[發(fā)明專利]循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析儀在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202310671528.0 | 申請日: | 2023-06-08 |
| 公開(公告)號: | CN116434226A | 公開(公告)日: | 2023-07-14 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張開山;饒浪晴;余弦;趙丹;于磊;馬寧;李超;郭志敏;劉艷省;田華 | 申請(專利權(quán))人: | 杭州華得森生物技術(shù)有限公司 |
| 主分類號: | G06V20/69 | 分類號: | G06V20/69;G01N21/64;G06V10/26;G06V10/774;G06V10/80;G06V10/82;G06N3/0464;G06N3/08;C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京恒泰銘睿知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11642 | 代理人: | 何平 |
| 地址: | 310000 浙江省*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 循環(huán) 腫瘤 細(xì)胞 分析 | ||
1.一種循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析儀,其特征在于,包括:
FISH圖像采集模塊,用于獲取由熒光顯微鏡采集的FISH圖像;
圖像特征提取模塊,用于將所述FISH圖像通過基于金字塔網(wǎng)絡(luò)的圖像特征提取器以得到FISH特征圖,其中,所述金字塔網(wǎng)絡(luò)的最后一個卷積層輸出的特征圖為所述深度FISH特征圖;
動態(tài)濾波模塊,用于將所述FISH特征圖通過基于卷積核的動態(tài)濾波器以得到濾波后FISH特征圖;
特征圖展開模塊,用于將所述濾波后FISH特征圖沿通道維度的各個特征矩陣展開為特征向量以得到FISH特征向量的序列;
上下文語義關(guān)聯(lián)編碼模塊,用于將所述FISH特征向量的序列通過基于轉(zhuǎn)換器的上下文編碼器以得到多個FISH圖像全局上下文語義關(guān)聯(lián)特征向量;
圖像語義分割模塊,用于將所述多個FISH圖像全局上下文語義關(guān)聯(lián)特征向量二維排列為二維特征矩陣后進(jìn)行圖像語義分割以得到循環(huán)腫瘤細(xì)胞預(yù)測圖;
第一全連接模塊,用于將所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞預(yù)測圖通過第一全連接層以得到循環(huán)腫瘤細(xì)胞全連接特征向量;
第二全連接模塊,用于將所述深度FISH特征圖通過第二全連接層以得到FISH深度特征向量;
特征融合模塊,用于融合所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞全連接特征向量和所述FISH深度特征向量以得到融合特征向量;
特征優(yōu)化模塊,用于對所述融合特征向量進(jìn)行特征流形曲面的基于鄰域點(diǎn)的切平面有向距離歸一化以得到優(yōu)化后融合特征向量;以及
數(shù)量檢測模塊,用于將所述優(yōu)化后融合特征向量通過解碼器中以得到解碼值,所述解碼值用于表示所述FISH圖像中所包含的循環(huán)腫瘤細(xì)胞的數(shù)量。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析儀,其特征在于,所述圖像特征提取模塊,用于:使用所述基于金字塔網(wǎng)絡(luò)的圖像特征提取器的各層在層的正向傳遞中分別對輸入數(shù)據(jù)進(jìn)行:
對所述輸入數(shù)據(jù)進(jìn)行卷積處理以得到卷積特征圖;
對所述卷積特征圖進(jìn)行基于特征矩陣的均值池化處理以得到池化特征圖;以及
對所述池化特征圖進(jìn)行非線性激活以得到激活特征圖;
其中,所述基于金字塔網(wǎng)絡(luò)的圖像特征提取器的最后一層的輸出為所述FISH特征圖,所述基于金字塔網(wǎng)絡(luò)的圖像特征提取器的第一層的輸入為所述FISH圖像。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析儀,其特征在于,所述上下文語義關(guān)聯(lián)編碼模塊,包括:
一維排列單元,用于將所述FISH特征向量的序列進(jìn)行一維排列以得到全局FISH特征向量;
自注意力單元,用于計算所述全局FISH特征向量與所述FISH特征向量的序列中各個FISH特征向量的轉(zhuǎn)置向量之間的乘積以得到多個自注意力關(guān)聯(lián)矩陣;
標(biāo)準(zhǔn)化單元,用于分別對所述多個自注意力關(guān)聯(lián)矩陣中各個自注意力關(guān)聯(lián)矩陣進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理以得到多個標(biāo)準(zhǔn)化后自注意力關(guān)聯(lián)矩陣;
激活單元,用于將所述多個標(biāo)準(zhǔn)化后自注意力關(guān)聯(lián)矩陣中各個標(biāo)準(zhǔn)化后自注意力關(guān)聯(lián)矩陣通過Softmax分類函數(shù)以得到多個概率值;以及
加權(quán)單元,用于分別以所述多個概率值中各個概率值作為權(quán)重對所述FISH特征向量的序列中各個FISH特征向量進(jìn)行加權(quán)以得到所述多個FISH圖像全局上下文語義關(guān)聯(lián)特征向量。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析儀,其特征在于,所述第一全連接模塊,包括:
圖像像素展開單元,用于將所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞預(yù)測圖展開為細(xì)胞預(yù)測一維像素特征向量;以及
全連接關(guān)聯(lián)編碼單元,用于使用所述第一全連接層對所述細(xì)胞預(yù)測一維像素特征向量進(jìn)行全連接編碼以得到所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞全連接特征向量。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析儀,其特征在于,所述特征融合模塊,用于:以如下融合公式融合所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞全連接特征向量和所述FISH深度特征向量以得到融合特征向量;
其中,所述融合公式為:
其中,為所述融合特征向量,為所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞全連接特征向量,為所述FISH深度特征向量,表示按位置加法,為用于控制所述循環(huán)腫瘤細(xì)胞全連接特征向量和所述FISH深度特征向量之間的平衡的加權(quán)參數(shù)。
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