[發明專利]多核糖核苷酸核苷轉移酶1抑制劑的制藥應用

有效

• 申請號: 202210478467.1
• 申請日: 2022-05-05
• 公開（公告）號: CN114712363B
• 公開（公告）日: 2023-05-26
• 發明（設計）人: 梁宏偉;曾科;黃海;王嘉凡
• 申請（專利權）人: 中國藥科大學
• 主分類號: A61K31/519
• 分類號: A61K31/519;A61P35/00
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 傅婷婷;徐冬濤

本發明公開了多核糖核苷酸核苷轉移酶1抑制劑的制藥應用。本發明篩選出抑制PNPT1蛋白功能的活性小分子，并且胞質內dsRNAs的水平來表征PNPT1的活性小分子的有效性。通過胞質中dsRNAs的JS2染色，在活性小分子中篩選出化合物chemdiv?ID：G756?0627。通過Western?Blot考察活性小分子能抑制PNPT1的表達，CCK?8和Annexin?V/PI染色檢測細胞增殖和凋亡；另外，通過A549移植瘤裸鼠上驗證，小鼠給予活性小分子NO.G756?0627能有效地抑制腫瘤的生長，進而達到抗腫瘤的效果。

技術領域

本發明屬于生物醫藥技術領域，特別是涉及多核糖核苷酸核苷轉移酶1抑制劑的制藥應用。

背景技術

肺癌是全球發病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一，非小細胞肺癌(NSCLC)是最常見的肺癌類型，約占所有肺癌的80％，超過半數的患者在發現時已處于中晚期，5年生存率很低[The?impact?of?reclassifying?cancers?of?unspecified?histology?oninternational?differences?in?survival?for?small?cell?and?non-small?cell?lungcancer(ICBP?SurvMark-2project).Int?J?Cancer?2021May?01]。盡管近年來，隨著對NSCLC發病機制的研究，NSCLC的診斷方法和治療手段已經取得了長足的進步。

腫瘤細胞由于攜帶多個突變基因，并長期處于低氧、營養匱乏、低PH等環境脅迫下，在其生長過程中會由于mRNA的錯誤剪切和環境壓力等原因在線粒體、細胞核等內產生大量的dsRNAs。這些dsRNAs就像“定時炸彈”一樣，一旦不能降解而被釋放到細胞質中積累起來，dsRNAs就會和細胞質內的PKR等dsRNA模式識別受體結合，持續激活整合應激反應，導致腫瘤細胞凋亡。

PNPT1是一種高度保守的多核苷酸磷酸化酶，具有從3’端到5’端降解RNA的核糖核酸外切酶活性。幾乎所有物種的PNPT1蛋白都具有5個保守的結構域,包括兩個RNase?PH結構域，一個S1?RNA結合結構域,一個K同源結構域和一個α螺旋結構域。此外，在人等哺乳動物表達的PNPT1的N端還有一個亞細胞定位于線粒體所必需的線粒體靶向序列(MTS)。在正常細胞中，PNPT1在MTS的引導下進入線粒體，并在線粒體膜間隙形成三聚體，使6個RNasePH結構域組成一個環狀的催化作用中心通道，在解旋酶SUV3的協助下將線粒體產生的dsRNAs經此通道送達活性作用位點，從而被快速降解,以避免線粒體產生的dsRNAs釋放到細胞質內，激活dsRNAs介導的應激反應。目前，對PNPT1在腫瘤中的研究甚少，市面上也沒有PNPT1的抑制劑更未見將PNPT1抑制劑用于抗腫瘤的相關報道。

發明內容

本發明的目的是針對現有技術的上述不足，提供一種化合物在制備PNPT1抑制劑中的應用。

本發明的另一目的是提供該化合物在制備抗腫瘤藥物中的應用。

本發明的目的可通過以下技術方案實現：

本申請所述的一種PNPT1抑制劑，序號NO.G756-0627,其結構如下所示：

該PNPT1抑制劑基于PNPT1的晶體復合物結構從PDB數據庫下載獲得(PDB?ID:3u1k)；定義其單體形式和三體形式中共結晶小分子位點為分子對接活性位點；使用薛定諤軟件包中Glide對接算法對ChemDiv商用化合物數據庫進行虛擬篩選(準備后包括約250萬化合物)；篩選后對排名前1000化合物分子進行基于Lipinski類藥規則、聚類分析等篩選，獲得排序前200多樣性分子進行后續實驗檢測，其中單體和三體小分子各100個。

該化合物能抑制腫瘤細胞增殖，誘導細胞凋亡，同時能使胞質中雙鏈RNA(dsRNAs)累積。