[發明專利]一種新的多肽——人S4核糖體蛋白13.97和編碼這種多肽的多核苷酸無效
| 申請號: | 00117077.5 | 申請日: | 2000-07-07 |
| 公開(公告)號: | CN1333268A | 公開(公告)日: | 2002-01-30 |
| 發明(設計)人: | 毛裕民;謝毅 | 申請(專利權)人: | 上海博德基因開發有限公司 |
| 主分類號: | C07K14/435 | 分類號: | C07K14/435;C07K14/00;C07K16/18;C07K16/00;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/17;A61K38/16;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 多肽 s4 核糖體 蛋白 13.97 編碼 這種 多核苷酸 | ||
本發明屬于生物技術領域,具體地說,本發明描述了一種新的多肽——人S4核糖體蛋白13.97,以及編碼此多肽的多核苷酸序列。本發明還涉及此多核苷酸和多肽的制備方法和應用。
核糖體是合成蛋白質的細胞器,其唯一功能是按照mRNA的指令由氨基酸合成多肽鏈,它被稱為核糖核蛋白體,簡稱為核蛋白體或核糖體。核糖體幾乎存在于一切細胞內,無論原核還是真核細胞,均有大量的核糖體存在。核糖體是一種顆粒狀結構,沒有膜包裹,其直徑為25nm,主要成分為蛋白質和RNA,核糖體RNA稱為rRNA,蛋白質含量約占40%,RNA約占60%。蛋白質分子主要分布在核糖體的表面,而rRNA則位于內部,兩者靠非共價鍵結合在一起。(細胞生物學翟中和高等教育出版社pp122-129)核糖體的功能研究將焦點放到了核糖體RNA上,有很多rRNA功能域決定著核糖體的不同功能。(Annu?Rev?Biochem?1991;60?191-227)
S4是最重要的核糖體蛋白之一,它是原核生物小亞單位30S的一種結合蛋白,同樣它在真核生物中也有人S4核糖體蛋白,行使相同的生物學功能。在細菌和葉綠體中均有S4的表達,在酵母、高等植物、動物體內也發現有S4及其人S4核糖體蛋白。
對核糖體蛋白S4晶體研究(由于S4的N末端有41個不易結晶的氨基酸,因此切除此41個氨基酸殘基的剩余部分的結晶,稱為S4delta-41)的結果表明,S4delta-41有兩個功能域,功能域1都是alfa螺旋結構,功能域2含有5個平行的beta折疊結構和3個alfa螺旋結構。功能域2是插入在功能域1之中的,功能域2還與真核生物轉錄因子的ETS功能域同源。從結構上看,S4的二級結構的序列為α1-α2-α3-α4-α5-β1-β2-β3-α6-β4-β5-α7,其中功能域1全是α螺旋(α1-α2-α3-α7),功能域2是α4-α5-β1-β2-β3-α6-β4-β5,并插入在功能域1之中。此外,具體的結構也已經得到闡明,有文獻可供參考。(The?EMBOJournal?Vol?17?No16?pp4545-4558,1998)
S4是核糖體的重要組分,原核生物的S4可結合于16S?rRNA,從而影響翻譯的準確性、16S?rRNA的高級結構等等。(Nowotny?and?Nierhaus,1988;Allenand?Noller,1989)根據研究,在缺少其他蛋白的情況下,S4也能與16SrRNA相互作用。
S4也是一種RNA結合蛋白,與其他核糖體蛋白一樣,原核生物的S4核糖體蛋白可以結合于編碼自身的mRNA(α操縱子mRNA)結合從而調控自身的表達,由于α操縱子mRNA除編碼S4外,還編碼S11,S13和L17,所以S4可以通過結合于多聚順反子mRNA從而調控自身和其他一些核糖體蛋白的表達。(Dean?andNomura,1980;Thomas?et?al.,1987)(The?EMBO?Journal?Vol?17?No16pp4559-4571,1998)
S4與rRNA和mRNA的結合位點的氨基酸序列沒有特別的同源性,但這兩種RNA的結構相似性也未得到證明,此方面還有待進一步研究。
目前的實驗的結果還表明,S4在30S的裝配過程、保持翻譯的真實性中起作用。
綜上所述,S4核糖體蛋白的功能如下:(1)在原核生物中S4可以結合于16SrRNA,從而影響翻譯的準確性、16S?rRNA的高級結構等等,推測S4在真核生物細胞內也有同樣功能;(2)S4也可結合于編碼自身的mRNA,從而調控自身和其他一些核糖體蛋白的表達;(3)S4還可以促進核糖體的小亞基的裝配,在小亞基的裝配過程、保持翻譯的真實性中起作用;(4)S4還與真核生物轉錄因子的ETS功能域同源,因此被推測可以調控真核生物的轉錄過程。
通過基因芯片的分析發現,在膀胱粘膜、PMA+的Ecv304細胞株、LPS+的Ecv304細胞株胸腺、正常成纖維細胞1024NC、Fibroblast,生長因子刺激,1024NT、疤痕成fc生長因子刺激,1013HT、疤痕成fc未用生長因子刺激,1013HC、膀胱癌建株細胞EJ、膀胱癌旁、膀胱癌、肝癌、肝癌細胞株、胎皮、脾臟、前列腺癌、空腸腺癌、賁門癌中,本發明的多肽的表達譜與人S4核糖體蛋白的表達譜非常近似,因此二者功能也可能類似。本發明被命名為人S4核糖體蛋白13.97。
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