-08-21 |
| 發明(設計)人: | 劉軍;薛采芳 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍第四軍醫大學 |
| 主分類號: | C12N9/22 | 分類號: | C12N9/22;C12N15/11;C12N15/63;C12N15/70;C12Q1/68;A61K38/46 |
| 代理公司: | 西安通大專利代理有限責任公司 | 代理人: | 徐文權 |
| 地址: | 710032 *** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 治療 乙肝 病毒感染 靶向 核糖 核酸酶 制備 工藝 | ||
1、一種治療乙肝病毒感染的靶向核糖核酸酶的制備工藝,其特征在于:
1)hEDN編碼基因的擴增及測序
1.1根據hEDN基因序列進行引物設計
正向引物:5′-GCG?CGG?ATC?CAC?CAT?GAA?ACC?TCC?ACA?GTT?TAC-3′;
反向引物:5′-GCG?CGA?GCT?CGA?TGA?TTC?TAT?CCA?GGT?G-3′;
正向引物及反向引物的5′端分別帶有BamH?I和Sac?I酶切位點;
1.2擴增目的基因
在5×106~10×106的HL-60細胞中加入1ml的Trizol,反復吹打,在15℃~30℃下放置5分鐘,然后加入0.2ml的氯仿,劇烈震動15秒,在15℃~30℃下放置2-3分鐘后在2℃--8℃、12000g的相對離心力下離心15分鐘,吸取上層水相;
在上層水相中加入0.5ml的異丙醇,在15℃~30℃下放置10分鐘后在2℃~8℃、12000g的相對離心力下離心10分鐘,去上清,得到HL-60細胞的總RNA;
應用One?Step?RNA?PCR?kit試劑盒,在每個PCR聚合酶鏈式反應管中加入5μl的10×One?Step?RNA?PCR?Buffer、10μl濃度為25mmol/L的MgCl2、5μl濃度為10mmol/L的dNTP、1μl的RNase?Inhibitor、1μl的AMV?ReverseTranscriptase?XL、1μl的AMV-optimized?Taq、1μl正向引物、1μl的反向引物、1μl的模板RNA和24μl的無RNA酶的純水混合后,分別置于50℃下30min反應一次、94℃下2min反應一次,然后再置于94℃下30s、55-65℃下30s、72℃延伸1-10min分別循環25-40次;
2)HBVc編碼基因的擴增及測序
2.1根據HBVc編碼基因的基因序列進行引物設計
正向引物:5′-GCG?CGA?GCT?CAT?GGA?CAT?CGA?CCC?TTA?T-3′;
反向引物:5′-GCG?CAA?GCT?TTT?AAC?ATT?GAG?GTT?CCC?GAG?A-3′;
正向引物及反向引物的5′端分別帶有Sac?I和Hind?III酶切位點;
2.2擴增目的基因
向2.2.15細胞加入1ml/10cm2的Trizol,在15℃~30℃下放置5分鐘后,加入0.2ml/1ml?Trizol的氯仿,劇烈震動15秒,再在15-30℃下放置2-3分鐘后,在2℃~8℃、12000g的相對離心力下離心15分鐘,吸取上層水相;
在上層水相中加入0.5ml/1ml?Trizol的異丙醇,15-30℃下放置10分鐘,2℃~8℃、12000g的相對離心力下離心10分鐘,去上清,得到2.2.15細胞的總RNA;
應用One?Step?RNA?PCR?kit試劑盒,在每個PCR聚合酶鏈式反應管中加入5μl的10×One?Step?RNA?PCR?Buffer、10μl濃度為25mmol/L的MgCl2、5μl濃度為10mmol/L的dNTP、1μl的RNase?Inhibitor、1μl的AMV?ReverseTranscriptase?XL、1μl的AMV-optimized?Taq、1μl正向引物、1μl的反向引物、1μl的模板RNA和24μl的無RNA酶的純水混合后,置于50℃下30min、94℃下2min反應一次,然后再置于94℃下30s、55-65℃下30s、72℃延伸1-10min分別循環25-40次,得到PCR產物;
2.3克隆與測序
將hEDN和HBVc的產物PCR經1.0-1.5%瓊脂糖凝膠電泳后用NucleoTrapNucleic?Acid?Purification?Kit試劑盒,進行純化回收;
將回收產物分別用BamH?I和Sac?I、Sac?I和Hind?III酶切后純化回收,分別與用BamH?I和Sac?I及Sac?I和Hind?III酶切后純化回收的pUC18連接;連接產物轉化大腸桿菌JM109株,以High?Pure?Plasmid?Isolation?Kit試劑盒,提取質粒,再用BamH?I和SacI及Sac?I和Hind?III酶切鑒定;
序列測定采用雙脫氧鏈末端終止法,以ABI377DNA自動序列測定儀進行;
2.4靶向核糖核酸酶真核表達載體構建
將擴增的hEDN及HBVc編碼基因分別用BamH?I和Sac?I、Sac?I和Hind?III雙酶切,將真核表達載體經BamH?I和Hind?III雙酶切后,以T4連接酶連接hEDN、HBVc、pcDNA3.1(-)酶切片段,轉化E.coli?JM109感受態細胞;
用含Amp的固體培養基(LB)篩選陽性克隆,經小量提取質粒,并酶切鑒定后,構建融合真核表達載體pcDNA3.1(-)/hEDN-HBVc;
2.5帶有柔性的(Gly4Ser)3連接區的靶向核糖核酸酶真核表達載體構建
2.5.1柔性連接區編碼基因的合成首先合成兩條互補的寡核苷酸鏈,序列如下:
P1?5’gcgcggatcc?ggt?ggc?ggt?ggc?tcg?ggc?ggt?ggt?ggg?tcg?ggt?ggcggc?gga?tct?gagctc?gcgc3’
P2?5’gcgcgagctc?aga?tcc?gcc?gcc?acc?cga?ccc?acc?acc?gcc?cga?gccacc?gcc?acc?ggatcc?gcgc3’
將上述兩條寡核苷酸鏈以無菌雙蒸水稀釋至濃度為40μmmol/L,各取15μL混勻后,分別置于94℃下5分鐘使兩條寡核苷酸鏈變性,再分別置于80℃下5分鐘、75℃下5分鐘、70℃下5分鐘、65℃下5分鐘、60℃下5分鐘、55℃下10分鐘使兩條寡核苷酸鏈復性;
將復性后的產物經1.5-2%瓊脂糖凝膠電泳后純化回收,即為柔性連接區編碼基因;
2.5.2帶有柔性的(Gly4Ser)3連接區的靶向核糖核酸酶真核表達載體構建
將融合真核表達載體pcDNA3.1(-)/hEDN-HBVc經Bam?I和Sac?I雙酶切后形成的大片斷命名為p/HBV;
將純化回收的p/HBV與經BamH?I和Sac?I雙酶切的經變性、復性后的兩條寡核苷酸鏈柔性連接區編碼基因以T4連接酶連接,形成重組質粒p/LHBV;
將p/LHBV以BamH?I酶切,Klenow補平,Hind?III酶切后,純化回收小片斷LHBV;
融合真核表達載體pcDNA3.1(-)/hEDN-HBVc經Sac?I酶切,T4?DNA多聚酶削平,Hind?III酶切后,純化回收大片斷p/hEDN;
將LHBV和p/hEDN以T4連接酶連接,轉化E.coli?JM109感受態細胞;用含Amp的固體培養基(LB)篩選陽性克隆,經小量提取質粒,并酶切鑒定后,構建帶有柔性的(Gly4Ser)3連接區的靶向核糖核酸酶真核表達載體p/LTR。
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