[發明專利]化學組合物及其使用方法

在審

• 申請號: 202310011990.8
• 申請日: 2017-11-21
• 公開（公告）號: CN116334202A
• 公開（公告）日: 2023-06-27
• 發明（設計）人: M.黃;M.格雷戈里;D.金;D.L.杜納維;E.A.曼勞;J.M.比徹姆;R.卡菲佐夫;S.科魯康達;Y.鄧
• 申請（專利權）人: 納米線科技公司
• 主分類號: C12Q1/6874
• 分類號: C12Q1/6874;C12Q1/6869
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 李唐;張華

1.檢測樣品中的靶核酸的方法，其包括：

(1)使至少一種探針與樣品中的靶核酸雜交，

其中所述探針包含靶結合結構域和條形碼結構域，

其中所述靶結合結構域包含至少12個核苷酸并且能夠結合靶核酸，并且

其中所述條形碼結構域包含合成主鏈，所述條形碼結構域包含至少2個附接位置，每個附接位置包含至少一個附接區，所述附接區包含至少一個能夠由報告探針結合的核酸序列，其中所述至少2個附接位置的每一個具有不同的核酸序列，其中所述至少2個附接位置的序列特異性鑒定所述靶結合結構域；

(2)使包含第一可檢測標記和第二可檢測標記的第一報告探針與所述條形碼結構域的至少2個附接位置的第一附接位置雜交；

(3)鑒定與所述第一附接位置雜交的所述第一報告探針的所述第一可檢測標記和所述第二可檢測標記；

(4)去除與所述第一附接位置雜交的所述第一可檢測標記和所述第二可檢測標記；

(5)使包含第三可檢測標記和第四可檢測標記的第二報告探針與所述條形碼結構域的至少2個附接位置的第二附接位置雜交；

(6)鑒定與所述第二附接位置雜交的所述第二報告探針的所述第三可檢測標記和所述第四可檢測標記；

(7)基于所述第一可檢測標記、第二可檢測標記、第三可檢測標記和第四可檢測標記的身份，檢測所述樣品中的靶核酸。

2.檢測樣品中的靶核酸的方法，其包括：

(1)使至少一種探針與樣品中的靶核酸雜交，

其中所述探針包含靶結合結構域和條形碼結構域，

其中所述靶結合結構域包含至少12個核苷酸并且能夠結合靶核酸，并且

其中所述條形碼結構域包含合成主鏈，所述條形碼結構域包含至少4個附接位置，每個附接位置包含至少一個附接區，所述附接區包含至少一個能夠由報告探針結合的核酸序列，其中所述至少4個附接位置的每一個具有不同的核酸序列，其中所述至少4個附接位置的序列特異性鑒定所述靶結合結構域；

(2)使包含第一可檢測標記和第二可檢測標記的第一報告探針與所述條形碼結構域的至少4個附接位置的第一附接位置雜交；

(3)鑒定與所述第一附接位置雜交的所述第一報告探針的所述第一可檢測標記和所述第二可檢測標記；

(4)去除與所述第一附接位置雜交的所述第一可檢測標記和所述第二可檢測標記；

(5)使包含第三可檢測標記和第四可檢測標記的第二報告探針與所述條形碼結構域的至少4個附接位置的第二附接位置雜交；

(6)鑒定與所述第二附接位置雜交的所述第二報告探針的所述第三可檢測標記和所述第四可檢測標記；

(7)去除與所述第二附接位置雜交的所述第三可檢測標記和所述第四可檢測標記；

(8)使包含第五可檢測標記和第六可檢測標記的第三報告探針與所述條形碼結構域的至少4個附接位置的第三附接位置雜交；

(9)鑒定與所述第三附接位置雜交的所述第三報告探針的所述第五可檢測標記和所述第六可檢測標記；

(10)去除與所述第三附接位置雜交的所述第五可檢測標記和所述第六可檢測標記；

(11)使包含第七可檢測標記和第八可檢測標記的第四報告探針與所述條形碼結構域的至少4個附接位置的第四附接位置雜交；

(12)鑒定與所述第四附接位置雜交的所述第四報告探針的所述第七可檢測標記和所述第八可檢測標記；和

(13)基于所述第一可檢測標記、第二可檢測標記、第三可檢測標記、第四可檢測標記、第五可檢測標記、第六可檢測標記、第七可檢測標記和第八可檢測標記的身份，檢測所述樣品中的靶核酸。

3.權利要求1或權利要求2的方法，其中所述報告探針中的每一個包含與至少6個二級核酸分子雜交的一級核酸分子，

其中多個二級核酸分子中的每一個與至少5個三級核酸分子雜交，

其中所述三級核酸分子中的每一個包含至少一種可檢測標記。

4.權利要求1或權利要求2的方法，其中每一報告探針進一步包含至少一種可切割接頭。

5.權利要求4的方法，其中所述至少一種可切割接頭是光可切割接頭。

6.權利要求3的方法，其中每一報告探針的一級核酸分子包含至少一種可切割接頭。