[發明專利]一種黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌病SNP分子標記及其應用在審
| 申請號： | 202310144302.5 | 申請日： | 2023-02-21 |
| 公開（公告）號： | CN116287300A | 公開（公告）日： | 2023-06-23 |
| 發明（設計）人： | 張殿昌;朱克誠;陳培賢;郭華陽;劉寶鎖;張楠 | 申請（專利權）人： | 中國水產科學研究院南海水產研究所 |
| 主分類號： | C12Q1/6888 | 分類號： | C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/6858;G16B20/30 |
| 代理公司： | 廣州知友專利商標代理有限公司 44104 | 代理人： | 宣國華;劉艷麗 |
| 地址： | 510300 廣東*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 黃鰭棘鯛抗 海豚 鏈球菌 snp 分子 標記 及其 應用 | ||
1.一種黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌病SNP分子標記，其特征是：所述SNP分子標記的序列如SEQ?ID?NO.1所示，所述SEQ?ID?NO.1所示序列自5’端開始的第201位的堿基N為T或G。
2.根據權利要求1所述黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌病相關SNP分子標記，其特征是：所述SNP分子標記的TT基因型個體比TG基因型個體更加抗感，即TT基因型個體的抗海豚鏈球菌病能力高于TG基因型個體。
3.一種用于擴增權利要求1所述黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌病相關SNP分子標記的引物，其特征是：所述引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的序列如SEQ?ID?NO：2所示，所述下游引物的序列如SEQ?ID?NO：3所示。
4.權利要求1所述SNP分子標記或權利要求3所述引物在鑒定抗海豚鏈球菌能力的黃鰭棘鯛中的應用。
5.權利要求1所述SNP分子標記或權利要求3所述引物在篩選具有抗海豚鏈球菌能力的黃鰭棘鯛中的應用。
6.權利要求1所述SNP分子標記或權利要求3所述引物在黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌優良品種早期篩選中的應用。
7.權利要求1中所述黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌病相關SNP分子標記的篩選方法，其特征是包括以下步驟：
(1)利用海豚鏈球菌感染1000條黃鰭棘鯛，剪取最先死亡的80條黃鰭棘鯛的尾鰭和最后死亡的80條黃鰭棘鯛的尾鰭，提取DNA并進行全基因組重測序；
(2)將上述測序結果與黃鰭棘鯛的參考基因組文件進行對比，獲得全基因組范圍的SNP；
(3)通過全基因組關聯分析GWAS，分析黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌性狀與SNP基因型間的相關性，確定黃鰭棘鯛抗海豚鏈球菌病顯著相關的SNP位點。
9.根據權利要求8所述檢測黃鰭棘鯛對海豚鏈球菌抗感性狀的方法，其特征是：步驟(3)中基因型為TT的黃鰭棘鯛個體對海豚鏈球菌更抗感。
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