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[發明專利]一種新的多肽——skm-Bop蛋白39和編碼這種多肽的多核苷酸無效

專利信息
申請號: 00116893.2 申請日: 2000-06-30
公開(公告)號: CN1331104A 公開(公告)日: 2002-01-16
發明(設計)人: 毛裕民;謝毅 申請(專利權)人: 上海博德基因開發有限公司
主分類號: C07K14/00 分類號: C07K14/00;C07K14/435;C07K16/00;C07K16/18;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/16;A61K38/17;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 200092 上海市*** 國省代碼: 上海;31
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 多肽 skm bop 蛋白 39 編碼 這種 多核苷酸
【說明書】:

發明屬于生物技術領域,具體地說,本發明描述了一種新的多肽——skm-Bop蛋白39,以及編碼此多肽的多核苷酸序列。本發明還涉及此多核苷酸和多肽的制備方法和應用。

在CD8b基因的轉錄起始位點之前的195個核甘酸里有2個具有啟動子作用的基因(Hwang,I.et?al.,1995,Immunogeneteics,42:353)。一個與CD8b基因的轉錄方向相同,另一個相反并且非常靠近CD8b基因。這個相反的基因就是Bop基因。

Bop基因的前體mRNA有兩種剪接形式。一種mRNA編碼有456個氨基酸的蛋白質(t-BOP),另一種mRNA編碼帶有一個短的開放閱讀框57個氨基酸的蛋白質(t-ncb)。這兩種蛋白質的cDNA的5端是一致的。在人類心肌以及小鼠心臟和骨骼肌中發現大約3kb的與Bop基因同源的新基因轉錄本,這個新基因就叫skm-Bop基因。skm-Bop基因mRNA又有兩種剪接形式,一種叫skm-Bop1,另一種叫skm-Bop2。skm-Bop1蛋白包含490個氨基酸,其N端的445個氨基酸與t-BOP幾乎是一致的,在此區域內只有t-Bop的61、126、和310位置以及其他幾個氨基酸是不同的。skm-Bop2蛋白包含477個氨基酸,缺少skm-Bop1中的221-233位置的氨基酸。

skm-Bop蛋白有鋅指結構域。鋅指結構域在蛋白質與核甘酸結合、蛋白質與蛋白質結合、蛋白質與酶結合中起著至關重要的作用(Coleman,J.etal.,1992,Annu.Rev.Biochem.61:897)。

skm-Bop的cDNA5端非編碼區大約1451個核甘酸長,后面緊跟一個編碼45個氨基酸的序列。這45個氨基酸由一個外顯子編碼。這個外顯子同時也編碼t-BOP的N端序列。skm-Bop蛋白主要在人的心肌和骨骼肌以及腎臟中表達。所以,如果該蛋白表達異常,則會導致這些器官的相關病變。

本發明人的多肽與skm-Bop蛋白在蛋白質水平上有29%的一致性和54%的同源性,并具有相似的結構,故命名為skm-Bop52,同時推測其有相似的生物學功能。

由于如上所述skm-Bop蛋白39蛋白在調節細胞分裂和胚胎發育等機體重要功能中起重要作用,而且相信這些調節過程中涉及大量的蛋白,因而本領域中一直需要鑒定更多參與這些過程的skm-Bop蛋白39蛋白,特別是鑒定這種蛋白的氨基酸序列。新skm-Bop蛋白39蛋白編碼基因的分離也為研究確定該蛋白在健康和疾病狀態下的作用提供了基礎。這種蛋白可能構成開發疾病診斷和/或治療藥的基礎,因此分離其編碼DNA是非常重要的。

本發明的一個目的是提供分離的新的多肽——skm-Bop蛋白39以及其片段、類似物和衍生物。

本發明的另一個目的是提供編碼該多肽的多核苷酸。

本發明的另一個目的是提供含有編碼skm-Bop蛋白39的多核苷酸的重組載體。

本發明的另一個目的是提供含有編碼skm-Bop蛋白39的多核苷酸的基因工程化宿主細胞。

本發明的另一個目的是提供生產skm-Bop蛋白39的方法。

本發明的另一個目的是提供針對本發明的多肽——skm-Bop蛋白39的抗體。

本發明的另一個目的是提供了針對本發明多肽——skm-Bop蛋白39的模擬化合物、拮抗劑、激動劑、抑制劑。

本發明的另一個目的是提供診斷治療與skm-Bop蛋白39異常相關的疾病的方法。

本發明涉及一種分離的多肽,該多肽是人源的,它包含:具有SEQ?ID?No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性變體、生物活性片段或衍生物。較佳地,該多肽是具有SEQ?ID?NO:2氨基酸序列的多肽。

本發明還涉及一種分離的多核苷酸,它包含選自下組的一種核苷酸序列或其變體:

(a)編碼具有SEQ?ID?No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸;

(b)與多核苷酸(a)互補的多核苷酸;

(c)與(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70%相同性的多核苷酸。

更佳地,該多核苷酸的序列是選自下組的一種:(a)具有SEQ?ID?NO:1中192-1241位的序列;和(b)具有SEQ?ID?NO:1中1-1621位的序列。

本發明另外涉及一種含有本發明多核苷酸的載體,特別是表達載體;一種用該載體遺傳工程化的宿主細胞,包括轉化、轉導或轉染的宿主細胞;一種包括培養所述宿主細胞和回收表達產物的制備本發明多肽的方法。

本發明還涉及一種能與本發明多肽特異性結合的抗體。

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