[發(fā)明專利]基于質(zhì)譜流式技術(shù)的胰腺癌篩查模型的建立方法

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202210467183.2
• 申請(qǐng)日: 2022-04-27
• 公開（公告）號(hào): CN114936449A
• 公開（公告）日: 2022-08-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 梁廷波;章琦;葉茅
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院
• 主分類號(hào): G06F30/20
• 分類號(hào): G06F30/20;G06K9/62;G16H50/70
• 代理公司: 北京盛凡佳華專利代理事務(wù)所(普通合伙) 11947
• 代理人: 張歡

本發(fā)明公開了一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的胰腺癌篩查模型的建立方法，涉及醫(yī)療領(lǐng)域。本發(fā)明包括以下步驟：用Ficoll分離法處理外周血樣獲得PBMC，并對(duì)PBMC進(jìn)行質(zhì)譜流式分析，獲得流式分析數(shù)據(jù)集；通過隨機(jī)森林算法處理流式分析數(shù)據(jù)集，以細(xì)胞表面標(biāo)志物陰性比例和亞群比例作為建模特征，進(jìn)行特征篩選，得到胰腺癌篩查模型。本發(fā)明可用于胰腺癌的篩查及輔助診斷。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及醫(yī)療領(lǐng)域，更具體的說是涉及一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的肝癌篩查模型的建立方法。

背景技術(shù)

胰腺癌起病隱匿，進(jìn)展迅速，相當(dāng)比例的患者在初診時(shí)就失去了手術(shù)根治性切除的機(jī)會(huì)，預(yù)后并不樂觀。有報(bào)道，腫瘤局限于導(dǎo)管上皮且小于1cm的患者術(shù)后5年生存率可達(dá)100％。然而，只有15-20％的患者在首次診斷時(shí)有機(jī)會(huì)接受治療性手術(shù)。目前用于臨床診斷胰腺癌的生物標(biāo)志物是糖類抗原CA19-9。但Lewis抗原陰性的人群很少或不分泌CA19-9。且部分膽道梗阻、炎癥、胰腺炎等胃腸道腫瘤患者也伴有CA19-9水平升高，導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果。因此，仍迫切需要開發(fā)新的有效的胰腺癌篩查生物標(biāo)志物。

新興的液體活檢主要涉及循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)、細(xì)胞游離DNA (cfDNA)、細(xì)胞游離rna(如mRNAs、microRNAs)、循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)和外泌體的檢測(cè)。這些策略在腫瘤檢測(cè)領(lǐng)域顯示了其優(yōu)勢(shì)和潛力。然而，目前還沒有被廣泛接受的液體活檢方法來檢測(cè)腫瘤。

免疫系統(tǒng)與人體的健康狀態(tài)有著極為緊密的聯(lián)系。個(gè)體免疫系統(tǒng)水平可影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后。近年來，新出現(xiàn)的研究表明，腫瘤進(jìn)展過程中個(gè)體免疫系統(tǒng)發(fā)生了系統(tǒng)性的變化，其中部分變化可能反映在外周血中。既往研究綜述腫瘤負(fù)荷宿主的造血功能廣泛受損，外周血中不成熟的中性粒細(xì)胞和單核細(xì)胞異常擴(kuò)張，部分轉(zhuǎn)移至腫瘤微環(huán)境，導(dǎo)致局部免疫抑制。因此通過全面細(xì)致的監(jiān)測(cè)人體外周免疫狀態(tài)或能為疾病的預(yù)防、診斷和治療提供極大的幫助。近年來，質(zhì)譜流式技術(shù)逐漸完善，可以高維度得分析人體基礎(chǔ)免疫狀態(tài)，獲得全方位的免疫細(xì)胞構(gòu)成、表型和功能信息。

發(fā)明內(nèi)容

有鑒于此，本發(fā)明提供了一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的肝癌篩查模型的建立方法，可用于胰腺癌的篩查及輔助診斷。

為了實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采用如下技術(shù)方案：

一種基于質(zhì)譜流式技術(shù)的胰腺癌篩查模型的建立方法，包括以下步驟：

用Ficoll分離法處理外周血樣獲得PBMC，并對(duì)PBMC進(jìn)行質(zhì)譜流式分析，獲得流式分析數(shù)據(jù)集；

通過隨機(jī)森林算法處理流式分析數(shù)據(jù)集，以細(xì)胞表面標(biāo)志物陰性比例和亞群比例作為建模特征，進(jìn)行特征篩選，得到胰腺癌篩查模型。

可選的，還包括篩選出1個(gè)細(xì)胞表面標(biāo)志物CD33和18個(gè)免疫細(xì)胞亞群包括CD14-CD33-CD3+CD8+CD27-、CD14-CD33-CD3+CD8+CD85j+、 CD14-CD33-CD3-CD19-CD20-CD56+CD94-、CD3-CD19-CD56-HLA-DR-、 CD14-CD33-CD3+CD4+、CD14-CD33-CD3+CD4+HLA-DR-CD38+、 CD14-CD33-CD3+CD8+、CD14-CD33-CD3+CD8+HLA-DR+、 CD14-CD33-CD3+CD8+CCR7+CD45RA+、 CD14-CD33-CD3+CD8+HLA-DR-CD38+、 CD14-CD33-CD3+CD8+HLA-DR+CD38+、CD14-CD33-CD3+HLA-DR+、 CD14-CD33-CD3+CD56+、CD14-CD33-CD19+IgD+CD27+、 CD14-CD33-CD3-CD56+CD16+HLA-DR+、CD3-CD19-CD14+、 CD14-CD16+HLA-DR+、CD3-CD19-CD56-HLA-DR-CD33+CD11b+。

可選的，還包括采用內(nèi)部驗(yàn)證集、外部驗(yàn)證集驗(yàn)證模型。

可選的，還包括結(jié)合受試者血清CA19-9，構(gòu)建整合胰腺癌篩查模型。