[發(fā)明專利]檢測基因標(biāo)簽組表達(dá)量試劑在制備低級別膠質(zhì)瘤預(yù)后預(yù)測試劑中的應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202310288422.2
• 申請日: 2023-03-23
• 公開（公告）號: CN116298293A
• 公開（公告）日: 2023-06-23
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 曹科;張港華;陳愛艷
• 申請（專利權(quán)）人: 中南大學(xué)湘雅三醫(yī)院
• 主分類號: G01N33/574
• 分類號: G01N33/574;G01N33/68;G01N33/573;G16B25/10;G16H50/30
• 代理公司: 長沙優(yōu)企知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 43243
• 代理人: 劉佳芳

本發(fā)明提供了檢測基因標(biāo)簽組表達(dá)量試劑在制備低級別膠質(zhì)瘤預(yù)后預(yù)測試劑中的應(yīng)用，所述檢測基因標(biāo)簽組由CCT5,SMC4,KDELR2,WEE1,MAP3K1,IQGAP2,HOXD13,SLC43A3,CYP27B1,FAM133A,PIM1,APOBEC3C,CMYA5共12個基因標(biāo)簽組成。該模型可以預(yù)測低級別膠質(zhì)瘤患者的預(yù)后以及對替莫唑胺、免疫治療的響應(yīng)性。該模型相比臨床分期有更好的臨床預(yù)測價值，ROC高達(dá)0.9，并在多個驗(yàn)證組中具有相同的結(jié)果。因此，該模型在低級別腦膠質(zhì)瘤的個體化治療預(yù)測試劑中具有潛在臨床價值。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于腫瘤診斷標(biāo)志，具體涉及腫瘤診斷標(biāo)志在預(yù)測低級別膠質(zhì)瘤預(yù)后的預(yù)測試劑中的應(yīng)用。

背景技術(shù)

根據(jù)世界衛(wèi)生組織2016年基于組織學(xué)類型的分類，將彌漫性膠質(zhì)瘤分為低級別膠質(zhì)瘤（II級和III級，LGG）和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（IV級，GBM）。其中II級為星形細(xì)胞瘤，III級為少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤。LGG的生長速度比高級別膠質(zhì)瘤慢。它們占所有原發(fā)性腦腫瘤的10-20%。中位生存期在?4.7?至?9.8?年之間。雖然LGG的預(yù)后顯著優(yōu)于GBM，但低級別膠質(zhì)瘤極易復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移，在這些復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移性病例中，有45%-74%的LGG患者進(jìn)展為GBM。令人惋惜的是，現(xiàn)有的關(guān)鍵標(biāo)記基因狀態(tài)（包括IDH突變、1p19q共缺失和MGMT啟動子甲基化）并沒有在LGG表現(xiàn)出如GBM中重要的臨床意義。因此，應(yīng)建立新的分子分型和評分系統(tǒng)，以更精細(xì)地區(qū)分不同預(yù)后風(fēng)險和治療敏感性的人群，以便針對每一個LGG患者制定個體化的精準(zhǔn)診療方案。

LGG的標(biāo)準(zhǔn)治療，包括手術(shù)、放療和基于替莫唑胺（TMZ）或PCV方案的化療，然而，經(jīng)過這些治療，未能十分有效地預(yù)防腫瘤的復(fù)發(fā)和進(jìn)展。姚等人發(fā)現(xiàn)化療可提高新診斷的高危IDH?突變型LGG患者手術(shù)和放療后的總生存期，但是一部分接受替莫唑胺?（TMZ）?治療的患者會出現(xiàn)?TMZ?誘導(dǎo)的超突變復(fù)發(fā)性腫瘤。在大多數(shù)低級別膠質(zhì)放療可以為LGG患者帶來生存獲益。然而，放療的最佳時機(jī)存在爭議。目前尚不清楚是否在術(shù)后早期使用放療，或者是否應(yīng)延遲放療，直到腫瘤進(jìn)展發(fā)生。免疫療法的出現(xiàn)和改良對癌癥的治療產(chǎn)生了顯著影響。目前正在進(jìn)行許多免疫治療藥物的臨床研究，以確定其膠質(zhì)瘤治療中的安全性和有效性。只有GBM患者被納入臨床試驗(yàn)，但GBM患者使用納武單抗未顯示有任何生存獲益(NCT02550249)。腫瘤免疫微環(huán)境（TIME）在癌癥進(jìn)展和腫瘤免疫中起著重要作用，蘊(yùn)藏著可能改變免疫治療療效的關(guān)鍵因素，需要系統(tǒng)性地研究TIME在LGG中的作用，這可能帶給放化療抵抗的患者生存獲益的全新選擇。研究表明，IDH?突變不僅是膠質(zhì)瘤中定義疾病的生物標(biāo)志物和致癌驅(qū)動因素，而且還是一種新抗原和膠質(zhì)瘤免疫逃避的調(diào)節(jié)劑，且與免疫抑制表型相關(guān)。這提示我們免疫治療有可能影響LGG患者的治療格局。

失巢凋亡是細(xì)胞間和細(xì)胞與細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）粘附喪失或黏附不當(dāng)而啟動的特殊的程序性細(xì)胞凋亡，與幾個強(qiáng)制性的細(xì)胞過程有關(guān)，包括細(xì)胞遷移和侵襲。失巢凋亡的觸發(fā)主要通過兩種凋亡途徑的相互作用發(fā)生，即干擾線粒體或激活細(xì)胞表面死亡受體。癌細(xì)胞可以避免失巢凋亡，獲得失巢凋亡抗性，這允許他們在遠(yuǎn)處存活并定植，失巢凋亡是癌癥侵襲和轉(zhuǎn)移的重要機(jī)制。研究表明，在乳腺腫瘤發(fā)生模型中，E-鈣粘蛋白（CDH1）的缺失可促進(jìn)失巢凋亡抗性和血管生成增加，從而有助于轉(zhuǎn)移擴(kuò)散。此外，在子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞中，HGF通過PI3K-Akt途徑依賴性環(huán)氧合酶-2（COX-2）表達(dá)的上調(diào)誘導(dǎo)失巢凋亡抵抗.?此外，原肌球蛋白相關(guān)激酶B（TrkB）的過表達(dá)已在幾種腫瘤中被記錄，是失巢凋亡?的有效特異性抑制因子。在高度失巢凋亡敏感的大鼠腸上皮細(xì)胞中轉(zhuǎn)染TrkB通過激活PI3K-Akt途徑賦予失巢凋亡抗性。此外，在乳腺上皮細(xì)胞中，CDH1與EGFR和ERBB2協(xié)同作用保護(hù)細(xì)胞免受失巢凋亡。最新研究表明，基于gene?set?enrichment?analysis?(GSEA)篩選的27個失巢凋亡相關(guān)基因的GBM的失巢凋亡相關(guān)模型，可以預(yù)測患者預(yù)后和對免疫治療的反應(yīng)。然而，很少有研究系統(tǒng)地評估了失巢凋亡在LGG中的含義，盡管這些，失巢凋亡基因在腫瘤發(fā)生腫瘤侵襲和腫瘤浸潤中起著不可忽視的作用。我們假設(shè)LGG獲得失巢凋亡抗性，促進(jìn)自身的侵襲性轉(zhuǎn)移擴(kuò)散，這可能是LGG預(yù)后差，產(chǎn)生惡性表型的原因。

發(fā)明內(nèi)容