[發明專利]一種凡納濱對蝦抗副溶血弧菌感染性狀相關SNP標記及其應用

在審

• 申請號: 202210293025.X
• 申請日: 2022-03-23
• 公開（公告）號: CN114540509A
• 公開（公告）日: 2022-05-27
• 發明（設計）人: 胡超群;張鑫;陳廷;任春華;羅鵬;王艷紅;江曉
• 申請（專利權）人: 中國科學院南海海洋研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001
• 代理人: 朱聰聰;劉明星

1.一種與凡納濱對蝦抗副溶血弧菌感染性狀相關的SNP分子標記，其特征在于，其位于凡納濱對蝦C型凝集素基因序列編碼區的416bp位點處，突變類型為T/T純合型、T/A雜合型和A/A純合型；

所述凡納濱對蝦C型凝集素基因序列編碼區的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

2.一種凡納濱對蝦抗副溶血弧菌性狀相關的SNP標記的檢測引物，其特征在于，包括以下引物：

LvCTL-SNP-F：5’-GTGAGGTCTTGCGCAAATATC-3’，

LvCTL-SNP-R：5’-CCTCGTGTATCTGAATAAGGGC-3’。

3.一種含有權利要求2所述檢測引物的試劑盒。

4.權利要求1所述的SNP分子標記、權利要求2所述的檢測引物或權利要求3所述的試劑盒在鑒定或選育抗副溶血弧菌凡納濱對蝦中的應用。

5.根據權利要求4所述的應用，其特征在于，所述的選育抗副溶血弧菌凡納濱對蝦，包括以下步驟：

a.從凡納濱對蝦親蝦游泳足提取基因組DNA；

b.利用LvCTL-SNP-F和LvCTL-SNP-R引物對分別PCR擴增凡納濱對蝦個體的DNA；

c.對步驟b獲得的擴增產物進行測序，確定權利要求1所述的SNP標記的基因型，選擇A/A純合型的雌蝦和雄蝦作為親本，以進行抗副溶血弧菌性狀凡納濱對蝦的選育。

6.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，所述的PCR擴增，其PCR體系及其終濃度組成如下：PCR Buffer 1×、高保真PCR酶0.02U/μL、dNTP Mixture各200μM、MgCl₂2 mM、LvCTL-SNP-F 0.2μM、LvCTL-SNP-R 0.2μM、蝦基因組DNA 0.25ng/μL，其余由無菌雙蒸水補足至25μL。

7.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，所述的PCR擴增，其反應程序為：95℃預變性5分鐘；95℃變性30秒，60℃退火30秒，72℃延伸30秒，共35個循環；72℃再延伸6分鐘。